Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06321
• Subject: XM_011513449.2
• Aligned Length: 1851
• Identities: 1637
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAA-----------------------  51

Query   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148
                                                                                     |
Sbjct   52  -------------------------------------------------------------------------G  52

Query  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   53  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  126

Query  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  200

Query  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  274

Query  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  348

Query  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  422

Query  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  496

Query  593  TTGGAGAG------------------------------------------------------------------  600
            ||||||||                                                                  
Sbjct  497  TTGGAGAGCAGTCCCCTGTGGGGTGTGCAGTGGATGGGAGTTGGAAGAAACAGCAGCCTAATGTTGATGACACA  570

Query  601  ---------------------------------------------------GTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGC  623
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  GAGGCACGGGGACCAGAACCTGAGGCTCATGATACTATTTTTTCCACTTTTGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGC  644

Query  624  CACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGAATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  CACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGAATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTC  718

Query  698  TAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGTAGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAA  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  TAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGTAGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAA  792

Query  772  GATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATTTGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCC  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  GATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATTTGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCC  866

Query  846  CGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTGTGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAA  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  CGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTGTGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAA  940

Query  920  GAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGATGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  GAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGATGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTC  1014

Query  994  GGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAAGAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGA  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  GGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAAGAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGA  1088

Query 1068  AGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGGGGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTC  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  AGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGGGGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTC  1162

Query 1142  AGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATGGGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGAT  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  AGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATGGGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGAT  1236

Query 1216  ACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTATCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAG  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  ACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTATCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAG  1310

Query 1290  CAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAGCAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCA  1363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  CAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAGCAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCA  1384

Query 1364  GGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGATCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTG  1437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  GGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGATCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTG  1458

Query 1438  GATATCGAGCAGTTCTCGGCGGTGAAAGGGATCTACCTGGACACCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGC  1511
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  GATATCGAGCAGTTCTCGGTGGTGAAAGGGATCTACCTGGACACCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGC  1532

Query 1512  TACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAATCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTG  1585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  TACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAATCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTG  1606

Query 1586  AAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACATACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTC  1659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  AAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACATACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTC  1680

Query 1660  TTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCCCCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATG  1733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681  TTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCCCCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATG  1754

Query 1734  C  1734
            |
Sbjct 1755  C  1755