Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06321
- Subject:
- NM_001004057.2
- Aligned Length:
- 1734
- Identities:
- 1595
- Gaps:
- 138
Alignment
Query 1 ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG 74
Query 75 TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG 148
Query 149 AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA 222
Query 223 CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG 296
Query 297 TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG 370
Query 371 ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA 444
Query 445 GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA 518
Query 519 ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT 592
Query 593 TTGGAGAGGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGCCACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGGAGAGGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGCCACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGA 666
Query 667 ATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTCTAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTCTAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGT 740
Query 741 AGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAAGATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAAGATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATT 814
Query 815 TGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCCCGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCCCGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTG 888
Query 889 TGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAAGAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAAGAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGA 962
Query 963 TGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTCGGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTCGGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAA 1036
Query 1037 GAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGAAGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGAAGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGG 1110
Query 1111 GGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTCAGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTCAGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATG 1184
Query 1185 GGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGATACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGATACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTA 1258
Query 1259 TCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAGCAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAGCAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAG 1332
Query 1333 CAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCAGGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCAGGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGA 1406
Query 1407 TCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGCGGTGAAAGGGATCTACCTGGACA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGTGGTGAAAGGGATCTACCTGGACA 1480
Query 1481 CCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGA---------- 1544
Query 1555 TCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTGAAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACA 1628
Sbjct 1545 -------------------------------------------------------------------------- 1544
Query 1629 TACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTCTTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCC 1702
||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 ------------------------------------------------------GGGCTGCCTGACCATGGTCC 1564
Query 1703 CCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565 CCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC 1596