Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06183
- Subject:
- XM_017028644.2
- Aligned Length:
- 2010
- Identities:
- 1031
- Gaps:
- 954
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCACGGATTACAGTACCTATAGCCAAGCTGCAGCGCAGCAGGGCTACAGTGCTTACACCGCCCAGCC 74
Query 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CACTCAAGGATATGCACAGACCACCCAGGCATATGGGCAACAAAGCTATGGAACCTATGGACAGCCCACTGATG 148
Query 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCTATACCCAGGCTCAGACCACTGCAACCTATGGGCAGACCGCCTATGCAACTTCTTATGGACAGCCTCCC 222
Query 223 ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGGTTATACTACTCCAACTGCCCCCCAGGCATACAGCCAGCCTGTCCAGGGGTATGGCACTGGTGCTTATGA 296
Query 297 TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TACCACCACTGCTACAGTCACCACCACCCAGGCCTCCTATGCAGCTCAGTCTGCATATGGCACTCAGCCTGCTT 370
Query 371 ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCCAGCCTATGGGCAGCAGCCAGCAGCCACTGCACCTACAAGACCGCAGGATGGAAACAAGCCCACTGAGACT 444
Query 445 AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGTCAACCTCAATCTAGCACAGGGGGTTACAACCAGCCCAGCCTAGGATATGGACAGAGTAACTACAGTTATCC 518
Query 519 CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCAGGTACCTGGGAGCTACCCCATGCAGCCAGTCACTGCACCTCCATCCTACCCTCCTACCAGCTATTCCTCTA 592
Query 593 CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACAGCCGACTAGTTATGATCAGAGCAGTTACTCTCAGCAGAACACCTATGGGCAACCGAGCAGCTATGGACAG 666
Query 667 CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGAGTAGCTATGGTCAACAAAGCAGCTATGGGCAGCAGCCTCCCACTAGTTACCCACCCCAAACTGGATCCTA 740
Query 741 CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGCCAAGCTCCAAGTCAATATAGCCAACAGAGCAGCAGCTACGGGCAGCAGAGTTCATTCCGACAGGACCACC 814
Query 815 CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAGTAGCATGGGTGTTTATGGGCAGGAGTCTGGAGGATTTTCCGGACCAGGAGAGAACCGGAGCATGAGTGGC 888
Query 889 CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTGATAACCGGGGCAGGGGAAGAGGGGGATTTGATCGTGGAGGCATGAGCAGAGGTGGGCGGGGAGGAGGACG 962
Query 963 CGGTGTAATGGG-GTTACAAAGTGAG------------AGCCTTGTATACACTTCAATACTTAAAAAGTACCCG 1023
|||||.|||||| |.|..|.||.||| |||||.||..||.|.|..|| .|||.|||.|
Sbjct 963 CGGTGGAATGGGCGCTGGAGAGCGAGGTGGCTTCAATAAGCCTGGTGGACCCATGGAT------GAAGGACCAG 1030
Query 1024 TACT-----------------------CAG-----TACTCAGCCGGCA--GCA---TA---------ATGAAA- 1054
..|| ||| .||||.|.|..|| ||| || ||.|||
Sbjct 1031 ATCTTGATCTAGGCCCACCTGTAGATCCAGATGAAGACTCTGACAACAGTGCAATTTATGTACAAGGATTAAAT 1104
Query 1055 ---AGTGGGAC--------------------------------------------------------------- 1062
||||.|||
Sbjct 1105 GACAGTGTGACTCTAGATGATCTGGCAGACTTCTTTAAGCAGTGTGGGGTTGTTAAGATGAACAAGAGAACTGG 1178
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1179 GCAACCCATGATCCACATCTACCTGGACAAGGAAACAGGAAAGCCCAAAGGCGATGCCACAGTGTCCTATGAAG 1252
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1253 ACCCACCCACTGCCAAGGCTGCCGTGGAATGGTTTGATGGGAAAGATTTTCAAGGGAGCAAACTTAAAGTCTCC 1326
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1327 CTTGCTCGGAAGAAGCCTCCAATGAACAGTATGCGGGGTGGTCTGCCACCCCGTGAGGGCAGAGGCATGCCACC 1400
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1401 ACCACTCCGTGGAGGTCCAGGAGGCCCAGGAGGTCCTGGGGGACCCATGGGTCGCATGGGAGGCCGTGGAGGAG 1474
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1475 ATAGAGGAGGCTTCCCTCCAAGAGGACCCCGGGGTTCCCGAGGGAACCCCTCTGGAGGAGGAAACGTCCAGCAC 1548
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1549 CGAGCTGGAGACTGGCAGTGTCCCAATCCTTCAATTGGTGATTTCTGCTGTGATGTAATTGTATGCAGGGGTTG 1622
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1623 TGGAAACCAGAACTTCGCCTGGAGAACAGAGTGCAACCAGTGTAAGGCCCCAAAGCCTGAAGGCTTCCTCCCGC 1696
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1697 CACCCTTTCCGCCCCCGGGTGGTGATCGTGGCAGAGGTGGCCCTGGTGGCATGCGGGGAGGAAGAGGTGGCCTC 1770
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1771 ATGGATCGTGGTGGTCCCGGTGGAATGTTCAGAGGTGGCCGTGGTGGAGACAGAGGTGGCTTCCGTGGTGGCCG 1844
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1845 GGGCATGGACCGAGGTGGCTTTGGTGGAGGAAGACGAGGTGGCCCTGGGGGGCCCCCTGGACCTTTGATGGAAC 1918
Query 1063 -------------------------------------------------------------------------- 1062
Sbjct 1919 AGATGGGAGGAAGAAGAGGAGGACGTGGAGGACCTGGAAAAATGGATAAAGGCGAGCACCGTCAGGAGCGCAGA 1992
Query 1063 ------------ 1062
Sbjct 1993 GATCGGCCCTAC 2004
