Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06606
- Subject:
- NM_001166281.2
- Aligned Length:
- 2349
- Identities:
- 2318
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
Query 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
Query 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
Query 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
Query 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
Query 371 CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAAGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAGGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
Query 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
Query 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
Query 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAGGAAGAAAGTGAACCCGAACAAGATACTAAAGTTTTTGCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAG------------------------------GTTTTTGCC 636
Query 667 AGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 AGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGG 710
Query 741 CATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 CATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGA 784
Query 815 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 858
Query 889 AAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGGAGAGAGTACTGCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 859 AAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGGAGAGAGTACTGCTT 932
Query 963 GGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 GGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGAT 1006
Query 1037 CCGAGATGCATTTGCTGTCCGTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 CCGAGATGCATTTGCTGTCCGTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCC 1080
Query 1111 AGACTGCCACATCTAGCATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 AGACTGCCACATCTAGCATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTC 1154
Query 1185 CTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 CTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAA 1228
Query 1259 TATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 TATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAA 1302
Query 1333 TCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 TCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCA 1376
Query 1407 GAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 GAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAG 1450
Query 1481 ACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451 ACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACT 1524
Query 1555 ATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 ATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCT 1598
Query 1629 CATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599 CATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGC 1672
Query 1703 TCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 TCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTC 1746
Query 1777 AGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747 AGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCT 1820
Query 1851 TTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821 TTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCA 1894
Query 1925 CCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895 CCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCA 1968
Query 1999 GCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 GCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAA 2042
Query 2073 CCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043 CCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGC 2116
Query 2147 CCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2117 CCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAAC 2190
Query 2221 TGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191 TGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAG 2264
Query 2295 TATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC 2349
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 TATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC 2319