Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06605
• Subject: NM_001320987.3
• Aligned Length: 964
• Identities: 929
• Gaps: 34

Alignment

Query   1  MDEQSVESIAEVFRCFICMEKLRDARLCPHCSKLCCFSCIRRWLTEQRAQCPHCRAPLQLRELVNCRWAEEVTQ  74
           |||||||                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MDEQSVE----------------------------------RWLTEQRAQCPHCRAPLQLRELVNCRWAEEVTQ  40

Query  75  QLDTLQLCSLTKHEENEKDKCENHHEKLSVFCWACKKCICHQCALWGGMHGGHTFKPLAEIYEQHVTKVNEEVA  148
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  41  QLDTLQLCSLTKHEENEKDKCENHHEKLSVFCWTCKKCICHQCALWGGMHGGHTFKPLAEIYEQHVTKVNEEVA  114

Query 149  KLRRRLMELISLVQEVERNVEAVRNAKDERVREIRNAVEMMIARLDTQLKNKLITLMGQKTSLTQETELLESLL  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 115  KLRRRLMELISLVQEVERNVEAVRNAKDERVREIRNAVEMMIARLDTQLKNKLITLMGQKTSLTQETELLESLL  188

Query 223  QEVEHQLRSCSKSELISKSSEILMMFQQVHRKPMASFVTTPVPPDFTSELVPSYDSATFVLENFSTLRQRADPV  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189  QEVEHQLRSCSKSELISKSSEILMMFQQVHRKPMASFVTTPVPPDFTSELVPSYDSATFVLENFSTLRQRADPV  262

Query 297  YSPPLQVSGLCWRLKVYPDGNGVVRGYYLSVFLELSAGLPETSKYEYRVEMVHQSCNDPTKNIIREFASDFEVG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263  YSPPLQVSGLCWRLKVYPDGNGVVRGYYLSVFLELSAGLPETSKYEYRVEMVHQSCNDPTKNIIREFASDFEVG  336

Query 371  ECWGYNRFFRLDLLANEGYLNPQNDTVILRFQVRSPTFFQKSRDQHWYITQLEAAQTSYIQQINNLKERLTIEL  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337  ECWGYNRFFRLDLLANEGYLNPQNDTVILRFQVRSPTFFQKSRDQHWYITQLEAAQTSYIQQINNLKERLTIEL  410

Query 445  SRTQKSRDLSPPDNHLSPQNDDALETRAKKSACSDMLLEGGPTTASVREAKEDEEDEEKIQNEDYHHELSDGDL  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411  SRTQKSRDLSPPDNHLSPQNDDALETRAKKSACSDMLLEGGPTTASVREAKEDEEDEEKIQNEDYHHELSDGDL  484

Query 519  DLDLVYEDEVNQLDGSSSSASSTATSNTEENDIDEETMSGENDVEYNNMELEEGELMEDAAAAGPAGSSHGYVG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485  DLDLVYEDEVNQLDGSSSSASSTATSNTEENDIDEETMSGENDVEYNNMELEEGELMEDAAAAGPAGSSHGYVG  558

Query 593  SSSRISRRTHLCSAATSSLLDIDPLILIHLLDLKDRSSIENLWGLQPRPPASLLQPTASYSRKDKDQRKQQAMW  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559  SSSRISRRTHLCSAATSSLLDIDPLILIHLLDLKDRSSIENLWGLQPRPPASLLQPTASYSRKDKDQRKQQAMW  632

Query 667  RVPSDLKMLKRLKTQMAEVRCMKTDVKNTLSEIKSSSAASGDMQTSLFSADQAALAACGTENSGRLQDLGMELL  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633  RVPSDLKMLKRLKTQMAEVRCMKTDVKNTLSEIKSSSAASGDMQTSLFSADQAALAACGTENSGRLQDLGMELL  706

Query 741  AKSSVANCYIRNSTNKKSNSPKPARSSVAGSLSLRRAVDPGENSRSKGDCQTLSEGSPGSSQSGSRHSSPRALI  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707  AKSSVANCYIRNSTNKKSNSPKPARSSVAGSLSLRRAVDPGENSRSKGDCQTLSEGSPGSSQSGSRHSSPRALI  780

Query 815  HGSIGDILPKTEDRQCKALDSDAVVVAVFSGLPAVEKRRKMVTLGANAKGGHLEGLQMTDLENNSETGELQPVL  888
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Sbjct 781  HGSIGDILPKTEDRQCKALDSDAVVVAVFSGLPAVEKRRKMVTLGANAKGGHLEGLQMTDLENNSETGELQPVL  854

Query 889  PEGASAAPEEGMSSDSDIECDTENEEQEEHTSVGGFHDSFMVMTQPPDEDTHSSFPDGEQIGPEDLSFNTDENS  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855  PEGASAAPEEGMSSDSDIECDTENEEQEEHTSVGGFHDSFMVMTQPPDEDTHSSFPDGEQIGPEDLSFNTDENS  928

Query 963  GR  964
           ||
Sbjct 929  GR  930