Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06614
• Subject: XM_006513893.3
• Aligned Length: 1178
• Identities: 908
• Gaps: 199

Alignment

Query    1  ATGGCAGACATTGACAACAAAGAACAGTCTGAACTTGATCAAGATTTGGATGATGTTGAAGAAGTAGAAGAAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAAACTGGTGAAGAAACAAAACTCAAAGCACGTCAGCTAACTGTTCAGATGATGCAAAATCCTCAGATTCTTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGCCCTTCAAGAAAGACTTGATGGTCTGGTAGAAACACCAACAGGAT-----ACATTGAAAGCCTGCCTAGGG  217
                                                          ||     |||||||.|.|.||||||.||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGGCCGACATTGACAACTTGCCTAAGG  28

Query  218  TAGTTAAAAGACGAGTGAATGCTCTCAAAAACCTGCAAGTTAAATGTGCACAGATAGAAGCCAAATTCTATGAG  291
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  TAGTCAAAAGACGAGTGAATGCTCTCAAGAATCTTCAGGTTAAATGTGCACAGATAGAAGCCAAATTCTATGAG  102

Query  292  GAAGTTCATGATCTTGAAAGGAAGTATGCTGTTCTCTATCAGCCTCTATTTGATAAGCGATTTGAAATTATTAA  365
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  103  GAAGTTCATGATCTCGAGAGGAAGTATGCTGTTCTCTATCAGCCTTTATTTGATAAGCGATTTGAGATCATTAA  176

Query  366  TGCAATTTATGAACCTACGGAAGAAGAATGTGAATGGAAACCAGATGAAGAAGATGAGATTTCGGAGGAATTGA  439
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||..||||||||||..|||
Sbjct  177  TGCAATCTATGAACCTACAGAAGAAGAATGCGAGTGGAAACCAGATGAGGAGGATGAAGTTTCGGAGGAGCTGA  250

Query  440  AAGAAAAGGCCAAGATTGAAGATGAGAAAAAGGATGAAGAAAAAGAAGACCCCAAAGGAATTCCTGAATTTTGG  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  251  AAGAAAAGGCCAAGATTGAAGATGAGAAAAAGGATGAAGAAAAAGAAGACCCGAAAGGAATTCCTGAATTTTGG  324

Query  514  TTAACTGTTTTTAAGAATGTTGACTTGCTCAGTGATATGGTTCAGGAACACGATGAACCTATTCTGAAGCACTT  587
            ||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  TTGACAGTGTTTAAGAATGTTGACTTGCTCAGTGACATGGTTCAGGAACATGATGAACCTATTCTGAAGCACTT  398

Query  588  GAAAGATATTAAAGTGAAGTTCTCAGATGCTGGCCAGCCTATGAGTTTTGTCTTAGAATTTCACTTTGAACCCA  661
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  GAAAGATATTAAAGTGAAGTTTTCGGATGCTGGCCAGCCTATGAGTTTTGTCTTAGAATTTCACTTTGAACCCA  472

Query  662  ATGAATATTTTACAAATGAAGTGCTGACAAAGACATACAGGATGAGGTCAGAACCAGATGATTCTGATCCCTTT  735
            ||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  473  ATGACTATTTCACAAATGAAGTGTTAACAAAGACTTACAGGATGCGGTCAGAGCCAGATGATTCTGACCCCTTT  546

Query  736  TCTTTTGATGGACCAGAAATTATGGGTTGTACAGGGTGCCAGATAGATTGGAAAAAAGGAAAGAATGTCACTTT  809
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  547  TCTTTTGACGGACCAGAGATTATGGGCTGTACAGGGTGCCAGATAGATTGGAAAAAAGGAAAGAATGTTACTTT  620

Query  810  GAAAACTATTAAGAAGAAGCAGAAACACAAGGGACGTGGGACAGTTCGTACTGTGACTAAAACAGTTTCCAATG  883
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  GAAAACCATTAAGAAGAAGCAGAAACACAAGGGGCGTGGGACAGTTCGTACTGTGACTAAAACAGTTTCCAATG  694

Query  884  ACTCTTTCTTTAACTTTTTTGCCCCTCCTGAAGTTCCTGAGAGTGGAGATCTGGATGATGATGCTGAAGCTATC  957
            |.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  695  ATTCTTTCTTTAATTTTTTTGCTCCTCCTGAAGTTCCTGAGAATGGCGATCTGGATGATGATGCTGAGGCGATA  768

Query  958  CTTGCTGCAGACTTCGAAATTGGTCACTTTTTACGTGAGCGTATAATCCCAAGATCAGTGTTATATTTTACTGG  1031
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||.||.|||||
Sbjct  769  CTGGCTGCAGACTTTGAAATTGGTCACTTTTTACGTGAGCGCATAATCCCAAGATCAGTGCTGTACTTCACTGG  842

Query 1032  AGAAGCTATTGAAGATGATGATGATGATTATGATGAAGAAGGTGAAGAAGCGGATGAGGAAGGGGAAGAAGAAG  1105
            |||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  843  AGAGGCTATCGAGGACGATGACGATGATTATGATGAAGAAGGTGAAGAAGCTGACGAGGAAGGGGAAGAAGAAG  916

Query 1106  GAGATGAGGAAAATGATCCAGACTATGACCCAAAGAAGGATCAAAACCCAGCAGAGTGCAAGCAGCAG  1173
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  917  GAGATGAGGAAAACGATCCAGACTATGACCCAAAGAAGGATCAGAACCCAGCCGAGTGCAAGCAGCAG  984