Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06291
• Subject: NM_006496.4
• Aligned Length: 1063
• Identities: 860
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGGCTGCACGCTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGTAAGATGATCGACCGCAACCTCCGTGA  74
            ||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct    1  ATGGGCTGCACGTTGAGCGCCGAAGACAAGGCGGCAGTGGAGCGAAGCAAGATGATCGACCGCAACTTACGGGA  74

Query   75  GGACGGCGAGAAGGCGGCGCGCGAGGTCAAGCTGCTGCTGCTCGGTGCTGGTGAATCTGGTAAAAGTACAATTG  148
            ||||||.||.||.|||||....||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct   75  GGACGGGGAAAAAGCGGCCAAAGAAGTGAAGCTGCTGCTACTCGGTGCTGGAGAATCTGGTAAAAGCACCATTG  148

Query  149  TGAAGCAGATGAAAATTATCCATGAAGCTGGTTATTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTAC  222
            ||||.|||||||||||.||.|||||.|.|||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||.|||.||||||
Sbjct  149  TGAAACAGATGAAAATCATTCATGAGGATGGCTATTCAGAGGATGAATGTAAACAATATAAAGTAGTTGTCTAC  222

Query  223  AGTAACACCATCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGACTTTGGTGACTCAGC  296
            ||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||..||.|.|||||.||||||||.||..|.||
Sbjct  223  AGCAATACTATACAGTCCATCATTGCAATCATAAGAGCCATGGGACGGCTAAAGATTGACTTTGGGGAAGCTGC  296

Query  297  CCGGGCGGATGATGCACGCCAACTCTTTGTGCTAGCTGG-AGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTT  369
            |.||||.||||||||.||.|||.|.|||||..||||||| || ||||||||||||..|.||||||.|||||||.
Sbjct  297  CAGGGCAGATGATGCCCGGCAATTATTTGTTTTAGCTGGCAG-TGCTGAAGAAGGAGTCATGACTCCAGAACTA  369

Query  370  GCTGGAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAACAGATCCCGAGAGTACCAGCT  443
            ||.|||||.||.||..|.||.|||..||||.||||.||||||||.||.||||.|||||||.|.||.||.|||||
Sbjct  370  GCAGGAGTGATTAAACGGTTATGGCGAGATGGTGGGGTACAAGCTTGCTTCAGCAGATCCAGGGAATATCAGCT  443

Query  444  TAATGATTCTGCAGCATACTATTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCAACCAAATTACATCCCGACTCAACAAG  517
            .|||||||||||..||||.|||.|.|||||..||||.||||||.|.||..|.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct  444  CAATGATTCTGCTTCATATTATCTAAATGATCTGGATAGAATATCCCAGTCTAACTACATTCCAACTCAGCAAG  517

Query  518  ATGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCATTTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAAA  591
            |||||||..|.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.||..|.||.||.
Sbjct  518  ATGTTCTTCGGACGAGAGTGAAGACCACAGGCATTGTAGAAACACATTTCACCTTCAAAGACCTATACTTCAAG  591

Query  592  ATGTTTGATGTGGGAGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGGCGGCGATCAT  665
            |||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||.|.||.||.||
Sbjct  592  ATGTTTGATGTAGGTGGCCAAAGATCAGAACGAAAAAAGTGGATTCACTGTTTTGAGGGAGTGACAGCAATTAT  665

Query  666  CTTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCTGAAGATGAAGAAATGAACCGAATGCATGAAAGCA  739
            |||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CTTCTGTGTGGCCCTCAGTGATTATGACCTTGTTCTGGCTGAGGACGAGGAGATGAACCGAATGCATGAAAGCA  739

Query  740  TGAAATTGTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATACTTTTTCTAAACAAGAAG  813
            |||||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||.||||||||.
Sbjct  740  TGAAACTGTTTGACAGCATTTGTAATAACAAATGGTTTACAGAAACTTCAATCATTCTCTTCCTTAACAAGAAA  813

Query  814  GATCTTTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCTCTCACTATATGCTATCAAGAATATGCAGGATCAAACACATA  887
            ||.||||||||.||||||||.||.|.|||.||..|.|||||.||.||||.||||||..||||.||.||.|||||
Sbjct  814  GACCTTTTTGAGGAAAAAATAAAGAGGAGTCCGTTAACTATCTGTTATCCAGAATACACAGGTTCCAATACATA  887

Query  888  TGAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAAGAAAGGACACAAAGGAAATATACA  961
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|.||||||.||.||.|||||.||.||.|
Sbjct  888  TGAAGAGGCAGCTGCCTATATTCAATGCCAGTTTGAAGATCTGAACAGAAGAAAAGATACCAAGGAGATCTATA  961

Query  962  CCCACTTCACATGTGCCACAGATACTAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAAA  1035
            |.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  962  CTCACTTCACCTGTGCCACAGACACGAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTTACAGATGTCATCATTAAA  1035

Query 1036  AATAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT  1062
            ||.||..||||.||.|||||.||.|.|
Sbjct 1036  AACAACTTAAAGGAATGTGGACTTTAT  1062