Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06219
• Subject: NM_001169124.2
• Aligned Length: 1305
• Identities: 1270
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYK----TNKGDALANRVQNK  70
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||.
Sbjct    1  MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGDALANRVQNT  74

Query   71  LGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTL  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  LGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTL  148

Query  145  IHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNP  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  IHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNP  222

Query  219  NSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQD  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  NSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQD  296

Query  293  QAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILREMTHSWPT  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  297  QAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILR--------  362

Query  367  PLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATE  440
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  ---------------------ESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATE  415

Query  441  LYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPS  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  LYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPS  489

Query  515  TNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARP  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  TNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARP  563

Query  589  RPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNK  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  RPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNK  637

Query  663  ATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKS  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  638  ATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKS  711

Query  737  KEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLH  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  KEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLH  785

Query  811  AAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPN  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  AAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPN  859

Query  885  TRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGI  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  TRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGI  933

Query  959  SVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEM  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  SVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEM  1007

Query 1033  MSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERD  1106
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  TSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERD  1081

Query 1107  PLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFK  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  PLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFK  1155

Query 1181  QNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMAD  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  QNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMAD  1229

Query 1255  KLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL  1301
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230  KLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL  1276