Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06388
• Subject: NM_001166427.1
• Aligned Length: 1245
• Identities: 1139
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGATGCTGGGCCCTGAGGGAGGTGAAGGCTTTGTGGTCAAGCTCCGTGGCCTGCCCTGGTCCTGCTCTGTTGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGATGCTGGGCCCTGAGGGAGGTGAAGGCTATGTGGTCAAACTCCGTGGCCTACCCTGGTCCTGCTCAATTGA  74

Query   75  GGACGTGCAGAACTTCCTCTCTGACTGCACGATTCATGATGGGGCCGCAGGTGTCCATTTCATCTACACTAGAG  148
            ||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  GGACGTACAAAACTTCCTCTCCGACTGCACAATTCATGATGGGGTCGCAGGTGTTCATTTCATTTATACTAGAG  148

Query  149  AGGGCAGGCAGAGTGGTGAGGCTTTTGTTGAACTTGGATCAGAAGATGATGTAAAAATGGCCCTGAAAAAAGAC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct  149  AAGGCAGGCAGAGTGGTGAGGCTTTTGTTGAACTTGAGTCAGAAGATGATGTAAAATTGGCTCTGAAAAAAGAC  222

Query  223  AGGGAAAGCATGGGACACCGGTACATTGAGGTGTTCAAGTCCCACAGAACCGAGATGGATTGGGTGTTGAAGCA  296
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGGAAAGCATGGGACACCGGTATATTGAGGTGTTCAAGTCACACAGAACCGAGATGGATTGGGTGTTGAAGCA  296

Query  297  CAGTGGTCCCAACAGTGCCGACAGCGCCAACGATGGCTTCGTGCGGCTTCGAGGACTCCCATTTGGATGCACAA  370
            |||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGTGGTCCAAACAGCGCCGACAGTGCCAATGATGGCTTTGTGAGGCTTCGGGGACTCCCATTTGGATGCACAA  370

Query  371  AGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATTGTGCCAAACGGGATCACATTGCCTGTGGACCCCGAA  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||
Sbjct  371  AGGAAGAAATCGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATTGTGCCAAACGGGATCACACTACCTGTGGACCCGGAA  444

Query  445  GGCAAGATTACAGGGGAAGCGTTCGTGCAGTTTGCCTCGCAGGAGTTAGCTGAGAAGGCTCTAGGGAAACACAA  518
            |||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||||
Sbjct  445  GGCAAGATTACAGGGGAGGCCTTCGTTCAGTTTGCCTCACAAGAGTTAGCTGAGAAAGCTTTAGGGAAGCACAA  518

Query  519  GGAGAGGATAGGGCACAGGTACATTGAGGTGTTTAAGAGCAGCCAGGAGGAAGTTAGGTCATACTCAGATCCCC  592
            ||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  GGAGAGAATAGGGCACAGGTATATTGAAGTGTTTAAGAGCAGTCAGGAGGAAGTTAGATCATACTCAGATCCAC  592

Query  593  CTCTGAAGTTCATGTCCGTGCAGCGGCCAGGGCCCTATGACCGGCCCGGGACTGCCAGGAGGTACATTGGCATC  666
            ||||||||||.|||||.|||||..||||.|||||.||||||.||||.||.||.|||.||||||||||||||||.
Sbjct  593  CTCTGAAGTTTATGTCTGTGCAAAGGCCTGGGCCTTATGACAGGCCTGGCACAGCCCGGAGGTACATTGGCATT  666

Query  667  GTGAAGCAGGCAGGCCTGGAAAGGATGAGGCCTGGTGCCTACAGCACAGGCTACGGGGGCTACGAGGAGTACAG  740
            |||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||..|||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  667  GTGAAACAGGCAGGTCTGGATAGGATGAGGTCTGGTGCCTATAGTGCAGGCTATGGGGGCTATGAAGAATACAG  740

Query  741  TGGCCTCAGTGATGGCTACGGCTTCACCACCGACCTGTTCGGGAGAGACCTCAGCTACTGTCTCTCCGGGATGT  814
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct  741  TGGCCTCAGTGATGGCTATGGCTTCACCACTGACCTGTTTGGGAGAGACCTCAGCTATTGTCTCTCAGGAATGT  814

Query  815  ATGACCACAGATACGGCGACAGTGAGTTCACAGTGCAGAGCACCACAGGCCACTGTGTCCACATGAGGGGCCTG  888
            |||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  815  ATGACCACAGATATGGAGACAGCGAGTTCACAGTGCAGAGCACCACCGGCCACTGCGTCCACATGAGAGGGCTG  888

Query  889  CCGTACAAAGCGACCGAGAACGACATTTACAACTTCTTCTCTCCTCTCAACCCTGTGAGAGTCCATATTGAGAT  962
            ||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  CCCTACAAAGCAACGGAGAACGACATTTACAACTTCTTCTCTCCACTCAACCCTGTGAGAGTTCATATTGAGAT  962

Query  963  TGGCCCAGATGGAAGAGTGACGGGTGAAGCAGATGTTGAGTTTGCTACTCATGAAGAAGCTGTGGCAGCTATGT  1036
            |||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  TGGTCCTGATGGAAGAGTGACGGGAGAAGCTGATGTTGAGTTTGCTACTCATGAAGAAGCAGTGGCAGCTATGT  1036

Query 1037  CCAAAGACAGGGCCAATATGCAGCACAGATATATAGAACTCTTCTTGAATTCAACAACAGGGGCCAGCAATGGG  1110
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  CCAAGGACAGGGCCAACATGCAGCACAGATACATAGAACTCTTCCTGAATTCAACAACAGGGGCTAGCAATGGG  1110

Query 1111  GCGTATAGCAGCCAGGTGATGCAAGGCATGGGGGTGTCTGCTGCCCAGGCCACTTACAGTGGCCTGGAGAGCCA  1184
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTTATAGCAGCCAGGTGATGCAGGGCATGGGCGTGTCAGCTGCCCAGGCAACTTACAGTGGCCTGGAGAGCCA  1184

Query 1185  GTCAGTGAGTGGCTGTTACGGGGCCGGCTACAGTGGGCAGAACAGCATGGGTGGCTATGAC  1245
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1185  GTCAGTGAGTGGCTGTTACGGGGCCGGCTACAGCGGTCAGAACAGCATGGGCGGATATGAT  1245