Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06242
• Subject: NM_000811.3
• Aligned Length: 1359
• Identities: 1357
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGTCGTCTCTGCCCTGGCTGTGCATTATTCTGTGGCTAGAAAATGCCCTAGGGAAACTCGAAGTTGAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCGTCTCTGCCCTGGCTGTGCATTATTCTGTGGCTAGAAAATGCCCTAGGGAAACTCGAAGTTGAAGG  74

Query   75  CAACTTCTACTCAGAAAACGTCAGTCGGATCCTGGACAACTTGCTTGAAGGCTATGACAATCGGCTGCGGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAACTTCTACTCAGAAAACGTCAGTCGGATCCTGGACAACTTGCTTGAAGGCTATGACAATCGGCTGCGGCCGG  148

Query  149  GATTTGGAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAAACAGACATTTATGTGACCAGTTTTGGGCCCGTGTCAGATGTGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATTTGGAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAAACAGACATTTATGTGACCAGTTTTGGGCCCGTGTCAGATGTGGAG  222

Query  223  ATGGAGTATACGATGGATGTTTTTTTCCGCCAGACCTGGACTGATGAGAGGTTGAAGTTTGGGGGGCCAACTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGGAGTATACGATGGATGTTTTTTTCCGCCAGACCTGGACTGATGAGAGGTTGAAGTTTGGGGGGCCAACTGA  296

Query  297  GATTCTGAGTCTGAATAATTTGATGGTCAGTAAAATCTGGACGCCTGACACCTTTTTCAGAAATGGTAAAAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATTCTGAGTCTGAATAATTTGATGGTCAGTAAAATCTGGACGCCTGACACCTTTTTCAGAAATGGTAAAAAGT  370

Query  371  CCATTGCTCACAACATGACAACTCCTAATAAACTCTTCAGAATAATGCAGAATGGAACCATTTTATACACCATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATTGCTCACAACATGACAACTCCTAATAAACTCTTCAGAATAATGCAGAATGGAACCATTTTATACACCATG  444

Query  445  AGGCTTACCATCAATGCTGACTGTCCCATGAGGCTGGTTAACTTTCCTATGGATGGGCATGCTTGTCCACTCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCTTACCATCAATGCTGACTGTCCCATGAGGCTGGTTAACTTTCCTATGGATGGGCATGCTTGTCCACTCAA  518

Query  519  GTTTGGGAGCTATGCTTATCCCAAAAGTGAAATCATATATACGTGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTTGGGAGCTATGCTTATCCCAAAAGTGAAATCATATATACGTGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG  592

Query  593  TCCCAGAAGAATCTTCAAGCCTTCTCCAGTATGATCTGATTGGACAAACAGTATCTAGTGAGACAATTAAATCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCAGAAGAATCTTCAAGCCTTCTCCAGTATGATCTGATTGGACAAACAGTATCTAGTGAGACAATTAAATCT  666

Query  667  AACACAGGTGAATACGTTATAATGACAGTTTACTTCCACTTGCAAAGGAAGATGGGCTACTTCATGATACAGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACACAGGTGAATACGTTATAATGACAGTTTACTTCCACTTGCAAAGGAAGATGGGCTACTTCATGATACAGAT  740

Query  741  ATACACTCCTTGCATTATGACAGTCATTCTTTCCCAGGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCCGTCCCAGCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATACACTCCTTGCATTATGACAGTCATTCTTTCCCAGGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCCGTCCCAGCAA  814

Query  815  GAACTGTTTTTGGGATCACCACTGTTTTAACTATGACCACTTTGAGCATCAGTGCCCGGCACTCTTTGCCAAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAACTGTTTTTGGGATCACCACTGTTTTAACTATGACCACTTTGAGCATCAGTGCCCGGCACTCTTTGCCAAAA  888

Query  889  GTGTCATATGCCACTGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTTTGCTTTGCATTCGTCTTCTCTGCTCTTATCGAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GTGTCATATGCCACTGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTTTGCTTTGCATTCGTCTTCTCTGCGCTTATCGAGTT  962

Query  963  CGCAGCTGTCAACTACTTTACCAATCTTCAGACACAGAAGGCCAAAAGGAAGGCACAGTTTGCAGCCCCACCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCAGCTGTCAACTACTTTACCAATCTTCAGACACAGAAGGCCAAAAGGAAGGCACAGTTTGCAGCCCCACCCA  1036

Query 1037  CAGTGACAATATCAAAAGCTACTGAACCTTTGGAAGCTGAGATTGTTTTGCATCCTGACTCCAAATATCATCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTGACAATATCAAAAGCTACTGAACCTTTGGAAGCTGAGATTGTTTTGCATCCTGACTCCAAATATCATCTG  1110

Query 1111  AAGAAAAGGATCACTTCTCTGTCTTTGCCAATAGTTTCATCTTCCGAGGCCAATAAAGTGCTCACGAGAGCGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGAAAAGGATCACTTCTCTGTCTTTGCCAATAGTTTCATCTTCCGAGGCCAATAAAGTGCTCACGAGAGCGCC  1184

Query 1185  CATCTTACAATCAACACCTGTCACACCCCCACCACTCTCGCCAGCCTTTGGAGGCACCAGTAAAATAGACCAGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCTTACAATCAACACCTGTCACACCCCCACCACTCTCGCCAGCCTTTGGAGGCACCAGTAAAATAGACCAGT  1258

Query 1259  ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTTGCATTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGGTAGTTTATCTTTCCAAAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTTGCATTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGGTAGTTTATCTTTCCAAAGAT  1332

Query 1333  ACAATGGAAGTGAGTAGCAGTGTTGAA  1359
            |||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1333  ACAATGGAAGTCAGTAGCAGTGTTGAA  1359