Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06219
• Subject: NM_002025.4
• Aligned Length: 1311
• Identities: 1299
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYK----TNKGDALANRVQNK  70
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||.
Sbjct    1  MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGDALANRVQNT  74

Query   71  LGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTL  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  LGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTL  148

Query  145  IHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNP  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  IHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNP  222

Query  219  NSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQD  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  NSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQD  296

Query  293  QAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILREMTHSWPT  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  QAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEILREMTHSWPT  370

Query  367  PLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTK------MLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTT  434
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  PLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTT  444

Query  435  QCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATP  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  QCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATP  518

Query  509  EPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLI  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  EPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLI  592

Query  583  REKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDP  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  REKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDP  666

Query  657  PRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISG  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  PRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISG  740

Query  731  GNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVP  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVP  814

Query  805  GHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAP  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAP  888

Query  879  PHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFC  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  PHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFC  962

Query  953  ATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMD  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMD  1036

Query 1027  SSHLEMMSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECG  1100
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  SSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECG  1110

Query 1101  NAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRS  1174
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Sbjct 1111  NAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRS  1184

Query 1175  LMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYE  1248
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Sbjct 1185  LMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYE  1258

Query 1249  HWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL  1301
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  HWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL  1311