Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06613
- Subject:
- XM_006513329.3
- Aligned Length:
- 3098
- Identities:
- 2599
- Gaps:
- 190
Alignment
Query 1 ATGCAGATGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCTGAAACGCTGGATCGGCTCCGAGACGGACCTCGA 74
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGATGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCTGAAGCGCTGGATCGGCTCCGAGACGGACCTCGA 74
Query 75 GCCTCCGGTGGTGAAGCGCCAGAAGACCAAGGTGAAGTTCGACGATGGCGCCGTCTTCCTGGCTGCTTGCTCCA 148
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 75 GCCGCCCGTGGTGAAGCGCCAGAAGACCAAGGTGAAGTTCGACGATGGCGCCGTCTTCCTCGCCGCCTGCTCCA 148
Query 149 GCGGCGACACGGACGAGGTCCTCAAGCTGCTGCACCGCGGCGCCGACATCAATTACGCCAATGTGGACGGACTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGGCGACACGGACGAGGTCCTCAAGCTGCTGCACCGCGGCGCCGACATCAATTACGCCAATGTGGACGGACTC 222
Query 223 ACTGCCCTGCACCAGGCTTGCATTGATGACAATGTTGATATGGTGAAGTTTCTGGTAGAAAATGGAGCAAATAT 296
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCGCCCTGCACCAGGCTTGCATTGATGACAATGTTGATATGGTGAAGTTTCTGGTAGAAAATGGAGCAAATAT 296
Query 297 TAATCAACCTGATAATGAAGGCTGGATACCACTACATGCAGCAGCTTCCTGTGGATATCTTGATATTGCAGAGT 370
.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CAATCAACCTGACAATGAAGGCTGGATACCACTCCATGCAGCTGCTTCCTGTGGATATCTCGATATTGCAGAGT 370
Query 371 TTTTGATTGGTCAAGGAGCACATGTAGGGGCTGTCAACAGTGAAGGAGATACACCTTTAGATATTGCGGAGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 TTTTGATTGGTCAAGGAGCACATGTAGGAGCTGTCAACAGTGAAGGAGACACACCTTTAGATATTGCAGAGGAG 444
Query 445 GAGGCAATGGAAGAGCTACTTCAAAATGAAGTTAATCGGCAAGGGGTTGATATAGAAGCAGCTCGAAAGGAAGA 518
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 445 GAGGCGATGGAAGAGCTACTTCAAAATGAGGTTAATCGGCAAGGTGTTGATATAGAAGCGGCTCGGAAAGAGGA 518
Query 519 AGAACGGATCATGCTTAGAGATGCCAGGCAGTGGCTAAATAGTGGTCATATAAATGATGTCCGGCATGCAAAAT 592
.||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||||||.||||.||.||.||.||.|.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 GGAGCGGGTAATGCTAAGAGACGCGAGGCAGTGGTTAAACAGCGGCCACATCAGTGACGTCCGGCATGCAAAGT 592
Query 593 CTGGAGGTACAGCACTTCACGTTGCAGCTGCTAAAGGCTATACGGAAGTTTTAAAACTTTTAATACAGGCAGGC 666
|.||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCGGGGGCACAGCACTCCACGTGGCGGCCGCCAAAGGCTATACAGAAGTGTTAAAACTTTTAATACAGGCAGGC 666
Query 667 TATGATGTTAATATTAAAGACTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGC 740
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGATGTTAATATTAAAGATTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGC 740
Query 741 ATGTCGAATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGATGGTCAACAAAGTGGGCCAAACAGCCTTTGATGTAG 814
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATGTCGGATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGACGGTCAACAAAGTGGGCCAAACAGCCTTTGATGTAG 814
Query 815 CAGATGAAGACATTTTAGGATATTTAGAAGAGTTGCAAAAGAAACAAAATCTGCTCCATAGTGAAAAACGGGAC 888
||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 815 CAGATGAAGACATTTTGGGATATCTAGAAGAGTTGCAAAAAAAACAAACTCTGCTCCATAGTGAGAAGCGGGAT 888
Query 889 AAGAAATCTCCACTAATTGAATCAACAGCAAATATGGACAATAATCAGTCACAGAAGACCTTTAAAAACAAAGA 962
||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||..||||||||.|.|||||||||||.||
Sbjct 889 AAGAAATCTCCACTGATCGAGTCCACAGCAAATATGGAAAACAATCAACCACAGAAGGCTTTTAAAAACAAGGA 962
Query 963 GACGTTGATTATTGAACCAGAGAAAAATGCATCCCGTATTGAATCTCTGGAACAAGAAAAGGTTGATGAAGAAG 1036
.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||.||||||.||.|
Sbjct 963 AACGTTGATTATTGAGCCAGAGAAAAATGCATCTCGCATCGAGTCTCTGGAGCATGAGAAGGCTGATGAGGAGG 1036
Query 1037 AAGAAGGAAAGAAGGATGAGTCTAGCTGCTCTAGTGAAGAAGATGAGGAAGATGACTCGGAATCAGAAGCTGAA 1110
|||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1037 AAGAAGGCAAGAAGGACGAGTCGAGCTGTTCCAGTGAGGAGGACGAGGAGGACGATTCAGAGTCAGAGGCAGAG 1110
Query 1111 ACAGATAAGACAAAACCCCTGGCTTCTGTAACTAATGCCAACACTTCTAGTACACAAGCAGCTCCTGTAGCTGT 1184
||||||||||||||.|||.||||||||||||..|||||..|.|||||.||.||.||.|||||.||||.||||||
Sbjct 1111 ACAGATAAGACAAAGCCCATGGCTTCTGTAAGCAATGCTCATACTTCCAGCACGCAGGCAGCCCCTGCAGCTGT 1184
Query 1185 TACAACACCTACTGTGTCATCAGGTCAAGCA----ACACCTACATCACCTATTAAAAAGTTTCCAACCACAGCT 1254
||||.||||||||.||||.|| |||.|| ||.||||||||||||.|||||||||||||||...|..||
Sbjct 1185 TACAGCACCTACTCTGTCTTC----CAACCAGGGGACCCCTACATCACCTGTTAAAAAGTTTCCAATATCGACT 1254
Query 1255 ACAAAAATTTCTCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGATGAGTCTCCTGCAACTTGGAGGTTAGGACTTAGAAAGAC 1328
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1255 ACAAAAATTTCTCCCAAAGAAGAGGAAAGAAAAGATGAGTCTCCTGCATCCTGGAGGTTAGGGCTTCGAAAGAC 1328
Query 1329 GGGCAGCTATGGTGCACTTGCTGAAATCACAGCATCTAAAGAGGGTCAGAAAGAAAAAGATACTGCAGGTGTTA 1402
.|||||.||.|||||.||.||||||||||..||.||||||||.|..|||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1329 TGGCAGTTACGGTGCCCTGGCTGAAATCAGTGCGTCTAAAGAAGCCCAGAAGGAGAAAGACACTGCAGGGGTGA 1402
Query 1403 CACGTTCAGCTTCAAGTCCCAGACTTTCCTCCTCTTTGGATAATAAAGAAAAGGAGAAAGATAGTAAAGGAACT 1476
..||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.
Sbjct 1403 TGCGGTCGGCTTCCAGTCCGAGACTCTCGTCCTCTTTGGATAATAAAGAAAAGGAGAAAGATAACAAAGGAACG 1476
Query 1477 AGGCTTGCATATGTTGCACCTACAATACCAAGACGACTAGCCAGTACATCTGACATTGAAGAGAAAGAAAACAG 1550
||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1477 AGACTTGCGTATGTCACCCCTACAATCCCGAGACGACTAGCCAGTACATCTGACATTGAAGAGAAGGAGAACAG 1550
Query 1551 AGATTCTTCAAGTTTGCGAACAAGTAGTTCATATACAAGGAGAAAATGGGAAGATGATCTTAAAAAAAATAGCT 1624
|||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1551 AGAGTCTTCAAGTTTGCGAACAAGTAGTTCTTACACAAGAAGAAAATGGGAAGATGATCTTAAAAAGAATAGTT 1624
Query 1625 CAGTTAATGAAGGATCAACGTATCATAAAAGTTGCTCCTTTGGTAGAAGACAAGATGATTTGATTAGTTCTAGT 1698
|..|.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1625 CGATCAATGAAGGATCCACTTACCATAGAAGTTGCTCCTTTGGTAGAAGACAAGATGATTTGATTAGTTGTAGT 1698
Query 1699 GTTCCAAGCACCACATCAACACCAACAGTTACCTCTGCAGCTGGGCTTCAGAAAAGCCTGCTTTCCAGCACAAG 1772
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1699 GTTCCAAGCACCACATCAACACCAACAGTTACCTCTGCAGCGGGGCTTCAGAGAAGCCTCCCTTCCAGCACAAG 1772
Query 1773 CACTACTACAAAGATTACAACGGGTTCTTCCTCAGCAGGCACACAAAGCAGTACCTCAAATCGTTTGTGGGCTG 1846
||||.||.||||||.|.|..|||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1773 CACTGCTGCAAAGACTCCCCCGGGTTCCTCCTCCGCAGGCACACAGA--------------------------- 1819
Query 1847 AGGATAGTACTGAGAAAGAAAAGGACAGTGTTCCTACGGCAGTGACCATTCCTGTTGCTCCAACTGTTGTAAAT 1920
Sbjct 1820 -------------------------------------------------------------------------- 1819
Query 1921 GCTGCAGCTTCTACCACAACCCTGACTACAACTACTGCTGGCACTGTCTCCTCCACAACAGAGGTCAGGGAGAG 1994
Sbjct 1820 -------------------------------------------------------------------------- 1819
Query 1995 ACGCAGATCATACCTCACTCCTGTTAGGGATGAAGAGTCTGAATCCCAAAGAAAAGCAAGATCTAGACAAGCAA 2068
||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820 --GCAGGTCATACCTCACTCCTGTTAGGGACGAAGAGTCTGAATCCCAAAGAAAAGCAAGATCTAGACAAGCAA 1891
Query 2069 GACAATCTAGAAGATCAACACAGGGAGTGACATTAACTGATCTTCAAGAAGCTGAGAAAACAATAGGAAGAAGT 2142
||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1892 GACAGTCTAGACGGTCAACACAGGGGGTAACACTGACTGATCTTCAGGAAGCTGAAAAAACAATAGGAAGAAGT 1965
Query 2143 CGTTCTACCCGAACCAGAGAACAAGAAAATGAAGAAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGAGAAACAAGATAAAGAGAA 2216
||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1966 CGTTCTACGAGAACCAGAGAACAAGAAAATGAAGAGAAAGAAAAAGAAGAAAAGGAAAAGCAGGATAAAGAGAA 2039
Query 2217 ACAAGAAGAAAAGAAGGAGTCAGAAACATCTAGAGAAGATGAATATAAACAAAAGTACTCCAGAACGTATGATG 2290
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 2040 ACAAGAAGAAAAGAAGGAGTCAGAAGCATCTAGAGAAGATGAATATAAACAAAAGTATTCAAGAACATACGATG 2113
Query 2291 AGACTTAC-CAGCGTTATAGGCCAGTATCAACTTCAAGTTCAACCACTC---CATCCTCTTCACTTTCTACTAT 2360
|||||||| || ||||||||.||.||.||||||||||||||||.|.||| |.||.||.|||||.||||||.|
Sbjct 2114 AGACTTACACA-CGTTATAGACCTGTGTCAACTTCAAGTTCAAGCGCTCCGTCGTCGTCCTCACTCTCTACTCT 2186
Query 2361 GAGCAGTTCACTGTATGCTTCAAGTCAACTAAACAGGCCAAATAGTCTTGTAGGCATAACTTCTGCTTACTCCA 2434
..||||..||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||.
Sbjct 2187 AGGCAGCACACTCTATGCCTCAAGTCAGCTCAACAGGCCAAACAGTCTTGTAGGTATAACCTCTGCCTACTCCC 2260
Query 2435 GAGGAATAACAAAAGAAAATGAAAGAGAGGGAGAAAAAAGAGAAGAGGAGAAAGAAGGAGAAGATAAATCACAA 2508
|.|||.||.|.||||||||.||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2261 GGGGATTAGCCAAAGAAAACGAGAGAGAGGGAGAGAAAAAAGAAGAGGAGAAAGAAGGGGAAGATAAGTCACAG 2334
Query 2509 CCTAAATCAATCAGAGAACGACGACGACCAAGAGAGAAAAGAAGATCTACAGGAGTTTCATTTTGGACACAAGA 2582
|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||..||.|.|||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2335 CCTAAGTCAATCAGAGAACGACGGCGACCCAGAGAAAAGCGACGGTCTACTGGAGTCTCCTTCTGGACACAAGA 2408
Query 2583 TAGTGATGAAAATGAACAAGAACAACAATCAGACACAGAAGAGGGATCCAATAAGAAAGAAACTCAGACGGATT 2656
|||||||||||||||.|||||.|..|||||.|||||.||.||.||.||||..||||.|||.||.||||||||||
Sbjct 2409 TAGTGATGAAAATGAGCAAGAGCGGCAATCGGACACTGAGGACGGCTCCAGCAAGAGAGAGACGCAGACGGATT 2482
Query 2657 CCATTTCTAGATATGAAACCAGTTCTACATCAGCTGGTGATCGATATGATTCCTTGCTGGGTCGCTCTGGATCA 2730
|..||||.||.|||||.|.||||||.||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 2483 CTGTTTCCAGGTATGACAGCAGTTCCACATCATCAAGTGATCGGTATGATTCCTTGCTGGGTCGCTCTGCTTCA 2556
Query 2731 TACAGTTACTTAGAAGAAAGAAAACCTTACAGCAGCAGGCTAGAAAAGGATGACTCAACTGACTTTAAAAAGCT 2804
|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2557 TACAGTTACTTAGAAGACAGAAAACCTTACAGTAGCAGGCTAGAAAAGGATGACTCAACTGACTTCAAAAAGCT 2630
Query 2805 TTATGAACAAATTCTAGCTGAAAATGAAAAGCTGAAGGCACAGCTACATGATACAAATATGGAACTAACAGATC 2878
|||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2631 TTATGAACAAATTTTAGCTGAAAATGAAAAGCTAAAAGCACAGCTACATGATACAAATATGGAACTAACGGATC 2704
Query 2879 TTAAATTACAGTTGGAAAAGGCCACCCAGAGACAAGAAAGATTTGCTGATAGATCACTGTTGGAAATGGAAAAA 2952
|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.||||..|||||.|||||||||
Sbjct 2705 TAAAGTTGCAGTTGGAAAAGGCTACCCAGAGACAAGAACGATTTGCTGACAGGTCACAATTGGAGATGGAAAAA 2778
Query 2953 AGGGAACGAAGAGCTCTAGAAAGAAGAATATCTGAAATGGAAGAAGAGCTCAAAATGTTACCAGACCTAAAAGC 3026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct 2779 AGGGAACGAAGAGCTCTAGAAAGAAGAATATCTGAAATGGAAGAAGAGCTCAAAATGTTACCAGACTTAAAGGC 2852
Query 3027 AGACAACCAGAGGCTAAAGGATGAAAATGGGGCCTTGATCAGAGTTATAAGCAAACTTTCCAAA 3090
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2853 AGACAACCAGAGGCTAAAGGATGAAAATGGAGCCTTGATCAGAGTTATAAGCAAACTTTCCAAG 2916