Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06100
- Subject:
- XM_006516392.3
- Aligned Length:
- 1365
- Identities:
- 1209
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGCTGTCCCGATCCCGCTGTGTGTCTCGGGCGTTCAGCCGCTCGCTCTCCGCCTTCCAGAAGGGGAACTGCCC 74
|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGTCCCGGTCACGCTGCGTGTCCCGGGCGTTCAGCCGCTCGCTTTCTGCCTTCCAGAAGGGGAACTGCCC 74
Query 75 TCTAGGGAGACGTTCCCTGCCTGGGGTCTCCTTATGCCAGGGACCAGGTTACCCTAACAGCAGGAAGGTTGTCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||.|||||||.|.||||
Sbjct 75 TCTAGGGAGACGTTCCCTGCCTGGGGTCTCCTTATGTCGGGGACCAGGTTACCCTGACAACAGGAAGATGGTCA 148
Query 149 TTAACA---ACAGTGTCTTCAGTGTTCGCTTTTTCAGAACTACAGCTGTATGCAAGGATGACTTGGTTACAGTC 219
|||||| ..||.||||||||.||||||||.|||..|||.||.|||||.||||||.||||..||.|.||||||
Sbjct 149 TTAACAGTGGTAGCGTCTTCAGGGTTCGCTTCTTCCAAACCACGGCTGTGTGCAAGAATGATGTGATAACAGTC 222
Query 220 AAAACCCCAGCGTTTGCAGAATCTGTCACAGAGGGAGATGTCAGGTGGGAGAAAGCTGTTGGAGACACAGTTGC 293
.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||
Sbjct 223 CAAACCCCAGCGTTTGCAGAGTCTGTCACAGAGGGAGATGTCAGGTGGGAGAAAGCTGTTGGAGATGCGGTTGC 296
Query 294 AGAAGATGAAGTGGTTTGTGAGATTGAAACTGACAAGACATCTGTGCAGGTTCCATCACCAGCAAATGGCGTGA 367
|||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.|.|
Sbjct 297 AGAAGATGAAGTGGTGTGTGAGATTGAGACAGACAAGACTTCTGTGCAGGTTCCGTCGCCAGCAAATGGCATCA 370
Query 368 TTGAAGCTCTTTTGGTACCTGATGGGGGAAAAGTCGAAGGAGGCACTCCACTTTTCACACTCAGGAAAACTGGT 441
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||| |
Sbjct 371 TTGAAGCTCTTTTGGTACCCGATGGGGGCAAAGTTGAAGGAGGAACTCCTCTGTTCACACTCAGGAAAAC---T 441
Query 442 GCTGCTCCTGCTAAGGCCAAGCCGGCTGAAGCTCCTGCTGCTGCAGCCCCAAAAGCAGAACCTACAGCA---GC 512
||||||||||||||||||||.||.||||||.||| |||||.||||||..||||||||.||..||||| ||
Sbjct 442 GCTGCTCCTGCTAAGGCCAAACCAGCTGAAACTC---CTGCTCCAGCCCACAAAGCAGAGCCCGCAGCACCGGC 512
Query 513 GGCAGTTCCTCCCCCTGCAGCACCCATACCCACTCAGATGCCACCGGTGCCCTCGCCCTCACAACCTCCTTCTG 586
|||...|||||||||.||||||||..|.|.|||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||.
Sbjct 513 GGCCCCTCCTCCCCCCGCAGCACCTGTGCTCACTCAGATGCCACCAGTGCCCTCACCCTCACAGCCTCCTTCTA 586
Query 587 GCAAACCTGTGTCTGCAGTAAAACCCACTGTTGCCCCACCACTAGCTGAGCCAGGAGCTGGCAAAGGTCTGCGT 660
|||||||.|||||||||.||||||||||||.||||||.|||||.||||||.|||||||||..||||||||||||
Sbjct 587 GCAAACCAGTGTCTGCAATAAAACCCACTGCTGCCCCTCCACTGGCTGAGGCAGGAGCTGCTAAAGGTCTGCGT 660
Query 661 TCAGAACATCGGGAGAAAATGAACAGGATGCGGCAGCGCATTGCTCAGCGTCTGAAGGAGGCCCAGAATACATG 734
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 661 TCAGAACATCGGGAGAAAATGAACAGGATGCGGCAGCGCATCGCCCAGCGTCTGAAGGAAGCCCAGAACACGTG 734
Query 735 TGCAATGCTGACAACTTTTAATGAGATTGACATGAGTAACATCCAGGAGATGAGGGCTCGGCACAAAGAGGCTT 808
||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 735 TGCAATGCTGACGACTTTCAATGAGGTTGACATGAGTAACATACAAGAGATGAGAGCTCGGCACAAGGATGCTT 808
Query 809 TTTTGAAGAAACATAACCTCAAACTAGGCTTCATGTCGGCATTTGTGAAGGCCTCAGCCTTTGCCTTGCAGGAA 882
|..||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 809 TCCTGAAAAAACATAACCTCAAATTAGGCTTCATGTCAGCATTTGTGAAGGCCTCGGCGTTCGCCTTGCAGGAG 882
Query 883 CAGCCTGTTGTAAATGCAGTGATTGACGACACAACCAAAGAGGTGGTGTATAGGGATTATATTGACATCAGTGT 956
||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 883 CAGCCTGTTGTAAATGCAGTGATTGATGATGCAACCAAGGAAGTGGTGTATAGAGATTATATTGACATCAGTGT 956
Query 957 TGCAGTGGCCACCCCACGGGGTCTGGTGGTTCCAGTCATCAGGAATGTGGAAGCTATGAATTTTGCAGATATTG 1030
||||||.||.|||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||||
Sbjct 957 TGCAGTTGCTACCCCGAGGGGTCTCGTGGTTCCTGTCATCAGGAATGTGGAAACTATGAACTATGCAGATATTG 1030
Query 1031 AACGGACCATCACTGAACTGGGAGAGAAGGCCCGAAAGAATGAACTTGCCATTGAAGATATGGATGGCGGTACC 1104
||||||||||.|.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1031 AACGGACCATTAATGAACTAGGAGAGAAGGCCCGGAAGAATGAACTTGCCATTGAAGATATGGATGGTGGTACC 1104
Query 1105 TTCACCATTAGCAATGGAGGCGTTTTTGGCTCGCTCTTTGGAACACCCATTATCAACCCCCCTCAGTCTGCCAT 1178
||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1105 TTCACCATCAGCAACGGAGGAGTTTTTGGCTCACTTTTTGGAACACCCATTATCAACCCCCCTCAATCTGCCAT 1178
Query 1179 CCTGGGGATGCATGGCATCTTTGACAGGCCAGTGGCTATAGGAGGCAAGGTAGAGGTGCGGCCCATGATGTACG 1252
||||||.|||||.|.|||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1179 CCTGGGCATGCACGCCATCTTTGACAGGCCTGTGGCTGTGGGAGGCAAGGTGGAAGTTCGACCTATGATGTATG 1252
Query 1253 TGGCACTGACCTATGATCACCGGCTGATTGATGGCAGAGAGGCTGTGACTTTCCTCCGCAAAATCAAGGCAGCG 1326
|.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1253 TAGCCCTGACCTATGACCACCGGCTGATTGATGGCAGAGAGGCTGTGACTTTCCTCCGAAAAATCAAGGCAGCA 1326
Query 1327 GTAGAGGATCCCAGAGTCCTCCTCCTGGATCTT 1359
|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1327 GTAGAAGATCCAAGAGTCCTCCTCCTAGACCTT 1359