Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06363
- Subject:
- NM_001297439.2
- Aligned Length:
- 1986
- Identities:
- 1963
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGGGGCGCTGGGCCTGGGTCCCCAGCCCCTGGCCCCCACCGGGGCTGGGCCCCTTCCTCCTCCTCCTCCTGCT 74
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Sbjct 1 ATGGGGCGCTGGGCCTGGGTCCCCAGCCCCTGGCCCCCACCGGGGCTGGGCCCCTTCCTCCTCCTCCTCCTGCT 74
Query 75 GCTGCTGCTGCTGCCACGGGGGTTCCAGCCCCAGCCTGGCGGGAACCGTACGGAGTCCCCAGAACCTAATGCCA 148
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Sbjct 75 GCTGCTGCTGCTGCCACGGGGGTTCCAGCCCCAGCCTGGCGGGAACCGTACGGAGTCCCCAGAACCTAATGCCA 148
Query 149 CAGCGACCCCTGCGATCCCCACTATCCTGGTGACCTCTGTGACCTCTGAGACCCCAGCAACAAGTGCTCCAGAG 222
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Sbjct 149 CAGCGACCCCTGCGATCCCCACTATCCTGGTGACCTCTGTGACCTCTGAGACCCCAGCAACAAGTGCTCCAGAG 222
Query 223 GCAGAGGGACCCCAAAGTGGGGGGCTCCCGCCCCCGCCCAGGGCAGTTCCCTCGAGCAGTAGCCCCCAGGCCCA 296
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Sbjct 223 GCAGAGGGACCCCAAAGTGGGGGGCTCCCGCCCCCGCCCAGGGCAGTTCCCTCGAGCAGTAGCCCCCAGGCCCA 296
Query 297 AGCACTCACCGAGGACGGGAGGCCCTGCAGGTTCCCCTTCCGCTACGGGGGCCGCATGCTGCATGCCTGCACTT 370
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Sbjct 297 AGCACTCACCGAGGACGGGAGGCCCTGCAGGTTCCCCTTCCGCTACGGGGGCCGCATGCTGCATGCCTGCACTT 370
Query 371 CGGAGGGCAGTGCACACAGGAAGTGGTGTGCCACAACTCACAACTACGACCGGGACAGGGCCTGGGGCTACTGT 444
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Sbjct 371 CGGAGGGCAGTGCACACAGGAAGTGGTGTGCCACAACTCACAACTACGACCGGGACAGGGCCTGGGGCTACTGT 444
Query 445 GTGGAGGCCACCCCGCCTCCAGGGGGCCCAGCTGCCCTGGATCCCTGTGCCTCCGGCCCCTGCCTCAATGGAGG 518
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Sbjct 445 GTGGAGGCCACCCCGCCTCCAGGGGGCCCAGCTGCCCTGGATCCCTGTGCCTCCGGCCCCTGCCTCAATGGAGG 518
Query 519 CTCCTGCTCCAATACCCAGGACCCCCAGTCCTATCACTGCAGCTGCCCCCGGGCCTTCACCGGCAAGGACTGCG 592
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Sbjct 519 CTCCTGCTCCAATACCCAGGACCCCCAGTCCTATCACTGCAGCTGCCCCCGGGCCTTCACCGGCAAGGACTGCG 592
Query 593 GCACAGAGAAATGCTTTGATGAGACACGCTACGAGTACCTGGAGGGGGGCGACCGCTGGGCCCGCGTGCGCCAG 666
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Sbjct 593 GCACAGAGAAATGCTTTGATGAGACCCGCTACGAGTACCTGGAGGGGGGCGACCGCTGGGCCCGCGTGCGCCAG 666
Query 667 GGCCACGTGGAACAGTGCGAGTGCTTGGGGGGCCGGACCTGGTGCGAAGGCACCCGACATACAGCTTGTCTGAG 740
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Sbjct 667 GGCCACGTGGAACAGTGCGAGTGCTTCGGGGGCCGGACCTGGTGCGAAGGCACCCGACATACAGCTTGTCTGAG 740
Query 741 CAGCCCTTGCCTGAACGGGGGCACCTGCCACCTGATCGTGGCCACCGGGACCACCGTGTGTGCCTGCCCACCAG 814
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Sbjct 741 CAGCCCTTGCCTGAACGGGGGCACCTGCCACCTGATCGTGGCCACCGGGACCACCGTGTGTGCCTGCCCACCAG 814
Query 815 GCTTCGCTGGACGGCTCTGCAACATCGAGCCTGATGAGCGCTGCTTCTTGGGGAACGGCACTGGGTACCGTGGC 888
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Sbjct 815 GCTTCGCTGGACGGCTCTGCAACATCGAGCCTGATGAGCGCTGCTTCTTGGGGAACGGCACTGGGTACCGTGGC 888
Query 889 GTGGCCAGCACCTCAGCCTCGGGCCTCAGCTGCCTGGCCTGGAACTCCGATCTGCTCTACCAGGAGCTGCACGT 962
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Sbjct 889 GTGGCCAGCACCTCAGCCTCGGGCCTCAGCTGCCTGGCCTGGAACTCCGATCTGCTCTACCAGGAGCTGCACGT 962
Query 963 GGACTCCGTGGGCGCCGCGGCCCTGCTGGGCCTGGGCCCCCATGCCTACTGCCGGAATCCGGACAATGACGAGA 1036
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Sbjct 963 GGACTCCGTGGGCGCCGCGGCCCTGCTGGGCCTGGGCCCCCATGCCTACTGCCGGAATCCGGACAATGACGAGA 1036
Query 1037 GGCCCTGGTGCTACGTGGTGAAGGACAGCGCGCTCTCCTGGGAGTACTGCCGCCTGGAGGCCTGC--------- 1101
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Sbjct 1037 GGCCCTGGTGCTACGTGGTGAAGGACAGCGCGCTCTCCTGGGAGTACTGCCGCCTGGAGGCCTGCGATTTGGAA 1110
Query 1102 ------------GAATCCCTCACCAGAGTCCAACTGTCACCGGATCTCCTGGCGACCCTGCCTGAGCCAGCCTC 1163
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Sbjct 1111 ACTGAGGGCAGAGAATCCCTCACCAGAGTCCAACTGTCACCGGATCTCCTGGCGACCCTGCCTGAGCCAGCCTC 1184
Query 1164 CCCGGGGCGCCAGGCCTGCGGCAGGAGGCACAAGAAGAGGACGTTCCTGCGGCCACGTATCATCGGCGGCTCCT 1237
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Sbjct 1185 CCCGGGGCGCCAGGCCTGCGGCAGGAGGCACAAGAAGAGGACGTTCCTGCGGCCACGTATCATCGGCGGCTCCT 1258
Query 1238 CCTCGCTGCCCGGCTCGCACCCCTGGCTGGCCGCCATCTACATCGGGGACAGCTTCTGCGCCGGGAGCCTGGTC 1311
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Sbjct 1259 CCTCGCTGCCCGGCTCGCACCCCTGGCTGGCCGCCATCTACATCGGGGACAGCTTCTGCGCCGGGAGCCTGGTC 1332
Query 1312 CACACCTGCTGGGTGGTGTCGGCCGCCCACTGCTTCTCCCACAGCCCCCCCAGGGACAGCGTCTCCGTGGTGCT 1385
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Sbjct 1333 CACACCTGCTGGGTGGTGTCGGCCGCCCACTGCTTCTCCCACAGCCCCCCCAGGGACAGCGTCTCCGTGGTGCT 1406
Query 1386 GGGCCAGCACTTCTTCAACCGCACGACGGACGTGACGCAGACCTTCGGCATCGAGAAGTACATCCCGTACACCC 1459
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Sbjct 1407 GGGCCAGCACTTCTTCAACCGCACGACGGACGTGACGCAGACCTTCGGCATCGAGAAGTACATCCCGTACACCC 1480
Query 1460 TGTACTCGGTGTTCAACCCCAGCGACCACGACCTCGTCCTGATCCGGCTGAAGAAGAAAGGGGACCGCTGTGCC 1533
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Sbjct 1481 TGTACTCGGTGTTCAACCCCAGCGACCACGACCTCGTCCTGATCCGGCTGAAGAAGAAAGGGGACCGCTGTGCC 1554
Query 1534 ACACGCTCGCAGTTCGTGCAGCCCATCTGCCTGCCCGAGCCCGGCAGCACCTTCCCCGCAGGACACAAGTGCCA 1607
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Sbjct 1555 ACACGCTCGCAGTTCGTGCAGCCCATCTGCCTGCCCGAGCCCGGCAGCACCTTCCCCGCAGGACACAAGTGCCA 1628
Query 1608 GATTGCGGGCTGGGGCCACTTGGATGAGAACGTGAGCGGCTACTCCAGCTCCCTGCGGGAGGCCCTGGTCCCCC 1681
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Sbjct 1629 GATTGCGGGCTGGGGCCACTTGGATGAGAACGTGAGCGGCTACTCCAGCTCCCTGCGGGAGGCCCTGGTCCCCC 1702
Query 1682 TGGTCGCCGACCACAAGTGCAGCAGCCCTGAGGTCTACGGCGCCGACATCAGCCCCAACATGCTCTGTGCCGGC 1755
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Sbjct 1703 TGGTCGCCGACCACAAGTGCAGCAGCCCTGAGGTCTACGGCGCCGACATCAGCCCCAACATGCTCTGTGCCGGC 1776
Query 1756 TACTTCGACTGCAAGTCCGACGCCTGCCAGGGGGACTCAGGGGGGCCCCTGGCCTGCGAGAAGAACGGCGTGGC 1829
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Sbjct 1777 TACTTCGACTGCAAGTCCGACGCCTGCCAGGGGGACTCAGGGGGGCCCCTGGCCTGCGAGAAGAACGGCGTGGC 1850
Query 1830 TTACCTCTACGGCATCATCAGCTGGGGTGACGGCTGCGGGCGGCTCCACAAGCCGGGGGTCTACACCCGCGTGG 1903
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Sbjct 1851 TTACCTCTACGGCATCATCAGCTGGGGTGACGGCTGCGGGCGGCTCCACAAGCCGGGGGTCTACACCCGCGTGG 1924
Query 1904 CCAACTATGTGGACTGGATCAACGACCGGATACGGCCTCCCAGGCGGCTTGTGGCTCCCTCC 1965
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Sbjct 1925 CCAACTATGTGGACTGGATCAACGACCGGATACGGCCTCCCAGGCGGCTTGTGGCTCCCTCC 1986