Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06160
• Subject: NM_001201483.4
• Aligned Length: 1302
• Identities: 1022
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  ATGTCTATTCTCAAGATCCATGCCAGGGAGATCTTTGACTCTCGCGGGAATCCCACTGTTGAGGTTGATCTCTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CACCTCAAAAGGTCTCTTCAGAGCTGCTGTGCCCAGTGGTGCTTCAACTGGTATCTATGAGGCCCTAGAGCTCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGGACAATGATAAGACTCGCTATATGGGGAAGGGTGTCTCAAAGGCTGTTGAGCACATCAATAAAACTATTGCG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTGCCCTGGTTAGCAAGAAACTGAACGTCACAGAACAAGAGAAGATTGACAAACTGATGATCGAGATGGATGG  296
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGATCGAGATGGATGG  17

Query  297  AACAGAAAATAAATCTAAGTTTGGTGCGAACGCCATTCTGGGGGTGTCCCTTGCCGTCTGCAAAGCTGGTGCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  AACAGAAAATAAATCTAAGTTTGGTGCGAACGCCATTCTGGGGGTGTCCCTTGCCGTCTGCAAAGCTGGTGCCG  91

Query  371  TTGAGAAGGGGGTCCCCCTGTACCGCCACATCGCTGACTTGGCTGGCAACTCTGAAGTCATCCTGCCAGTCCCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  TTGAGAAGGGGGTCCCCCTGTACCGCCACATCGCTGACTTGGCTGGCAACTCTGAAGTCATCCTGCCAGTCCCG  165

Query  445  GCGTTCAATGTCATCAATGGCGGTTCTCATGCTGGCAACAAGCTGGCCATGCAGGAGTTCATGATCCTCCCAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  GCGTTCAATGTCATCAATGGCGGTTCTCATGCTGGCAACAAGCTGGCCATGCAGGAGTTCATGATCCTCCCAGT  239

Query  519  CGGTGCAGCAAACTTCAGGGAAGCCATGCGCATTGGAGCAGAGGTTTACCACAACCTGAAGAATGTCATCAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  CGGTGCAGCAAACTTCAGGGAAGCCATGCGCATTGGAGCAGAGGTTTACCACAACCTGAAGAATGTCATCAAGG  313

Query  593  AGAAATATGGGAAAGATGCCACCAATGTGGGGGATGAAGGCGGGTTTGCTCCCAACATCCTGGAGAATAAAGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  AGAAATATGGGAAAGATGCCACCAATGTGGGGGATGAAGGCGGGTTTGCTCCCAACATCCTGGAGAATAAAGAA  387

Query  667  GGCCTGGAGCTGCTGAAGACTGCTATTGGGAAAGCTGGCTACACTGATAAGGTGGTCATCGGCATGGACGTAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  GGCCTGGAGCTGCTGAAGACTGCTATTGGGAAAGCTGGCTACACTGATAAGGTGGTCATCGGCATGGACGTAGC  461

Query  741  GGCCTCCGAGTTCTTCAGGTCTGGGAAGTATGACCTGGACTTCAAGTCTCCCGATGACCCCAGCAGGTACATCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  GGCCTCCGAGTTCTTCAGGTCTGGGAAGTATGACCTGGACTTCAAGTCTCCCGATGACCCCAGCAGGTACATCT  535

Query  815  CGCCTGACCAGCTGGCTGACCTGTACAAGTCCTTCATCAAGGACTACCCAGTGGTGTCTATCGAAGATCCCTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  CGCCTGACCAGCTGGCTGACCTGTACAAGTCCTTCATCAAGGACTACCCAGTGGTGTCTATCGAAGATCCCTTT  609

Query  889  GACCAGGATGACTGGGGAGCTTGGCAGAAGTTCACAGCCAGTGCAGGAATCCAGGTAGTGGGGGATGATCTCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  GACCAGGATGACTGGGGAGCTTGGCAGAAGTTCACAGCCAGTGCAGGAATCCAGGTAGTGGGGGATGATCTCAC  683

Query  963  AGTGACCAACCCAAAGAGGATCGCCAAGGCCGTGAACGAGAAGTCCTGCAACTGCCTCCTGCTCAAAGTCAACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  AGTGACCAACCCAAAGAGGATCGCCAAGGCCGTGAACGAGAAGTCCTGCAACTGCCTCCTGCTCAAAGTCAACC  757

Query 1037  AGATTGGCTCCGTGACCGAGTCTCTTCAGGCGTGCAAGCTGGCCCAGGCCAATGGTTGGGGCGTCATGGTGTCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  AGATTGGCTCCGTGACCGAGTCTCTTCAGGCGTGCAAGCTGGCCCAGGCCAATGGTTGGGGCGTCATGGTGTCT  831

Query 1111  CATCGTTCGGGGGAGACTGAAGATACCTTCATCGCTGACCTGGTTGTGGGGCTGTGCACTGGGCAGATCAAGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  CATCGTTCGGGGGAGACTGAAGATACCTTCATCGCTGACCTGGTTGTGGGGCTGTGCACTGGGCAGATCAAGAC  905

Query 1185  TGGTGCCCCTTGCCGATCTGAGCGCTTGGCCAAGTACAACCAGCTCCTCAGAATTGAAGAGGAGCTGGGCAGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  TGGTGCCCCTTGCCGATCTGAGCGCTTGGCCAAGTACAACCAGCTCCTCAGAATTGAAGAGGAGCTGGGCAGCA  979

Query 1259  AGGCTAAGTTTGCCGGCAGGAACTTCAGAAAACCCTTGGCCAAG  1302
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  980  AGGCTAAGTTTGCCGGCAGGAACTTCAGAAACCCCTTGGCCAAG  1023