Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06242
• Subject: XM_006532197.3
• Aligned Length: 1378
• Identities: 1160
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ------------------ATGG-CGTCGTCTCTGCCCTGGCTGTGCATTATTCTGTGGCTAGAAAATGCCCTAG  55
                              .||| .|.|.||||             ||         |||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGAGGAATATGAAGGATTTGGAAGACTTCTC-------------CA---------GGCTAGAAAATGCCCAAG  52

Query   56  GGAAACTCGAAGTTGAAGGCAACTTCTACTCAGAAAACGTCAGTCGGATCCTGGACAACTTGCTTGAAGGCTAT  129
            ...||||.||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct   53  CTCAACTTGAAGATGAAGGCAACTTCTACTCTGAAAATGTCAGTCGGATTCTTGACAACTTGCTGGAAGGCTAT  126

Query  130  GACAATCGGCTGCGGCCGGGATTTGGAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAAACAGACATTTATGTGACCAGTTTTGG  203
            |||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  127  GACAACCGTCTACGGCCAGGATTTGGGGGTGCTGTAACAGAAGTCAAAACAGACATCTATGTGACCAGCTTTGG  200

Query  204  GCCCGTGTCAGATGTGGAGATGGAGTATACGATGGATGTTTTTTTCCGCCAGACCTGGACTGATGAGAGGTTGA  277
            .||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|||
Sbjct  201  ACCTGTGTCAGATGTGGAGATGGAGTATACAATGGATGTTTTCTTCCGCCAGACTTGGACTGATGAGAGACTGA  274

Query  278  AGTTTGGGGGGCCAACTGAGATTCTGAGTCTGAATAATTTGATGGTCAGTAAAATCTGGACGCCTGACACCTTT  351
            |.|||...||.||..|||||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  275  AATTTAAAGGCCCTGCTGAGATTCTGAGCTTAAATAACTTGATGGTCAGTAAGATCTGGACTCCTGACACTTTT  348

Query  352  TTCAGAAATGGTAAAAAGTCCATTGCTCACAACATGACAACTCCTAATAAACTCTTCAGAATAATGCAGAATGG  425
            |||.|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  349  TTCCGGAATGGGAAAAAGTCAATTGCTCACAACATGACCACCCCCAACAAGCTCTTCCGATTAATGCAGAATGG  422

Query  426  AACCATTTTATACACCATGAGGCTTACCATCAATGCTGACTGTCCCATGAGGCTGGTTAACTTTCCTATGGATG  499
            |||.||..|.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||.||||||||||
Sbjct  423  AACAATCCTCTATACCATGAGGCTCACCATCAACGCTGATTGCCCCATGAGATTGGTTAACTTCCCTATGGATG  496

Query  500  GGCATGCTTGTCCACTCAAGTTTGGGAGCTATGCTTATCCCAAAAGTGAAATCATATATACGTGGAAAAAAGGA  573
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  497  GACACGCTTGTCCACTCAAGTTTGGGAGCTATGCTTATCCTAAAACTGAAATCATATATACATGGAAAAAAGGA  570

Query  574  CCACTTTACTCAGTAGAAGTCCCAGAAGAATCTTCAAGCCTTCTCCAGTATGATCTGATTGGACAAACAGTATC  647
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||
Sbjct  571  CCACTTTACTCAGTAGAAGTCCCAGAAGAATCTTCTAGCCTCCTCCAGTATGATTTGATTGGGCAAACAGTTTC  644

Query  648  TAGTGAGACAATTAAATCTAACACAGGTGAATACGTTATAATGACAGTTTACTTCCACTTGCAAAGGAAGATGG  721
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  645  TAGTGAGACAATTAAATCTAACACTGGTGAATATGTAATCATGACAGTCTATTTCCACTTACAAAGGAAGATGG  718

Query  722  GCTACTTCATGATACAGATATACACTCCTTGCATTATGACAGTCATTCTTTCCCAGGTGTCTTTCTGGATTAAT  795
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  719  GCTATTTCATGATCCAGATATACACTCCGTGCATCATGACAGTCATTCTTTCTCAAGTGTCTTTCTGGATTAAT  792

Query  796  AAGGAGTCCGTCCCAGCAAGAACTGTTTTTGGGATCACCACTGTTTTAACTATGACCACTTTGAGCATCAGTGC  869
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  793  AAGGAGTCAGTCCCAGCAAGAACTGTCTTTGGAATCACCACTGTTTTAACCATGACCACCTTAAGCATCAGTGC  866

Query  870  CCGGCACTCTTTGCCAAAAGTGTCATATGCCACTGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTTTGCTTTGCATTCGTCT  943
            .|||||||||.|.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct  867  TCGGCACTCTCTACCCAAAGTGTCCTATGCAACCGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTATGCTTTGCTTTTGTCT  940

Query  944  TCTCTGCTCTTATCGAGTTCGCAGCTGTCAACTACTTTACCAATCTTCAGACACAGAAGGCCAAAAGGAAGGCA  1017
            |.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||..|||||.|||||
Sbjct  941  TTTCTGCTCTCATTGAATTCGCAGCTGTCAACTACTTCACCAATCTCCAGTCACAGAAGGCTGAAAGGCAGGCA  1014

Query 1018  CAGTTTGCAGCCCCACCCACAGTGACAATATCAAAAGCTACTGAACCTTTGGAAGCTGAGATTGTTTTGCATCC  1091
            ||...|||||||.|.|||.|.|||.|||..||||||||..|||||.|..||.||||.|||||||||.|||||.|
Sbjct 1015  CAAACTGCAGCCACGCCCCCTGTGGCAAAGTCAAAAGCGTCTGAATCCCTGCAAGCAGAGATTGTTGTGCATTC  1088

Query 1092  TGACTCCAAATATCATCTGAAGAAAAGGATCACTTCTCTGTCTTTGCCAATAGTTTCATCTTCCGAGGCCAATA  1165
            |||||||||.||.|||||||||||.||.||||..||||||.|||||||.||.|||.|||||||.|||||||..|
Sbjct 1089  TGACTCCAAGTACCATCTGAAGAAGAGAATCAGCTCTCTGACTTTGCCCATCGTTCCATCTTCTGAGGCCAGCA  1162

Query 1166  AAGTGCTCACGAGAGCGCCCATCTTACAATCAACACCTGTCACACCCCCACCACTCTCGCCAGCCTTTGGAGGC  1239
            |||..||||..|||.|||||||||||.||||.||.||||||.|.||||||...||||..||||||..|||.|||
Sbjct 1163  AAGCCCTCAGTAGAACGCCCATCTTAAAATCGACGCCTGTCTCTCCCCCATTGCTCTTACCAGCCACTGGGGGC  1236

Query 1240  ACCAGTAAAATAGACCAGTATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTTGCATTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGGT  1313
            |||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1237  ACCAGCAAAATAGATCAGTATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTAGCTTTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGAT  1310

Query 1314  AGTTTATCTTTCCAAAGATACAATGGAAGTGAGTAGCAGTGTTGAA  1359
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||.
Sbjct 1311  AGTTTACCTTTCCAAAGATACAATGGAAGTGAGCAGTACTGTTGAG  1356