Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06321
• Subject: XM_011513451.2
• Aligned Length: 1851
• Identities: 1595
• Gaps: 255

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74

Query   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148

Query  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222

Query  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296

Query  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370

Query  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444

Query  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518

Query  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592

Query  593  TTGGAGAG------------------------------------------------------------------  600
            ||||||||                                                                  
Sbjct  593  TTGGAGAGCAGTCCCCTGTGGGGTGTGCAGTGGATGGGAGTTGGAAGAAACAGCAGCCTAATGTTGATGACACA  666

Query  601  ---------------------------------------------------GTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGC  623
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGCACGGGGACCAGAACCTGAGGCTCATGATACTATTTTTTCCACTTTTGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGC  740

Query  624  CACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGAATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGAATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTC  814

Query  698  TAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGTAGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAA  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGTAGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAA  888

Query  772  GATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATTTGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCC  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATTTGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCC  962

Query  846  CGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTGTGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAA  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTGTGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAA  1036

Query  920  GAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGATGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGATGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTC  1110

Query  994  GGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAAGAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGA  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAAGAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGA  1184

Query 1068  AGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGGGGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTC  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGGGGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTC  1258

Query 1142  AGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATGGGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGAT  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATGGGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGAT  1332

Query 1216  ACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTATCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAG  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct 1333  ACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTATCTGCAGGATG--------------------  1386

Query 1290  CAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAGCAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCA  1363
                                                                                      
Sbjct 1387  --------------------------------------------------------------------------  1386

Query 1364  GGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGATCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTG  1437
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387  --------------------------------------------CCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTG  1416

Query 1438  GATATCGAGCAGTTCTCGGCGGTGAAAGGGATCTACCTGGACACCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGC  1511
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417  GATATCGAGCAGTTCTCGGTGGTGAAAGGGATCTACCTGGACACCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGC  1490

Query 1512  TACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAATCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTG  1585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491  TACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAATCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTG  1564

Query 1586  AAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACATACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTC  1659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565  AAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACATACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTC  1638

Query 1660  TTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCCCCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATG  1733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639  TTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCCCCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATG  1712

Query 1734  C  1734
            |
Sbjct 1713  C  1713