Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06613
- Subject:
- XM_006513328.3
- Aligned Length:
- 3101
- Identities:
- 2607
- Gaps:
- 193
Alignment
Query 1 ATGCAGATGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCTGAAACGCTGGATCGGCTCCGAGACGGACCTCGA 74
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGATGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCTGAAGCGCTGGATCGGCTCCGAGACGGACCTCGA 74
Query 75 GCCTCCGGTGGTGAAGCGCCAGAAGACCAAGGTGAAGTTCGACGATGGCGCCGTCTTCCTGGCTGCTTGCTCCA 148
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 75 GCCGCCCGTGGTGAAGCGCCAGAAGACCAAGGTGAAGTTCGACGATGGCGCCGTCTTCCTCGCCGCCTGCTCCA 148
Query 149 GCGGCGACACGGACGAGGTCCTCAAGCTGCTGCACCGCGGCGCCGACATCAATTACGCCAATGTGGACGGACTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGGCGACACGGACGAGGTCCTCAAGCTGCTGCACCGCGGCGCCGACATCAATTACGCCAATGTGGACGGACTC 222
Query 223 ACTGCCCTGCACCAGGCTTGCATTGATGACAATGTTGATATGGTGAAGTTTCTGGTAGAAAATGGAGCAAATAT 296
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCGCCCTGCACCAGGCTTGCATTGATGACAATGTTGATATGGTGAAGTTTCTGGTAGAAAATGGAGCAAATAT 296
Query 297 TAATCAACCTGATAATGAAGGCTGGATACCACTACATGCAGCAGCTTCCTGTGGATATCTTGATATTGCAGAGT 370
.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CAATCAACCTGACAATGAAGGCTGGATACCACTCCATGCAGCTGCTTCCTGTGGATATCTCGATATTGCAGAGT 370
Query 371 TTTTGATTGGTCAAGGAGCACATGTAGGGGCTGTCAACAGTGAAGGAGATACACCTTTAGATATTGCGGAGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 TTTTGATTGGTCAAGGAGCACATGTAGGAGCTGTCAACAGTGAAGGAGACACACCTTTAGATATTGCAGAGGAG 444
Query 445 GAGGCAATGGAAGAGCTACTTCAAAATGAAGTTAATCGGCAAGGGGTTGATATAGAAGCAGCTCGAAAGGAAGA 518
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 445 GAGGCGATGGAAGAGCTACTTCAAAATGAGGTTAATCGGCAAGGTGTTGATATAGAAGCGGCTCGGAAAGAGGA 518
Query 519 AGAACGGATCATGCTTAGAGATGCCAGGCAGTGGCTAAATAGTGGTCATATAAATGATGTCCGGCATGCAAAAT 592
.||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||||||.||||.||.||.||.||.|.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 GGAGCGGGTAATGCTAAGAGACGCGAGGCAGTGGTTAAACAGCGGCCACATCAGTGACGTCCGGCATGCAAAGT 592
Query 593 CTGGAGGTACAGCACTTCACGTTGCAGCTGCTAAAGGCTATACGGAAGTTTTAAAACTTTTAATACAGGCAGGC 666
|.||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCGGGGGCACAGCACTCCACGTGGCGGCCGCCAAAGGCTATACAGAAGTGTTAAAACTTTTAATACAGGCAGGC 666
Query 667 TATGATGTTAATATTAAAGACTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGC 740
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGATGTTAATATTAAAGATTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGC 740
Query 741 ATGTCGAATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGATGGTCAACAAAGTGGGCCAAACAGCCTTTGATGTAG 814
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATGTCGGATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGACGGTCAACAAAGTGGGCCAAACAGCCTTTGATGTAG 814
Query 815 CAGATGAAGACATTTTAGGATATTTAGAAGAGTTGCAAAAGAAACAAAATCTGCTCCATAGTGAAAAACGGGAC 888
||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 815 CAGATGAAGACATTTTGGGATATCTAGAAGAGTTGCAAAAAAAACAAACTCTGCTCCATAGTGAGAAGCGGGAT 888
Query 889 AAGAAATCTCCACTAATTGAATCAACAGCAAATATGGACAATAATCAGTCACAGAAGACCTTTAAAAACAAAGA 962
||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||..||||||||.|.|||||||||||.||
Sbjct 889 AAGAAATCTCCACTGATCGAGTCCACAGCAAATATGGAAAACAATCAACCACAGAAGGCTTTTAAAAACAAGGA 962
Query 963 GACGTTGATTATTGAACCAGAGAAAAATGCATCCCGTATTGAATCTCTGGAACAAGAAAAGGTTGATGAAGAAG 1036
.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||.||||||.||.|
Sbjct 963 AACGTTGATTATTGAGCCAGAGAAAAATGCATCTCGCATCGAGTCTCTGGAGCATGAGAAGGCTGATGAGGAGG 1036
Query 1037 AAGAAGGAAAGAAGGATGAGTCTAGCTGCTCTAGTGAAGAAGATGAGGAAGATGACTCGGAATCAGAAGCTGAA 1110
|||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1037 AAGAAGGCAAGAAGGACGAGTCGAGCTGTTCCAGTGAGGAGGACGAGGAGGACGATTCAGAGTCAGAGGCAGAG 1110
Query 1111 ACAGATAAGACAAAACCCCTGGCTTCTGTAACTAATGCCAACACTTCTAGTACACAAGCAGCTCCTGTAGCTGT 1184
||||||||||||||.|||.||||||||||||..|||||..|.|||||.||.||.||.|||||.||||.||||||
Sbjct 1111 ACAGATAAGACAAAGCCCATGGCTTCTGTAAGCAATGCTCATACTTCCAGCACGCAGGCAGCCCCTGCAGCTGT 1184
Query 1185 TACAACACCTACTGTGTCATCAGGTCAAGCA----ACACCTACATCACCTATTAAAAAGTTTCCAACCACAGCT 1254
||||.||||||||.||||.|| |||.|| ||.||||||||||||.|||||||||||||||...|..||
Sbjct 1185 TACAGCACCTACTCTGTCTTC----CAACCAGGGGACCCCTACATCACCTGTTAAAAAGTTTCCAATATCGACT 1254
Query 1255 ACAAAAATTTCTCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGATGAGTCTCCTGCAACTTGGAGGTTAGGACTTAGAAAGAC 1328
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1255 ACAAAAATTTCTCCCAAAGAAGAGGAAAGAAAAGATGAGTCTCCTGCATCCTGGAGGTTAGGGCTTCGAAAGAC 1328
Query 1329 GGGCAGCTATGGTGCACTTGCTGAAATCACAGCATCTAAAGAGGGTCAGAAAGAAAAAGATACTGCAGGTGTTA 1402
.|||||.||.|||||.||.||||||||||..||.||||||||.|..|||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1329 TGGCAGTTACGGTGCCCTGGCTGAAATCAGTGCGTCTAAAGAAGCCCAGAAGGAGAAAGACACTGCAGGGGTGA 1402
Query 1403 CACGTTCAGCTTCAAGTCCCAGACTTTCCTCCTCTTTGGATAATAAAGAAAAGGAGAAAGATAGTAAAGGAACT 1476
..||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.
Sbjct 1403 TGCGGTCGGCTTCCAGTCCGAGACTCTCGTCCTCTTTGGATAATAAAGAAAAGGAGAAAGATAACAAAGGAACG 1476
Query 1477 AGGCTTGCATATGTTGCACCTACAATACCAAGACGACTAGCCAGTACATCTGACATTGAAGAGAAAGAAAACAG 1550
||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1477 AGACTTGCGTATGTCACCCCTACAATCCCGAGACGACTAGCCAGTACATCTGACATTGAAGAGAAGGAGAACAG 1550
Query 1551 AGATTCTTCAAGTTTGCGAACAAGTAGTTCATATACAAGGAGAAAATGGGAAGATGATCTTAAAAAAAATAGCT 1624
|||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1551 AGAGTCTTCAAGTTTGCGAACAAGTAGTTCTTACACAAGAAGAAAATGGGAAGATGATCTTAAAAAGAATAGTT 1624
Query 1625 CAGTTAATGAAGGATCAACGTATCATAAAAGTTGCTCCTTTGGTAGAAGACAAGATGATTTGATTAGTTCTAGT 1698
|..|.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1625 CGATCAATGAAGGATCCACTTACCAT------------------------------------------------ 1650
Query 1699 GTTCCAAGCACCACATCAACACCAACAGTTACCTCTGCAGCTGGGCTTCAGAAAAGCCTGCTTTCCAGCACAAG 1772
Sbjct 1651 -------------------------------------------------------------------------- 1650
Query 1773 CACTACTACAAAGATTACAACGGGTTCTTCCTCAGCAGGCACACAAAGCAGTACCTCAAATCGTTTGTGGGCTG 1846
||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651 ----------------------------------------------AGAAGTACCTCAAATCGTTTGTGGGCTG 1678
Query 1847 AGGATAGTACTGAGAAAGAAAAGGACAGTGTTCCTACGGCAGTGACCATTCCTGTTGCTCCAACTGTTGTAAAT 1920
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1679 AGGATAGTACTGAGAAAGAAAAGGACAGTGCTCCTACTGCAGTGACCATTCCTGTGGCTCCAACTGTTGTAAAT 1752
Query 1921 GCTGCAG---CTTCTACCACAACCCTGACTACAACTACTGCTGGCACTGTCTCCTCCACAACAGAGGTCAGGGA 1991
||||||| ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||| |||||||||||
Sbjct 1753 GCTGCAGCTCCTTCCACCACCACCCTGACTACAACTACTGCTGGCACTGTTTCC---------GAGGTCAGGGA 1817
Query 1992 GAGACGCAGATCATACCTCACTCCTGTTAGGGATGAAGAGTCTGAATCCCAAAGAAAAGCAAGATCTAGACAAG 2065
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818 GAGACGCAGGTCATACCTCACTCCTGTTAGGGACGAAGAGTCTGAATCCCAAAGAAAAGCAAGATCTAGACAAG 1891
Query 2066 CAAGACAATCTAGAAGATCAACACAGGGAGTGACATTAACTGATCTTCAAGAAGCTGAGAAAACAATAGGAAGA 2139
|||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1892 CAAGACAGTCTAGACGGTCAACACAGGGGGTAACACTGACTGATCTTCAGGAAGCTGAAAAAACAATAGGAAGA 1965
Query 2140 AGTCGTTCTACCCGAACCAGAGAACAAGAAAATGAAGAAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGAGAAACAAGATAAAGA 2213
|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1966 AGTCGTTCTACGAGAACCAGAGAACAAGAAAATGAAGAGAAAGAAAAAGAAGAAAAGGAAAAGCAGGATAAAGA 2039
Query 2214 GAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGTCAGAAACATCTAGAGAAGATGAATATAAACAAAAGTACTCCAGAACGTATG 2287
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 2040 GAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGTCAGAAGCATCTAGAGAAGATGAATATAAACAAAAGTATTCAAGAACATACG 2113
Query 2288 ATGAGACTTAC-CAGCGTTATAGGCCAGTATCAACTTCAAGTTCAACCACTC---CATCCTCTTCACTTTCTAC 2357
||||||||||| || ||||||||.||.||.||||||||||||||||.|.||| |.||.||.|||||.|||||
Sbjct 2114 ATGAGACTTACACA-CGTTATAGACCTGTGTCAACTTCAAGTTCAAGCGCTCCGTCGTCGTCCTCACTCTCTAC 2186
Query 2358 TATGAGCAGTTCACTGTATGCTTCAAGTCAACTAAACAGGCCAAATAGTCTTGTAGGCATAACTTCTGCTTACT 2431
|.|..||||..||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2187 TCTAGGCAGCACACTCTATGCCTCAAGTCAGCTCAACAGGCCAAACAGTCTTGTAGGTATAACCTCTGCCTACT 2260
Query 2432 CCAGAGGAATAACAAAAGAAAATGAAAGAGAGGGAGAAAAAAGAGAAGAGGAGAAAGAAGGAGAAGATAAATCA 2505
||.|.|||.||.|.||||||||.||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2261 CCCGGGGATTAGCCAAAGAAAACGAGAGAGAGGGAGAGAAAAAAGAAGAGGAGAAAGAAGGGGAAGATAAGTCA 2334
Query 2506 CAACCTAAATCAATCAGAGAACGACGACGACCAAGAGAGAAAAGAAGATCTACAGGAGTTTCATTTTGGACACA 2579
||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||..||.|.|||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 2335 CAGCCTAAGTCAATCAGAGAACGACGGCGACCCAGAGAAAAGCGACGGTCTACTGGAGTCTCCTTCTGGACACA 2408
Query 2580 AGATAGTGATGAAAATGAACAAGAACAACAATCAGACACAGAAGAGGGATCCAATAAGAAAGAAACTCAGACGG 2653
||||||||||||||||||.|||||.|..|||||.|||||.||.||.||.||||..||||.|||.||.|||||||
Sbjct 2409 AGATAGTGATGAAAATGAGCAAGAGCGGCAATCGGACACTGAGGACGGCTCCAGCAAGAGAGAGACGCAGACGG 2482
Query 2654 ATTCCATTTCTAGATATGAAACCAGTTCTACATCAGCTGGTGATCGATATGATTCCTTGCTGGGTCGCTCTGGA 2727
||||..||||.||.|||||.|.||||||.||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 2483 ATTCTGTTTCCAGGTATGACAGCAGTTCCACATCATCAAGTGATCGGTATGATTCCTTGCTGGGTCGCTCTGCT 2556
Query 2728 TCATACAGTTACTTAGAAGAAAGAAAACCTTACAGCAGCAGGCTAGAAAAGGATGACTCAACTGACTTTAAAAA 2801
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2557 TCATACAGTTACTTAGAAGACAGAAAACCTTACAGTAGCAGGCTAGAAAAGGATGACTCAACTGACTTCAAAAA 2630
Query 2802 GCTTTATGAACAAATTCTAGCTGAAAATGAAAAGCTGAAGGCACAGCTACATGATACAAATATGGAACTAACAG 2875
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2631 GCTTTATGAACAAATTTTAGCTGAAAATGAAAAGCTAAAAGCACAGCTACATGATACAAATATGGAACTAACGG 2704
Query 2876 ATCTTAAATTACAGTTGGAAAAGGCCACCCAGAGACAAGAAAGATTTGCTGATAGATCACTGTTGGAAATGGAA 2949
||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.||||..|||||.||||||
Sbjct 2705 ATCTAAAGTTGCAGTTGGAAAAGGCTACCCAGAGACAAGAACGATTTGCTGACAGGTCACAATTGGAGATGGAA 2778
Query 2950 AAAAGGGAACGAAGAGCTCTAGAAAGAAGAATATCTGAAATGGAAGAAGAGCTCAAAATGTTACCAGACCTAAA 3023
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2779 AAAAGGGAACGAAGAGCTCTAGAAAGAAGAATATCTGAAATGGAAGAAGAGCTCAAAATGTTACCAGACTTAAA 2852
Query 3024 AGCAGACAACCAGAGGCTAAAGGATGAAAATGGGGCCTTGATCAGAGTTATAAGCAAACTTTCCAAA 3090
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2853 GGCAGACAACCAGAGGCTAAAGGATGAAAATGGAGCCTTGATCAGAGTTATAAGCAAACTTTCCAAG 2919