Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06177
- Subject:
- NM_010167.5
- Aligned Length:
- 1849
- Identities:
- 1677
- Gaps:
- 2
Alignment
Query 1 ATGGAAGACTCCCAGGATTTAAATGAACAATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAATCTCA 74
|||||||||.|||||||..|||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||||..||.||||
Sbjct 1 ATGGAAGACACCCAGGACCTAAATGAGCAATCTGTAAAGAAAACGTGCCCAGAAGCAGATGTTTCGGAACCTCA 74
Query 75 GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTT-GTTGGAGGTGGTGATACTCCAGGT 147
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.| ||| ||||||||..|||||||.||.||.
Sbjct 75 GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAAGACCTAGCAAGTCCCCATGC-CTTGGTTGGAGGCAGTGATACACCTGGG 147
Query 148 AGCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC 221
||||||||.|||||.||||||..||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 AGCTCCAAGCTGGATAAATCTGGTCTCAGCAGCACTTCAGTCACAACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC 221
Query 222 AGTCAAAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG 295
|||||||||||||||||||.||||||||||..||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 AGTCAAAACAGAGCCCTTGCACAGCAGTGAGTCCACTACCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG 295
Query 296 GGTCAGTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCTTCCAAG 369
||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 296 GGTCAGTAATAACAAGCAGCGGCTACAGCCCCAGGTCGGCGCAGCAGTACTCTCCACAGCTGTACCCCTCCAAG 369
Query 370 CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTATTCGGG 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 370 CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTACTCTGG 443
Query 444 GATGCAGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACGATTTGG 517
||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||||.|.|
Sbjct 444 GATGCAGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACGATCTTG 517
Query 518 GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGCTGCCTC 591
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 518 GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGCTGCCTG 591
Query 592 AGTTACAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTCTAGTTT 665
||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 592 AGCTACAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTCCAGCTT 665
Query 666 TGCACCATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAACAGGATT 739
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||
Sbjct 666 TGCACCATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGCAGGATT 739
Query 740 ATCCATCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCGTATATG 813
|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 740 ACCCATCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCATACATG 813
Query 814 ACATCGAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCCAGGACT 887
|||||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 814 ACATCAAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCAAGGACT 887
Query 888 GACTAACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGAGAACCT 961
|||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 888 GACTAGCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACAGAACAT 961
Query 962 GTAGGAGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGTGACCTG 1035
||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 962 GTAGAAGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGTGACCTA 1035
Query 1036 GAGCGTGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTATGCACA 1109
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1036 GAGCGTGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTATGCACA 1109
Query 1110 GAAGTATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATCTTGCTG 1183
|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1110 GAAGTATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATCTTGCAG 1183
Query 1184 ATACTCATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGATGATAAT 1257
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1184 ATACACATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGACGACAAT 1257
Query 1258 GGGCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCTTTGTTT 1331
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1258 GGTCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCTTTGTTT 1331
Query 1332 GCCAACAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAGAATTAT 1405
||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1332 GCCAACAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGGAATTAT 1405
Query 1406 ATAACACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTAAGGGCA 1479
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1406 ATAACACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTAAGGGCA 1479
Query 1480 GAGATTGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAGGAGTAA 1553
|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1480 GAGATCGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAGGAGTAA 1553
Query 1554 CTGCATAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTTTAGGAG 1627
|||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..||||||
Sbjct 1554 CTGTGTAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCCTAGGAG 1627
Query 1628 GTGCTTTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATAATGCAA 1701
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1628 GTGCTTTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAGCGAATAATGCAA 1701
Query 1702 AGGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAAGCACAA 1775
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 AGGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAGCAGGCAGCAAAAAAGCACAA 1775
Query 1776 CATGCCCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG 1848
|||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 CATGCCCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG 1848