Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06337
Subject:
NR_126445.2
Aligned Length:
1108
Identities:
729
Gaps:
376

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------------ATGGGCCTAG  10
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  AGCTGCTGCCCACACCGCGCTCAGCGCCTTCACTGCCATCCCCGCTGTCCTTGCCGCCCCCGCCATGGGCCTAG  74

Query   11  AGCTGTTTCTTGACCTGGTGTCCCAGCCCAGCCGCGCCGTCTACATCTTCGCCAAGAAGAATGGCATCCCCTTA  84
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCTGTTTCTTGACCTGGTGTCCCAGCCCAGCCGCGCCGTCTACATCTTCGCCAAGAAGAATGGCATCCCCTTA  148

Query   85  GAGCTGCGCACCGTGGATTTGGTCAAAGGGCAGCACAAGAGCAAGGAGTTCTTGCAGATCAACAGCCTGGGGAA  158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGCTGCGCACCGTGGATTTGGTCAAAGGGCAGCACAAGAGCAAGGAGTTCTTGCAGATCAACAGCCTGGGGAA  222

Query  159  ACTGCCGACGCTCAAGGATGGTGATTTCATCTTGACCGAAAGCTCGGCCATCCTGATTTACCTGAGCTGTAAGT  232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGCCGACGCTCAAGGATGGTGATTTCATCTTGACCGAAAGCTCGGCCATCCTGATTTACCTGAGCTGTAAGT  296

Query  233  ACCAGACGCCGGACCACTGGTATCCATCTGACCTGCAGGCTCGTGCCCGTGTTCATGAGTACCTGGGCTGGCAT  306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCAGACGCCGGACCACTGGTATCCATCTGACCTGCAGGCTCGTGCCCGTGTTCATGAGTACCTGGGCTGGCAT  370

Query  307  GCCGACTGCATCCGTGGCACCTTTGGTATACCCCTGTGGGTCCAGGTGTTGGGGCCACTCATTGGGGTCCAGGT  380
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCGACTGCATCCGTGGCACCTTTGGTATACCCCTGTGGGTCCAGATGTTGGGGCCACTCATTGGGGTCCAGGT  444

Query  381  GCCCGAGGAGAAGGTGGAACGCAACAGGACTGCCATGGACCAGGCCCTGCAATGGCTGGAGGACAAGTTCCTGG  454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCGAGGAGAAGGTGGAACGCAACAGGACTGCCATGGACCAGGCCCTGCAATGGCTGGAGGACAAGTTCCTGG  518

Query  455  GGGACAGGCCCTTCCTCGCTGGCCAGCAGGTGACACTGGCTGATCTCATGGCCCTGGAGGAGCTGATGCAGCCG  528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGACAGGCCCTTCCTCGCTGGCCAGCAGGTGACACTGGCTGATCTCATGGCCCTGGAGGAGCTGATGCAGCCG  592

Query  529  GTGGCTCTCGGCTACGAACTGTTTGAGGGACGGCCACGACTGGCAGCATGGCGTGGACGAGTGGAGGCTTTCCT  602
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGCTCTCGGCTATGAACTGTTTGAGGGACGGCCACGACTGGCAGCATGGCGTGGATGAGTGGAGGCTTTCCT  666

Query  603  GGGTGCTGAGCTATGCCAGGAGGCCCACAGCATCATCTTGAGCATCCTGGAACAGGCGGCCAAGAAAACCCTCC  676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGTGCTGAGCTATGCCAGGAGGCCCACAGCATCATCTTGAGCATCCTGGAACAGGCGGCCAAGAAAACCCTCC  740

Query  677  CAACACCCTCACCAGAGGCCTATCAGGCTATGCTGCTTCGAATCGCCAGGATCCCC------------------  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  741  CAACACCCTCACCAGAGGCCTATCAGGCTATGCTGCTTCGAATCGCCAGGATCCCCTGAAGGGTCTGGGATGGG  814

Query  733  --------------------------------------------------------------------------  732
                                                                                      
Sbjct  815  GGCCAGGAGATTAGCAACAAGGATTCATTCTGTTACTTACTTGCCCCTTTTTATCTTTCCCTCTTGCCCCAGTC  888

Query  733  --------------------------------------------------------------------------  732
                                                                                      
Sbjct  889  CCTTCTCTCCAGCTTCATGTGAAGCTCTGCACAGACAAGACACTCAGTGTCCTTGGCAGTGCTGCTACTCCTCA  962

Query  733  --------------------------------------------------------------------------  732
                                                                                      
Sbjct  963  GGTGCAGCATACATAACCAGTAAGAGACTAAATCTGCAATATATAAAGAGCTCCTACAAATCAGTAACATGAAG  1036

Query  733  ------------------------------------------------------------------------  732
                                                                                    
Sbjct 1037  AACACTCAAAAATTGGCAAATGTCATCAGTGTTTTAAACAGAATAAAGATTCCAAACACTTTGAATAGAGAA  1108