Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06606
- Subject:
- NM_001037129.1
- Aligned Length:
- 2614
- Identities:
- 2068
- Gaps:
- 269
Alignment
Query 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC 74
Query 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG 148
Query 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 149 CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC 222
Query 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG 296
Query 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
Query 371 CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAAGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC 444
Query 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG 518
Query 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519 GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA 592
Query 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAGGAAGAAAGTGAACCCGAACAAGATACTAAAGTTTTTGCC 666
||||.||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||..|||||||||||||.
Sbjct 593 CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGAAGACAGAGAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCA 666
Query 667 AGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGG 740
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||.|||
Sbjct 667 AGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTCCTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGG 740
Query 741 CATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGA 814
|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGA 814
Query 815 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 888
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 888
Query 889 AAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGG-------------- 948
|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGTCAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAA 962
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 963 AGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTGATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCT 1036
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1037 TCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTGCTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAG 1110
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1111 GCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTGTAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGG 1184
Query 949 ----------------------------AGAGAGTACTGCTTGGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAAT 994
||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1185 AGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGGCGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAAT 1258
Query 995 GGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCCGAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATG 1067
|||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.||
Sbjct 1259 GGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCTGGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTG 1331
Query 1068 CAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCAGACTGCCACATCTAGCATTCCCACCAATGA 1141
|||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|||||||||.||.||||||||||..||||.|
Sbjct 1332 CAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAAGACTGCCATATTTAGCATTCCCGTCAATAA 1405
Query 1142 CGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACA 1215
|||||||.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||.|| ||||||||..|.|||||.|||.|.
Sbjct 1406 CGTCCTCCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCG 1476
Query 1216 TACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTA 1289
|||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|.||||..|||||.|||||..||||||||||
Sbjct 1477 TACTCCATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTA 1550
Query 1290 TTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTT 1363
||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.|||||||||||..||||||
Sbjct 1551 TTGCTGCCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTT 1624
Query 1364 CTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTG 1437
|.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1625 CCGAGCTCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTG 1698
Query 1438 CTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTT 1511
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1699 CTCAGCCTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTT 1772
Query 1512 TCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAG 1585
.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1773 CCAAGCAAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGG 1846
Query 1586 CCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTG 1659
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1847 CCTCTGCAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTG 1920
Query 1660 AAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAA 1733
||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 AAACTCTTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAA 1994
Query 1734 TGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGG 1807
||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.|.||||||||.||
Sbjct 1995 TGAGTTCCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGG 2068
Query 1808 TCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATG 1881
|.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 TGTCTAGCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATG 2142
Query 1882 GCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGT 1955
||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||.||||||
Sbjct 2143 GCCTACCTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGT 2216
Query 1956 GGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACG 2029
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.||||
Sbjct 2217 GGTGAAAATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACG 2290
Query 2030 CTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCC 2103
|.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 2291 CCATCCCTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCC 2364
Query 2104 TATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCAT 2177
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2365 TATGGTGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCAT 2438
Query 2178 TTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTC 2251
||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 2439 TTACTATGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCC 2512
Query 2252 TATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAG 2325
|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||
Sbjct 2513 TGTGTTGGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAG 2586
Query 2326 AGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC 2349
||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 2587 AGAGCAGAGGGAACGGTGGGTGTC 2610