Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06606
- Subject:
- NM_001037127.2
- Aligned Length:
- 2683
- Identities:
- 2068
- Gaps:
- 338
Alignment
Query 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC 74
Query 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG 148
Query 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 149 CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC 222
Query 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG 296
Query 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
Query 371 CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAAGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC 444
Query 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG 518
Query 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519 GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA 592
Query 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAGGAAGAAAGTGAACCCGAACAAGATACTAAAGTTTTTGCC 666
||||.||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||..|||||||||||||.
Sbjct 593 CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGAAGACAGAGAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCA 666
Query 667 AGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGG 740
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||.|||
Sbjct 667 AGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTCCTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGG 740
Query 741 CATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGA 814
|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGA 814
Query 815 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 888
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 888
Query 889 AAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAG---------------------- 940
|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 889 AAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGTCAGCATAGCAGTCCCTCCTCCGTGGTTTTC 962
Query 941 -----------------------CAGAATGG------------------------------------------- 948
||||||||
Sbjct 963 TATGGATACTTCTTTCCTATGGACAGAATGGAGTAAGTCACAGAAAGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACA 1036
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1037 GAGGGGAGGTGTGTGATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCTTCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAG 1110
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1111 GACGCCCAGGAGCTGCTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAGGCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGC 1184
Query 949 -------------------------------------------------------------------------A 949
|
Sbjct 1185 TGAGGCTCTGCTGTGTAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGGAGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCA 1258
Query 950 GAGAGTACTGCTTGGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGA 1023
|||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||.||||||||..|||.|||||.|.
Sbjct 1259 GAGAGTACTGCCTGGCGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAATGGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGG 1332
Query 1024 GGACTCTACAGATCCGAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACC 1096
||.|||||||||||.|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 1333 GGCCTCTACAGATCTGGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACC 1405
Query 1097 CCACGGCCTGTGCCAGACTGCCACATCTAG------------------------CATTCCCACCAATGACGTCC 1146
||||.|||||..|.|||||||||.||.||| |||||||..||||.||||||
Sbjct 1406 CCACAGCCTGCACAAGACTGCCATATTTAGATTATAAAAAAGAAAACATAACAACATTCCCGTCAATAACGTCC 1479
Query 1147 TCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTC 1220
||.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||.|| ||||||||..|.|||||.|||.|.|||||
Sbjct 1480 TCCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTC 1550
Query 1221 CATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCT 1294
||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|.||||..|||||.|||||..|||||||||||||||
Sbjct 1551 CATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCT 1624
Query 1295 GCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAG 1368
|||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.|||||||||||..|||||||.|||
Sbjct 1625 GCCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAG 1698
Query 1369 CTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAG 1442
|||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1699 CTCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAG 1772
Query 1443 CCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAG 1516
||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1773 CCTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAG 1846
Query 1517 CAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCG 1590
|||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1847 CAAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCT 1920
Query 1591 GCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCT 1664
|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1921 GCAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACT 1994
Query 1665 ATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGT 1738
.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 CTTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGT 2068
Query 1739 TCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCC 1812
|||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.|.||||||||.|||.||.
Sbjct 2069 TCCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCT 2142
Query 1813 AGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTA 1886
||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2143 AGCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTA 2216
Query 1887 CCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGA 1960
|||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||
Sbjct 2217 CCTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGA 2290
Query 1961 AAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATC 2034
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.|||||.|||
Sbjct 2291 AAATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATC 2364
Query 2035 CCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGG 2108
||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2365 CCTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGG 2438
Query 2109 CGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACT 2182
.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2439 TGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACT 2512
Query 2183 ACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGT 2256
|.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 2513 ATGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGT 2586
Query 2257 TGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGC 2330
|||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||||.||
Sbjct 2587 TGGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGC 2660
Query 2331 AGAGGGAACTGTGAGTGTC 2349
|||||||||.|||.|||||
Sbjct 2661 AGAGGGAACGGTGGGTGTC 2679