Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06449
- Subject:
- NM_012218.4
- Aligned Length:
- 900
- Identities:
- 691
- Gaps:
- 200
Alignment
Query 1 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHTERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSK 74
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Sbjct 1 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHTERALKAVSDWIDEQEKGSSEQAESDNMDVPPEDDSK 74
Query 75 EGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLVAKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQ 148
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Sbjct 75 EGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLVAKGLLLKGDLDLELVLLCKEKPTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQ 148
Query 149 SVDDAAIVIKNTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQARANG 222
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Sbjct 149 SVDDAAIVIKNTKEPPLSLTIHLTSPVVREEMEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQARANG 222
Query 223 LKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLECLASGIVMPDGSGIYDPCE 296
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Sbjct 223 LKSCVIVIRVLRDLCTRVPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLECLASGIVMPDGSGIYDPCE 296
Query 297 KEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDPLPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPM 370
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Sbjct 297 KEATDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDPLPSKMPKKPKNENPVDYTVQIPPSTTYAITPM 370
Query 371 KRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFE 444
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Sbjct 371 KRPMEEDGEEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQYKLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFE 444
Query 445 ASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPAPVVEAVSTPSAAFPSDATAENV 518
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Sbjct 445 ASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSKGEDSAEETEAKPAVVAPAPVVEAVSTPSAAFPSDATAE-- 516
Query 519 KQQGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKL 592
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Sbjct 517 --QGPILTKHGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKL 588
Query 593 FPDTPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGGPMHNEVPPPPNLRGRGRGGSIRGRGRGRGFGGANH 666
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Sbjct 589 FPDTPLALDANKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGGPMHNEVPPPPNLRGRGRGGSIRGRGRGRGFGGANH 662
Query 667 GGYMNAGAGYGSYGYGGNSATAGYSDFFTDCYGYHDFGSS---------------------------------- 706
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Sbjct 663 GGYMNAGAGYGSYGYGGNSATAGYSQFYSN--GGHSGNASGGGGGGGGGSSGYGSYYQGDNYNSPVPPKHAGKK 734
Query 707 -------------------------------------------------------------------------- 706
Sbjct 735 QPHGGQQKPSYGSGYQSHQGQQQSYNQSPYSNYGPPQGKQKGYNHGQGSYSYSNSYNSPGGGGGSDYNYESKFN 808
Query 707 -------------------------------------------------------------------------- 706
Sbjct 809 YSGSGGRSGGNSYGSGGASYNPGSHGGYGGGSGGGSSYQGKQGGYSQSNYNSPGSGQNYSGPPSSYQSSQGGYG 882
Query 707 ------------ 706
Sbjct 883 RNADHSMNYQYR 894