Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06242
- Subject:
- XM_006532198.3
- Aligned Length:
- 1359
- Identities:
- 960
- Gaps:
- 249
Alignment
Query 1 ATGGCGTCGTCTCTGCCCTGGCTGTGCATTATTCTGTGGCTAGAAAATGCCCTAGGGAAACTCGAAGTTGAAGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAACTTCTACTCAGAAAACGTCAGTCGGATCCTGGACAACTTGCTTGAAGGCTATGACAATCGGCTGCGGCCGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GATTTGGAGGTGCTGTCACTGAAGTCAAAACAGACATTTATGTGACCAGTTTTGGGCCCGTGTCAGATGTGGAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATGGAGTATACGATGGATGTTTTTTTCCGCCAGACCTGGACTGATGAGAGGTTGAAGTTTGGGGGGCCAACTGA 296
||| .||||.||||||||||||||..||||.|||...||.||..||||
Sbjct 1 ----------------ATG-----------AAGACTTGGACTGATGAGAGACTGAAATTTAAAGGCCCTGCTGA 47
Query 297 GATTCTGAGTCTGAATAATTTGATGGTCAGTAAAATCTGGACGCCTGACACCTTTTTCAGAAATGGTAAAAAGT 370
|||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 48 GATTCTGAGCTTAAATAACTTGATGGTCAGTAAGATCTGGACTCCTGACACTTTTTTCCGGAATGGGAAAAAGT 121
Query 371 CCATTGCTCACAACATGACAACTCCTAATAAACTCTTCAGAATAATGCAGAATGGAACCATTTTATACACCATG 444
|.|||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||.||.||||||||||||||||.||..|.||.||||||
Sbjct 122 CAATTGCTCACAACATGACCACCCCCAACAAGCTCTTCCGATTAATGCAGAATGGAACAATCCTCTATACCATG 195
Query 445 AGGCTTACCATCAATGCTGACTGTCCCATGAGGCTGGTTAACTTTCCTATGGATGGGCATGCTTGTCCACTCAA 518
|||||.||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 196 AGGCTCACCATCAACGCTGATTGCCCCATGAGATTGGTTAACTTCCCTATGGATGGACACGCTTGTCCACTCAA 269
Query 519 GTTTGGGAGCTATGCTTATCCCAAAAGTGAAATCATATATACGTGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG 592
|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 270 GTTTGGGAGCTATGCTTATCCTAAAACTGAAATCATATATACATGGAAAAAAGGACCACTTTACTCAGTAGAAG 343
Query 593 TCCCAGAAGAATCTTCAAGCCTTCTCCAGTATGATCTGATTGGACAAACAGTATCTAGTGAGACAATTAAATCT 666
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 344 TCCCAGAAGAATCTTCTAGCCTCCTCCAGTATGATTTGATTGGGCAAACAGTTTCTAGTGAGACAATTAAATCT 417
Query 667 AACACAGGTGAATACGTTATAATGACAGTTTACTTCCACTTGCAAAGGAAGATGGGCTACTTCATGATACAGAT 740
|||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 418 AACACTGGTGAATATGTAATCATGACAGTCTATTTCCACTTACAAAGGAAGATGGGCTATTTCATGATCCAGAT 491
Query 741 ATACACTCCTTGCATTATGACAGTCATTCTTTCCCAGGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCCGTCCCAGCAA 814
|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 492 ATACACTCCGTGCATCATGACAGTCATTCTTTCTCAAGTGTCTTTCTGGATTAATAAGGAGTCAGTCCCAGCAA 565
Query 815 GAACTGTTTTTGGGATCACCACTGTTTTAACTATGACCACTTTGAGCATCAGTGCCCGGCACTCTTTGCCAAAA 888
|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.|||
Sbjct 566 GAACTGTCTTTGGAATCACCACTGTTTTAACCATGACCACCTTAAGCATCAGTGCTCGGCACTCTCTACCCAAA 639
Query 889 GTGTCATATGCCACTGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTTTGCTTTGCATTCGTCTTCTCTGCTCTTATCGAGTT 962
|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||
Sbjct 640 GTGTCCTATGCAACCGCCATGGATTGGTTCATAGCTGTATGCTTTGCTTTTGTCTTTTCTGCTCTCATTGAATT 713
Query 963 CGCAGCTGTCAACTACTTTACCAATCTTCAGACACAGAAGGCCAAAAGGAAGGCACAGTTTGCAGCCCCACCCA 1036
||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||..|||||.|||||||...|||||||.|.|||.
Sbjct 714 CGCAGCTGTCAACTACTTCACCAATCTCCAGTCACAGAAGGCTGAAAGGCAGGCACAAACTGCAGCCACGCCCC 787
Query 1037 CAGTGACAATATCAAAAGCTACTGAACCTTTGGAAGCTGAGATTGTTTTGCATCCTGACTCCAAATATCATCTG 1110
|.|||.|||..||||||||..|||||.|..||.||||.|||||||||.|||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct 788 CTGTGGCAAAGTCAAAAGCGTCTGAATCCCTGCAAGCAGAGATTGTTGTGCATTCTGACTCCAAGTACCATCTG 861
Query 1111 AAGAAAAGGATCACTTCTCTGTCTTTGCCAATAGTTTCATCTTCCGAGGCCAATAAAGTGCTCACGAGAGCGCC 1184
|||||.||.||||..||||||.|||||||.||.|||.|||||||.|||||||..||||..||||..|||.||||
Sbjct 862 AAGAAGAGAATCAGCTCTCTGACTTTGCCCATCGTTCCATCTTCTGAGGCCAGCAAAGCCCTCAGTAGAACGCC 935
Query 1185 CATCTTACAATCAACACCTGTCACACCCCCACCACTCTCGCCAGCCTTTGGAGGCACCAGTAAAATAGACCAGT 1258
|||||||.||||.||.||||||.|.||||||...||||..||||||..|||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 936 CATCTTAAAATCGACGCCTGTCTCTCCCCCATTGCTCTTACCAGCCACTGGGGGCACCAGCAAAATAGATCAGT 1009
Query 1259 ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTTGCATTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGGTAGTTTATCTTTCCAAAGAT 1332
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1010 ATTCTCGAATTCTCTTCCCAGTAGCTTTTGCAGGATTCAACCTTGTGTACTGGATAGTTTACCTTTCCAAAGAT 1083
Query 1333 ACAATGGAAGTGAGTAGCAGTGTTGAA 1359
||||||||||||||.||.|.||||||.
Sbjct 1084 ACAATGGAAGTGAGCAGTACTGTTGAG 1110