Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06106
• Subject: XM_006497660.2
• Aligned Length: 2555
• Identities: 2331
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGGCAACCGCGGCATGGAAGATCTCATCCCGCTGGTCAACCGGCTGCAAGACGCCTTCTCTGCCATCGGCCA  74
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAACCGCGGCATGGAAGACCTCATCCCGCTGGTTAACCGGTTACAGGACGCCTTCTCCGCCATCGGCCA  74

Query   75  GAACGCGGACCTCGACCTGCCGCAGATCGCTGTGGTGGGCGGCCAGAGCGCCGGCAAGAGCTCGGTGCTCGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  GAACGCGGACCTCGACCTGCCGCAGATCGCCGTGGTAGGCGGCCAGAGCGCCGGCAAGAGCTCGGTGCTGGAGA  148

Query  149  ATTTCGTAGGCAGGGACTTCTTGCCTCGAGGATCTGGCATTGTCACCCGACGTCCCCTGGTCTTGCAGCTGGTC  222
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.
Sbjct  149  ATTTCGTGGGCAGGGACTTCTTGCCCCGAGGATCTGGCATCGTCACCCGGCGTCCCCTGGTCCTGCAGCTGGTT  222

Query  223  AATGCAACCACAGAATATGCCGAGTTCCTGCACTGCAAGGGAAAGAAATTCACCGACTTCGAGGAGGTGCGCCT  296
            |||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATTCTACCACAGAATATGCCGAGTTCCTGCACTGCAAGGGGAAGAAATTCACCGACTTCGAGGAGGTGCGCCT  296

Query  297  TGAGATCGAGGCCGAGACCGACAGGGTCACCGGCACCAACAAGGGCATCTCGCCGGTGCCTATCAACCTCCGCG  370
            .|||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  297  GGAGATCGAGGCTGAGACCGATCGAGTCACCGGCACCAACAAGGGCATTTCGCCAGTGCCCATCAACCTGCGGG  370

Query  371  TCTACTCGCCGCACGTGCTGAACCTGACCCTGGTGGACCTGCCCGGAATGACCAAGGTCCCGGTGGGGGACCAA  444
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  TCTACTCGCCCCATGTGCTGAACCTGACTCTAGTGGACCTGCCAGGAATGACCAAGGTCCCAGTTGGGGACCAA  444

Query  445  CCTCCCGACATCGAGTTCCAGATCCGAGACATGCTTATGCAGTTTGTCACCAAGGAGAACTGCCTCATCCTGGC  518
            |||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CCTCCTGATATCGAGTTCCAGATCCGGGACATGCTTATGCAGTTCGTCACTAAGGAGAACTGCCTTATCCTGGC  518

Query  519  CGTGTCCCCCGCCAACTCTGACCTGGCCAATTCTGACGCCCTCAAGGTCGCCAAGGAGGTGGACCCCCAGGGCC  592
            .||||||||.||||||||.||..|||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGTGTCCCCTGCCAACTCGGATTTGGCCAACTCTGATGCCCTCAAGATCGCTAAGGAGGTGGACCCCCAGGGTC  592

Query  593  AGCGCACCATCGGGGTCATCACCAAGCTGGACCTGATGGACGAGGGCACAGATGCCCGTGATGTGCTGGAGAAC  666
            ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  593  AGCGCACCATTGGGGTCATCACCAAGTTGGACCTGATGGACGAGGGCACAGATGCGCGGGACGTGCTAGAGAAC  666

Query  667  AAGCTGCTCCCCCTGCGCAGAGGCTACATTGGAGTGGTGAACCGGAGCCAGAAGGACATTGATGGCAAGAAGGA  740
            |||||||||||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  667  AAGCTGCTCCCTTTGCGCAGAGGTTACATCGGCGTGGTGAACCGGAGCCAGAAGGACATAGACGGCAAGAAGGA  740

Query  741  CATTACCGCCGCCTTGGCTGCTGAACGAAAGTTCTTCCTCTCCCATCCATCTTATCGCCACTTGGCTGACCGTA  814
            |||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  741  CATCACAGCCGCCTTGGCTGCAGAGCGCAAATTCTTCCTCTCTCACCCATCCTACCGCCACTTGGCTGACCGCA  814

Query  815  TGGGCACGCCCTACCTGCAGAAGGTCCTCAATCAGCAACTGACGAACCACATCCGGGACACACTGCCGGGGCTG  888
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  815  TGGGCACACCCTACCTGCAGAAGGTCCTCAATCAGCAATTGACCAACCACATCCGGGACACACTGCCGGGACTT  888

Query  889  CGGAACAAGCTGCAGAGCCAGCTACTGTCCATTGAGAAGGAGGTGGAGGAATACAAGAACTTCCGCCCTGATGA  962
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  CGGAACAAGCTGCAGAGCCAGCTGCTGTCCATTGAGAAGGAGGTGGACGAGTACAAGAACTTCCGACCGGATGA  962

Query  963  CCCAGCTCGCAAGACCAAGGCCCTGCTGCAGATGGTCCAGCAGTTTGCCGTAGACTTTGAGAAGCGCATTGAGG  1036
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  963  CCCAGCGCGCAAGACCAAGGCCCTGCTGCAGATGGTCCAGCAGTTTGCAGTGGACTTCGAGAAGCGCATCGAGG  1036

Query 1037  GCTCAGGAGATCAGATCGACACCTACGAACTGTCAGGGGGAGCCCGCATTAACCGAATCTTCCACGAGCGCTTC  1110
            |.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1037  GTTCTGGAGACCAGATTGACACTTACGAGCTGTCAGGTGGAGCCCGCATTAACCGGATCTTCCATGAACGCTTC  1110

Query 1111  CCTTTCGAGCTGGTCAAGATGGAGTTTGATGAGAAGGAACTCCGAAGGGAGATCAGCTATGCTATCAAGAATAT  1184
            ||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  CCCTTTGAGCTGGTTAAGATGGAGTTTGATGAGAAGGAACTGCGAAGGGAGATCAGCTATGCTATCAAAAATAT  1184

Query 1185  CCATGGCATTAGAACGGGGCTGTTTACCCCAGACATGGCCTTTGAGACCATTGTGAAAAAGCAGGTGAAGAAGA  1258
            |||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||.|.||.|||||..|||..|||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1185  CCATGGCATCAGGACGGGCCTCTTCACACCTGACCTCGCTTTTGAAGCCACAGTGAAAAAGCAGGTGCAGAAGC  1258

Query 1259  TCCGAGAACCGTGTCTCAAGTGTGTGGACATGGTTATCTCGGAGCTAA--TCAGCACCGTTAGACAGTGCACCA  1330
            ||..|||.||..||.|||||||||||||||||||..||...||.||.|  ||  ||||.|.|||.||||.|...
Sbjct 1259  TCAAAGAGCCCAGTATCAAGTGTGTGGACATGGTAGTCAGTGAACTCACGTC--CACCATCAGAAAGTGTAGTG  1330

Query 1331  AGAAGCTCCAGCAGTACCCGCGGCTACGGGAGGAGATGGAGCGCATCGTGACCACCCACATCCGGGAGCGCGAG  1404
            |.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1331  AAAAGCTGCAGCAATACCCGCGTCTGCGGGAGGAGATGGAGCGAATTGTGACCACCCACATCCGGGAACGTGAG  1404

Query 1405  GGCCGCACTAAGGAGCAGGTCATGCTTCTCATCGATATCGAGCTGGCTTACATGAACACCAACCATGAGGACTT  1478
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1405  GGCCGCACCAAGGAGCAGGTCATGCTTCTCATCGACATTGAGCTGGCTTACATGAATACCAACCACGAAGACTT  1478

Query 1479  CATAGGCTTTGCCAATGCTCAGCAGAGGAGCAACCAGATGAACAAGAAGAAGACTTCAGGGAACCAGGATGAGA  1552
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  CATAGGCTTTGCCAATGCTCAGCAGAGAAGCAACCAGATGAACAAGAAGAAGACTTCAGGGAACCAGGATGAGA  1552

Query 1553  TTCTGGTCATCCGCAAGGGCTGGCTGACTATCAATAATATTGGCATCATGAAAGGGGGCTCCAAGGAGTACTGG  1626
            ||||||||||.||.|||||.|||.||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1553  TTCTGGTCATTCGAAAGGGGTGGTTGACCATCAACAACATCGGCATCATGAAGGGAGGCTCCAAGGAGTACTGG  1626

Query 1627  TTTGTGCTGACTGCTGAGAATCTGTCCTGGTACAAGGATTATGAGGAGAAAGAGAAGAAATACATGCTGTCTGT  1700
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1627  TTTGTGCTGACTGCTGAGAATCTGTCCTGGTACAAGGATGATGAGGAGAAAGAGAAGAAGTACATGCTGTCTGT  1700

Query 1701  GGACAACCTCAAGCTGCGGGACGTGGAGAAGGGCTTTATGTCGAGCAAGCATATCTTTGCCCTCTTTAACACGG  1774
            ||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1701  GGACAATCTGAAGCTGCGTGATGTGGAGAAGGGCTTCATGTCAAGCAAGCATATTTTTGCCCTCTTCAACACAG  1774

Query 1775  AGCAGAGGAATGTCTACAAGGATTATCGGCAGCTGGAGCTAGCCTGTGAGACACAGGAGGAGGTGGACAGCTGG  1848
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1775  AGCAGAGGAATGTCTACAAGGATTACCGGCAGCTGGAACTGGCCTGTGAGACACAGGAGGAGGTGGACAGTTGG  1848

Query 1849  AAGGCCTCCTTCCTGAGGGCTGGCGTGTACCCTGAGCGTGTTGGGGACAAAGAGAAAGCCAGCGAGACCGAGGA  1922
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1849  AAGGCTTCCTTCCTGAGGGCTGGCGTGTACCCTGAGCGTGTTGGGGACAAAGAGAAAGCCAGTGAGACCGAGGA  1922

Query 1923  GAATGGCTCCGACAGCTTCATGCATTCCATGGACCCACAGCTGGAACGGCAAGTGGAGACCATCCGGAATCTTG  1996
            |||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1923  GAACGGCTCTGACAGCTTCATGCACTCGATGGACCCTCAGCTGGAGCGCCAGGTGGAGACCATCCGGAACCTGG  1996

Query 1997  TGGACTCATACATGGCCATTGTCAACAAGACCGTGAGGGACCTCATGCCCAAGACCATCATGCACCTCATGATT  2070
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1997  TAGACTCGTACATGGCCATTGTCAACAAGACTGTGCGGGACCTCATGCCCAAGACCATCATGCACCTCATGATC  2070

Query 2071  AACAATACCAAGGAGTTCATCTTCTCGGAGCTGCTGGCCAACCTGTACTCGTGTGGGGACCAGAACACGCTGAT  2144
            |||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 2071  AACAACACCAAGGAGTTTATCTTCTCTGAGCTGCTGGCCAACCTGTACTCTTGCGGGGACCAGAACACACTGAT  2144

Query 2145  GGAGGAGTCGGCGGAGCAGGCACAGCGGCGCGACGAGATGCTGCGCATGTACCACGCACTGAAGGAGGCGCTCA  2218
            |||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145  GGAAGAATCGGCCGAGCAGGCTCAGCGGCGCGACGAGATGCTGCGCATGTACCACGCACTGAAGGAGGCGCTCA  2218

Query 2219  GCATCATCGGCGACATCAACACGACCACCGTCAGCACGCCCATGCCCCCGCCCGTGGACGACTCCTGGCTGCAG  2292
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219  GTATTATCGGCGACATCAACACGACCACCGTCAGCACGCCCATGCCCCCGCCCGTGGACGACTCCTGGCTGCAG  2292

Query 2293  GTGCAGAGCGTACCGGCCGGACGCAGGTCGCCCACGTCCAGCCCCACGCCGCAGCGCCGAGCCCCCGCCGTGCC  2366
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293  GTGCAGAGCGTACCGGCCGGACGCAGATCGCCCACGTCCAGCCCCACGCCGCAGCGCCGAGCCCCCGCCGTGCC  2366

Query 2367  CCCAGCCCGGCCCGGGTCGCGGGGCCCTGCTCCTGGGCCTCCGCCTGCTGGGTCCGCCCTGGGGGGGGCGCCCC  2440
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367  CCCAGCCCGGCCCGGATCGCGGGGCCCTGCTCCTGGGCCTCCGCCTGCTGGATCCGCCCTGGGGGGGGCGCCCC  2440

Query 2441  CCGTGCCCTCCAGGCCGGGGGCTTCCCCTGACCCTTTCGGCCCTCCCCCTCAGGTGCCCTCGCGCCCCAACCGC  2514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441  CCGTGCCCTCCAGGCCGGGGGCTTCCCCTGACCCCTTTGGCCCCCCTCCCCAGGTGCCCTCGCGCCCCAACCGC  2514

Query 2515  GCCCCGCCCGGGGTCCCCAGAATCACTATCAGTGACCCC  2553
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515  GCCCCGCCTGGGGTCCCCAGAATCACTATCAGTGACCCC  2553