Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06321
• Subject: XM_017008055.1
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1361
• Gaps: 372

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAA-----------------------  51

Query   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148
                                                                                     |
Sbjct   52  -------------------------------------------------------------------------G  52

Query  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   53  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  126

Query  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  200

Query  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  274

Query  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  348

Query  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  422

Query  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  496

Query  593  TTGGAGAGGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGCCACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  TTGGAGAGGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGCCACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGA  570

Query  667  ATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTCTAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  ATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTCTAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGT  644

Query  741  AGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAAGATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  AGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAAGATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATT  718

Query  815  TGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCCCGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  TGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCCCGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTG  792

Query  889  TGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAAGAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  TGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAAGAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGA  866

Query  963  TGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTCGGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  TGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTCGGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAA  940

Query 1037  GAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGAAGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  GAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGAAGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGG  1014

Query 1111  GGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTCAGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  GGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTCAGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATG  1088

Query 1185  GGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGATACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGATACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTA  1162

Query 1259  TCTGCAGGATGTTACTCACCAAGAATCCAAGCAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAG  1332
            |||||||||||                                                               
Sbjct 1163  TCTGCAGGATG---------------------------------------------------------------  1173

Query 1333  CAGCACCCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCAGGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGA  1406
                                                                                      
Sbjct 1174  --------------------------------------------------------------------------  1173

Query 1407  TCCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGCGGTGAAAGGGATCTACCTGGACA  1480
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  -CCTCATGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGTGGTGAAAGGGATCTACCTGGACA  1246

Query 1481  CCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 1247  CCGCAGATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGA----------  1310

Query 1555  TCTGGGTGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTGAAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACA  1628
                                                                                      
Sbjct 1311  --------------------------------------------------------------------------  1310

Query 1629  TACCCCGGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTCTTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCC  1702
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  ------------------------------------------------------GGGCTGCCTGACCATGGTCC  1330

Query 1703  CCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC  1734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  CCAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC  1362