Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06605
• Subject: XM_017024664.1
• Aligned Length: 2919
• Identities: 2838
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGGATGAACAGAGCGTGGAGAGCATTGCTGAGGTTTTCCGATGTTTCATTTGTATGGAGAAATTGCGGGATGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGAACAGAGCGTGGAGAGCATTGCTGAGGTTTTCCGATGTTTCATTTGTATGGAGAAATTGCGGGATGC  74

Query   75  ACGCCTGTGTCCTCATTGCTCCAAACTGTGTTGTTTCAGCTGTATTAGGCGCTGGCTGACAGAGCAGAGAGCTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACGCCTGTGTCCTCATTGCTCCAAACTGTGTTGTTTCAGCTGTATTAGGCGCTGGCTGACAGAGCAGAGAGCTC  148

Query  149  AATGTCCTCATTGCCGTGCTCCACTCCAGCTACGAGAACTAGTAAATTGTCGTTGGGCAGAAGAAGTAACACAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATGTCCTCATTGCCGTGCTCCACTCCAGCTACGAGAACTAGTAAATTGTCGTTGGGCAGAAGAAGTAACACAA  222

Query  223  CAGCTTGATACTCTTCAACTCTGCAGTCTCACCAAACATGAAGAAAATGAAAAGGACAAATGTGAAAATCACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGCTTGATACTCTTCAACTCTGCAGTCTCACCAAACATGAAGAAAATGAAAAGGACAAATGTGAAAATCACCA  296

Query  297  TGAAAAACTTAGTGTATTTTGCTGGGCTTGTAAGAAGTGTATCTGCCATCAGTGTGCACTTTGGGGAGGAATGC  370
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAAAACTTAGTGTATTTTGCTGGACTTGTAAGAAGTGTATCTGCCATCAGTGTGCACTTTGGGGAGGAATGC  370

Query  371  ATGGCGGACATACCTTTAAACCTTTGGCAGAAATTTATGAGCAACACGTCACTAAAGTGAATGAAGAGGTAGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGCGGACATACCTTTAAACCTTTGGCAGAAATTTATGAGCAACACGTCACTAAAGTGAATGAAGAGGTAGCC  444

Query  445  AAACTTCGTCGGCGTCTCATGGAACTGATCAGCTTAGTTCAAGAAGTGGAAAGGAATGTAGAAGCTGTAAGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACTTCGTCGGCGTCTCATGGAACTGATCAGCTTAGTTCAAGAAGTGGAAAGGAATGTAGAAGCTGTAAGAAA  518

Query  519  TGCAAAAGATGAGCGTGTTCGGGAAATTAGGAATGCAGTGGAGATGATGATTGCACGGTTAGACACACAGCTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCAAAAGATGAGCGTGTTCGGGAAATTAGGAATGCAGTGGAGATGATGATTGCACGGTTAGACACACAGCTGA  592

Query  593  AGAATAAGCTTATAACACTGATGGGTCAGAAGACATCTCTAACCCAAGAAACAGAGCTTTTGGAATCCTTACTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAATAAGCTTATAACACTGATGGGTCAGAAGACATCTCTAACCCAAGAAACAGAGCTTTTGGAATCCTTACTT  666

Query  667  CAGGAGGTGGAGCACCAGTTGCGGTCTTGTAGTAAGAGTGAGTTGATATCTAAGAGCTCAGAGATCCTTATGAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGAGGTGGAGCACCAGTTGCGGTCTTGTAGTAAGAGTGAGTTGATATCTAAGAGCTCAGAGATCCTTATGAT  740

Query  741  GTTTCAGCAAGTTCATCGGAAGCCCATGGCATCTTTTGTTACCACTCCTGTTCCACCAGACTTTACCAGTGAAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  741  GTTTCAGCAAGTTCATCGGAAGCCCATGGCATCTTTTGTTACCACTCCTGTTCCACCAGACTTTAC--------  806

Query  815  TAGTGCCATCTTACGATTCAGCTACTTTTGTTTTAGAGAATTTCAGCACTTTGCGTCAGAGAGCAGATCCTGTT  888
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  -------------------------------------------CAGCACTTTGCGTCAGAGAGCAGATCCTGTT  837

Query  889  TACAGTCCACCTCTTCAAGTTTCAGGACTTTGCTGGAGGTTAAAAGTTTACCCAGATGGAAATGGAGTTGTGCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838  TACAGTCCACCTCTTCAAGTTTCAGGACTTTGCTGGAGGTTAAAAGTTTACCCAGATGGAAATGGAGTTGTGCG  911

Query  963  AGGTTACTACTTATCTGTGTTTCTGGAGCTCTCAGCTGGCTTGCCTGAAACTTCTAAATATGAATATCGTGTAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  912  AGGTTACTACTTATCTGTGTTTCTGGAGCTCTCAGCTGGCTTGCCTGAAACTTCTAAATATGAATATCGTGTAG  985

Query 1037  AGATGGTTCACCAGTCCTGTAATGATCCTACAAAAAATATCATTCGAGAATTTGCATCTGACTTTGAAGTTGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  986  AGATGGTTCACCAGTCCTGTAATGATCCTACAAAAAATATCATTCGAGAATTTGCATCTGACTTTGAAGTTGGA  1059

Query 1111  GAATGCTGGGGCTATAATAGATTTTTCCGTTTGGACTTACTCGCAAATGAAGGATACTTGAATCCACAAAATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060  GAATGCTGGGGCTATAATAGATTTTTCCGTTTGGACTTACTCGCAAATGAAGGATACTTGAATCCACAAAATGA  1133

Query 1185  TACAGTGATTTTAAGGTTTCAGGTACGTTCACCAACTTTCTTTCAAAAATCCCGGGACCAGCATTGGTACATTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134  TACAGTGATTTTAAGGTTTCAGGTACGTTCACCAACTTTCTTTCAAAAATCCCGGGACCAGCATTGGTACATTA  1207

Query 1259  CTCAGCTGGAAGCTGCACAGACTAGTTATATCCAACAAATAAACAACCTTAAAGAGAGACTTACTATTGAGCTG  1332
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208  CTCAGTTGGAAGCTGCACAGACTAGTTATATCCAACAAATAAACAACCTTAAAGAGAGACTTACTATTGAGCTG  1281

Query 1333  TCTCGAACTCAGAAGTCAAGAGATTTGTCACCACCAGATAACCATCTTAGCCCCCAAAATGATGATGCTCTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1282  TCTCGAACTCAGAAGTCAAGAGATTTGTCACCACCAGATAACCATCTTAGCCCCCAAAATGATGATGCTCTGGA  1355

Query 1407  GACACGAGCTAAGAAGTCTGCATGCTCTGACATGCTTCTCGAAGGTGGTCCTACTACAGCTTCTGTAAGAGAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1356  GACACGAGCTAAGAAGTCTGCATGCTCTGACATGCTTCTCGAAGGTGGTCCTACTACAGCTTCTGTAAGAGAGG  1429

Query 1481  CCAAAGAGGATGAAGAAGATGAGGAGAAGATTCAGAATGAAGATTATCATCACGAGCTTTCAGATGGAGATCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1430  CCAAAGAGGATGAAGAAGATGAGGAGAAGATTCAGAATGAAGATTATCATCACGAGCTTTCAGATGGAGATCTG  1503

Query 1555  GATCTGGATCTTGTTTATGAGGATGAAGTAAATCAGCTCGATGGCAGCAGTTCCTCTGCTAGTTCCACAGCAAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1504  GATCTGGATCTTGTTTATGAGGATGAAGTAAATCAGCTCGATGGCAGCAGTTCCTCTGCTAGTTCCACAGCAAC  1577

Query 1629  AAGTAATACAGAAGAAAATGATATTGATGAAGAAACTATGTCTGGAGAAAATGATGTGGAATATAACAACATGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1578  AAGTAATACAGAAGAAAATGATATTGATGAAGAAACTATGTCTGGAGAAAATGATGTGGAATATAACAACATGG  1651

Query 1703  AATTAGAAGAGGGAGAACTCATGGAAGATGCAGCTGCTGCAGGACCCGCAGGTAGTAGCCATGGTTATGTGGGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1652  AATTAGAAGAGGGAGAACTCATGGAAGATGCAGCTGCTGCAGGACCCGCAGGTAGTAGCCATGGTTATGTGGGT  1725

Query 1777  TCCAGTAGTAGAATATCAAGAAGAACACATTTATGCTCCGCTGCTACCAGTAGTTTACTAGACATTGATCCATT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1726  TCCAGTAGTAGAATATCAAGAAGAACACATTTATGCTCCGCTGCTACCAGTAGTTTACTAGACATTGATCCATT  1799

Query 1851  AATTTTAATACATTTGTTGGACCTTAAGGACCGGAGCAGTATAGAAAATTTGTGGGGCTTACAGCCTCGCCCAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800  AATTTTAATACATTTGTTGGACCTTAAGGACCGGAGCAGTATAGAAAATTTGTGGGGCTTACAGCCTCGCCCAC  1873

Query 1925  CTGCTTCACTTCTGCAGCCCACAGCATCATATTCTCGAAAAGATAAAGACCAAAGGAAGCAACAGGCAATGTGG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1874  CTGCTTCACTTCTGCAGCCCACAGCATCATATTCTCGAAAAGATAAAGACCAAAGGAAGCAACAGGCAATGTGG  1947

Query 1999  CGAGTGCCCTCTGATTTAAAGATGCTAAAAAGACTCAAAACTCAAATGGCCGAAGTTCGATGTATGAAAACTGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1948  CGAGTGCCCTCTGATTTAAAGATGCTAAAAAGACTCAAAACTCAAATGGCCGAAGTTCGATGTATGAAAACTGA  2021

Query 2073  TGTAAAGAATACACTTTCAGAAATAAAAAGCAGCAGTGCTGCTTCTGGAGACATGCAGACAAGCCTTTTTTCTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022  TGTAAAGAATACACTTTCAGAAATAAAAAGCAGCAGTGCTGCTTCTGGAGACATGCAGACAAGCCTTTTTTCTG  2095

Query 2147  CTGACCAGGCAGCTCTGGCTGCATGTGGAACTGAAAACTCTGGCAGATTGCAGGATTTGGGAATGGAACTCCTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096  CTGACCAGGCAGCTCTGGCTGCATGTGGAACTGAAAACTCTGGCAGATTGCAGGATTTGGGAATGGAACTCCTG  2169

Query 2221  GCAAAGTCATCAGTTGCCAATTGTTACATACGAAACTCCACAAATAAGAAGAGTAATTCGCCCAAGCCAGCTCG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2170  GCAAAGTCATCAGTTGCCAATTGTTACATACGAAACTCCACAAATAAGAAGAGTAATTCGCCCAAGCCAGCTCG  2243

Query 2295  ATCCAGTGTAGCAGGTAGTCTATCACTTCGAAGAGCAGTGGACCCTGGAGAAAATAGTCGTTCAAAGGGAGACT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2244  ATCCAGTGTAGCAGGTAGTCTATCACTTCGAAGAGCAGTGGACCCTGGAGAAAATAGTCGTTCAAAGGGAGACT  2317

Query 2369  GTCAGACTCTGTCTGAAGGCTCCCCAGGAAGCTCTCAGTCTGGGAGCAGGCACAGTTCTCCCCGAGCCTTGATA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318  GTCAGACTCTGTCTGAAGGCTCCCCAGGAAGCTCTCAGTCTGGGAGCAGGCACAGTTCTCCCCGAGCCTTGATA  2391

Query 2443  CATGGCAGTATCGGTGATATTCTGCCAAAAACTGAAGACCGGCAGTGTAAAGCTTTGGATTCAGATGCTGTTGT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392  CATGGCAGTATCGGTGATATTCTGCCAAAAACTGAAGACCGGCAGTGTAAAGCTTTGGATTCAGATGCTGTTGT  2465

Query 2517  GGTTGCAGTTTTCAGTGGCTTGCCTGCGGTTGAGAAAAGGAGGAAAATGGTCACCTTGGGGGCTAATGCTAAAG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466  GGTTGCAGTTTTCAGTGGCTTGCCTGCGGTTGAGAAAAGGAGGAAAATGGTCACCTTGGGGGCTAATGCTAAAG  2539

Query 2591  GAGGTCATCTGGAAGGACTGCAGATGACTGATTTGGAAAATAATTCTGAAACTGGAGAGTTACAGCCTGTACTA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2540  GAGGTCATCTGGAAGGACTGCAGATGACTGATTTGGAAAATAATTCTGAAACTGGAGAGTTACAGCCTGTACTA  2613

Query 2665  CCTGAAGGAGCTTCAGCTGCCCCTGAAGA---------------------------AGGAATGAGTAGCGACAG  2711
            |||||||||||||||||||||||||||||                           ||||||||||||||||||
Sbjct 2614  CCTGAAGGAGCTTCAGCTGCCCCTGAAGAAGAAACATGTTCTCCTTCCTTCCTGCCAGGAATGAGTAGCGACAG  2687

Query 2712  TGACATTGAATGTGACACTGAGAATGAGGAGCAGGAAGAGCATACCAGTGTGGGCGGGTTTCACGACTCCTTCA  2785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688  TGACATTGAATGTGACACTGAGAATGAGGAGCAGGAAGAGCATACCAGTGTGGGCGGGTTTCACGACTCCTTCA  2761

Query 2786  TGGTCATGACACAGCCCCCGGATGAAGATACACATTCCAGTTTTCCTGATGGTGAACAAATAGGCCCTGAAGAT  2859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2762  TGGTCATGACACAGCCCCCGGATGAAGATACACATTCCAGTTTTCCTGATGGTGAACAAATAGGCCCTGAAGAT  2835

Query 2860  CTCAGCTTCAATACAGATGAAAATAGTGGAAGA  2892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2836  CTCAGCTTCAATACAGATGAAAATAGTGGAAGG  2868