Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06291
• Subject: NM_001256414.2
• Aligned Length: 1062
• Identities: 903
• Gaps: 156

Alignment

Query    1  ATGGGCTGCACGCTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGTAAGATGATCGACCGCAACCTCCGTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACGGCGAGAAGGCGGCGCGCGAGGTCAAGCTGCTGCTGCTCGGTGCTGGTGAATCTGGTAAAAGTACAATTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGAAGCAGATGAAAATTATCCATGAAGCTGGTTATTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTAC  222
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------ATGAAAATTATCCATGAAGCTGGTTATTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTAC  66

Query  223  AGTAACACCATCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGACTTTGGTGACTCAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  AGTAACACCATCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGACTTTGGTGACTCAGC  140

Query  297  CCGGGCGGATGATGCACGCCAACTCTTTGTGCTAGCTGGAGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  CCGGGCGGATGATGCACGCCAACTCTTTGTGCTAGCTGGAGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTTG  214

Query  371  CTGGAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAACAGATCCCGAGAGTACCAGCTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  CTGGAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAACAGATCCCGAGAGTACCAGCTT  288

Query  445  AATGATTCTGCAGCATACTATTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCAACCAAATTACATCCCGACTCAACAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  AATGATTCTGCAGCATACTATTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCAACCAAATTACATCCCGACTCAACAAGA  362

Query  519  TGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCATTTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  TGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCATTTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAAAA  436

Query  593  TGTTTGATGTGGGAGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGGCGGCGATCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  437  TGTTTGATGTGGGAGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGACGGCGATCATC  510

Query  667  TTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCTGAAGATGAAGAAATGAACCGAATGCATGAAAGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  TTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCTGAAGATGAAGAAATGAACCGAATGCATGAAAGCAT  584

Query  741  GAAATTGTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATACTTTTTCTAAACAAGAAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  GAAATTGTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATACTTTTTCTAAACAAGAAGG  658

Query  815  ATCTTTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCTCTCACTATATGCTATCAAGAATATGCAGGATCAAACACATAT  888
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  ATCTCTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCTCTCACTATATGCTATCCAGAATATGCAGGATCAAACACATAT  732

Query  889  GAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAAGAAAGGACACAAAGGAAATATACAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  GAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAAGAAAGGACACAAAGGAAATATACAC  806

Query  963  CCACTTCACATGTGCCACAGATACTAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  CCACTTCACATGTGCCACAGATACTAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAAAA  880

Query 1037  ATAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT  1062
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  ATAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT  906