Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06631
• Subject: NM_001037906.2
• Aligned Length: 2430
• Identities: 2135
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCGATGGATTTGATTTTAGTTGTGTGGTTCTGTGTGTGCACTGCCAGGACAGTGGTGGGCTTTGGGATGGA  74
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGATGGATGTGATTTTAGTTTTGTGGTTCTGTGTGTGCACCGCCAGGACAGTGCTGGGCTTTGGGATGGA  74

Query   75  CCCTGACCTTCAGATGGATATCGTCACCGAGCTTGACCTTGTGAACACCACCCTTGGAGTTGCTCAGGTGTCTG  148
            ||||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||..||||||||.|||
Sbjct   75  CCCTGACCTTCAGATGGACATCATCACTGAACTTGACCTTGTGAACACCACCCTGGGCGTCACTCAGGTGGCTG  148

Query  149  GAATGCACAATGCCAGCAAAGCATTTTTATTTCAAGACATAGAAAGAGAGATCCATGCAGCTCCTCATGTGAGT  222
            ||.|.|||||||||||.||.||||||.|.||||||||..||.|.|||||||||||..||||.||||||||||||
Sbjct  149  GACTACACAATGCCAGTAAGGCATTTCTGTTTCAAGATGTACAGAGAGAGATCCACTCAGCCCCTCATGTGAGT  222

Query  223  GAGAAATTAATTCAGCTGTTCCAGAACAAGAGTGAATTCACCATTTTGGCCACTGTACAGCAGAAGCCATCCAC  296
            |||||..|.||.|||||.||||.|||.||||||||.||.|||.|||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  223  GAGAAGCTGATCCAGCTATTCCGGAATAAGAGTGAGTTTACCTTTTTGGCTACAGTGCAGCAGAAGCCGTCCAC  296

Query  297  TTCAGGAGTGATACTGTCCATTCGAGAACTGGAGCACAGCTATTTTGAACTGGAGAGCAGTGGCCTGAGGGATG  370
            .|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||.||.|
Sbjct  297  CTCAGGGGTGATACTGTCGATCCGGGAGCTGGAACACAGCTATTTTGAACTGGAGAGCAGTGGCCCAAGAGAAG  370

Query  371  AGATTCGGTATCACTACATACACAATGGGAAGCCAAGGACAGAGGCACTTCCTTACCGCATGGCAGATGGACAA  444
            ||||.||.|||||.|||||.||....||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  AGATACGCTATCATTACATCCATGGCGGCAAGCCCAGGACTGAGGCCCTTCCCTACCGCATGGCCGATGGACAG  444

Query  445  TGGCACAAGGTTGCACTGTCAGTTAGCGCCTCTCATCTCCTGCTCCATGTCGACTGTAACAGGATTTATGAGCG  518
            |||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  TGGCACAAGGTCGCGCTGTCTGTGAGCGCCTCTCACCTCCTACTCCATGTCGACTGCAATAGGATTTATGAGCG  518

Query  519  TGTGATAGACCCTCCAGATACCAACCTTCCCCCAGGAATCAATTTATGGCTTGGCCAGCGCAACCAAAAGCATG  592
            |||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||.||||.||||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct  519  TGTGATAGATCCTCCGGAGACCAACCTTCCTCCAGGAAGCAATCTATGGCTTGGGCAACGTAATCAAAAGCATG  592

Query  593  GCTTATTCAAAGGGATCATCCAAGATGGGAAGATCATCTTTATGCCGAATGGATATATAACACAGTGTCCAAAT  666
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|..||.||||||||.||.||.
Sbjct  593  GCTTTTTCAAAGGAATCATCCAAGATGGCAAGATCATCTTCATGCCGAACGGCTTCATCACACAGTGCCCCAAC  666

Query  667  CTAAATCACACTTGCCCAACCTGCAGTGATTTCTTAAGCCTGGTGCAAGGAATAATGGATTTACAAGAGCTTTT  740
            |||||||.||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CTAAATCGCACTTGCCCAACATGCAGTGATTTCCTGAGCCTGGTTCAAGGAATAATGGATTTGCAAGAGCTTTT  740

Query  741  GGCCAAGATGACTGCAAAACTAAATTATGCAGAGACAAGACTTAGTCAATTGGAAAACTGTCATTGTGAGAAGA  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  741  GGCCAAGATGACTGCAAAACTGAATTATGCAGAGACGAGACTTGGTCAACTGGAAAATTGCCACTGTGAGAAGA  814

Query  815  CTTGTCAAGTGAGTGGACTGCTCTATCGAGATCAAGACTCTTGGGTAGATGGTGACCATTGCAGGAACTGCACT  888
            |.||.|||||||||||.||||||||..|.||.||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct  815  CCTGCCAAGTGAGTGGGCTGCTCTACAGGGACCAAGACTCCTGGGTAGATGGTGACAACTGCAGGAACTGCACA  888

Query  889  TGCAAAAGTGGTGCCGTGGAATGCCGAAGGATGTCCTGTCCCCCTCTCAATTGCTCCCCAGACTCCCTCCCAGT  962
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct  889  TGCAAAAGTGGTGCTGTGGAGTGCCGAAGGATGTCCTGTCCCCCACTCAACTGTTCCCCAGACTCACTTCCTGT  962

Query  963  GCACATTGCTGGCCAGTGCTGTAAGGTCTGCCGACCAAAATGTATCTATGGAGGAAAAGTTCTTGCAGAAGGCC  1036
            |||.|||.|||||||.||.|||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  963  GCATATTTCTGGCCAATGTTGTAAAGTTTGCAGACCAAAATGTATCTATGGAGGAAAAGTTCTTGCTGAGGGCC  1036

Query 1037  AGCGGATTTTAACCAAGAGCTGTCGGGAATGCCGAGGTGGAGTTTTAGTAAAAATTACAGAAATGTGTCCTCCT  1110
            ||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||...||.||||||
Sbjct 1037  AGCGGATTTTAACCAAGACCTGCCGGGAATGTCGAGGTGGAGTCTTGGTAAAAATCACAGAAGCTTGCCCTCCT  1110

Query 1111  TTGAACTGCTCAGAAAAGGATCACATTCTTCCTGAGAATCAGTGCTGCCGTGTCTGTAGAGGTCATAACTTTTG  1184
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||..|||||||||||||.||
Sbjct 1111  TTGAACTGCTCAGAGAAGGATCATATTCTTCCGGAGAACCAGTGCTGCAGGGTCTGCCGAGGTCATAACTTCTG  1184

Query 1185  TGCAGAAGGACCTAAATGTGGTGAAAACTCAGAGTGCAAAAACTGGAATACAAAAGCTACTTGTGAGTGCAAGA  1258
            ||||||||.||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCAGAAGCACCTAAGTGTGGAGAAAACTCGGAATGCAAAAATTGGAATACAAAAGCGACTTGTGAGTGCAAGA  1258

Query 1259  GTGGTTACATCTCTGTCCAGGGAGACTCTGCCTACTGTGAAGATATTGATGAGTGTGCAGCTAAGATGCATTAC  1332
            .|||.|||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1259  ATGGATACATCTCTGTCCAGGGCAACTCTGCATACTGTGAAGATATCGATGAGTGTGCAGCAAAGATGCACTAC  1332

Query 1333  TGTCATGCCAATACTGTGTGTGTCAACCTTCCTGGGTTATATCGCTGTGACTGTGTCCCAGGATACATTCGTGT  1406
            |||||||||||.||.||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||
Sbjct 1333  TGTCATGCCAACACGGTGTGTGTCAACTTGCCGGGGTTATATCGCTGTGACTGCATCCCAGGATACATCCGTGT  1406

Query 1407  GGATGACTTCTCTTGTACAGAACACGATGAATGTGGCAGCGGCCAGCACAACTGTGATGAGAATGCCATCTGCA  1480
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.|||||||||||.|
Sbjct 1407  GGATGACTTCTCTTGTACGGAGCATGATGATTGTGGCAGCGGACAACACAACTGTGACAAAAATGCCATCTGTA  1480

Query 1481  CCAACACTGTCCAGGGACACAGCTGCACCTGCAAACCGGGCTACGTGGGGAACGGGACCATCTGCAGAGCTTTC  1554
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||.||.||.||..||||||.|||.|||
Sbjct 1481  CCAACACAGTCCAGGGACACAGCTGTACCTGCCAGCCAGGCTACGTGGGAAATGGTACTGTCTGCAAAGCATTC  1554

Query 1555  TGTGAAGAGGGCTGCAGATACGGTGGAACGTGTGTGGCTCCCAACAAATGTGTCTGTCCATCTGGATTCACAGG  1628
            |||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTGAAGAGGGTTGCAGATACGGAGGTACCTGTGTGGCCCCTAACAAATGTGTCTGTCCTTCTGGATTCACAGG  1628

Query 1629  AAGCCACTGCGAGAAAGATATTGATGAATGTTCAGAGGGAATCATTGAGTGCCACAACCATTCCCGCTGCGTTA  1702
            |||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1629  AAGCCACTGTGAGAAAGATATTGATGAATGTGCAGAGGGATTCGTTGAGTGCCACAACCACTCCCGCTGCGTTA  1702

Query 1703  ACCTGCCAGGGTGGTACCACTGTGAGTGCAGAAGCGGTTTCCATGACGATGGGACCTATTCACTGTCCGGGGAG  1776
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCTTCCAGGGTGGTACCACTGTGAGTGCAGAAGCGGTTTCCATGACGATGGGACCTATTCACTGTCCGGGGAG  1776

Query 1777  TCCTGTATTGACATTGATGAATGTGCCTTAAGAACTCACACCTGTTGGAACGATTCTGCCTGCATCAACCTGGC  1850
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||
Sbjct 1777  TCCTGCATTGATATTGATGAATGTGCCTTAAGAACTCACACTTGTTGGAATGACTCTGCCTGCATCAACTTAGC  1850

Query 1851  AGGGGGTTTTGACTGTCTCTGCCCCTCTGGGCCCTCCTGCTCTGGTGACTGTCCTCATGAAGGGGGGCTGAAGC  1924
            |||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGAGGATTTGACTGCCTGTGTCCCTCTGGGCCCTCCTGCTCTGGTGACTGTCCCCACGAAGGGGGGCTGAAGC  1924

Query 1925  ACAATGGCCAGGTGTGGACCTTGAAAGAAGACAGGTGTTCTGTCTGCTCCTGCAAGGATGGCAAGATATTCTGC  1998
            |.|||||.||||||||||...|||.|||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925  ATAATGGGCAGGTGTGGATTCTGAGAGAAGACAGGTGTTCAGTCTGTTCCTGTAAGGATGGGAAGATATTCTGC  1998

Query 1999  CGACGGACAGCTTGTGATTGCCAGAATCCAAGTGCTGACCTATTCTGTTGCCCAGAATGTGACACCAGAGTCAC  2072
            ||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1999  CGGCGGACAGCTTGTGATTGCCAGAATCCAAATGTTGACCTTTTCTGCTGCCCAGAGTGTGACACCAGGGTCAC  2072

Query 2073  AAGTCAATGTTTAGACCAAAATGGTCACAAGCTGTATCGAAGTGGAGACAATTGGACCCATAGCTGTCAGCAGT  2146
            .||.|||||||||||.||||..||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2073  TAGCCAATGTTTAGATCAAAGCGGACAGAAGCTCTATCGAAGTGGAGACAACTGGACCCACAGCTGCCAGCAGT  2146

Query 2147  GTCGGTGTCTGGAAGGAGAGGTAGATTGCTGGCCACTCACTTGCCCCAACTTGAGCTGTGAGTATACAGCTATC  2220
            |.||.||||||||||||||||.|||.||||||||.||..|||||||.|..|||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2147  GCCGATGTCTGGAAGGAGAGGCAGACTGCTGGCCTCTAGCTTGCCCTAGTTTGAGCTGTGAATACACAGCCATC  2220

Query 2221  TTAGAAGGGGAATGTTGTCCCCGCTGTGTCAGTGACCCCTGCCTAGCTGATAACATCACCTATGACATCAGAAA  2294
            ||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTTGAAGGAGAGTGTTGTCCCCGCTGTGTCAGTGACCCCTGCCTGGCTGATAATATTGCCTATGACATCAGAAA  2294

Query 2295  AACTTGCCTGGACAGCTATGGTGTTTCACGGCTTAGTGGCTCAGTGTGGACGATGGCTGGATCTCCCTGCACAA  2368
            |||||||||||||||||.||||.||||..||||.||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2295  AACTTGCCTGGACAGCTCTGGTATTTCGAGGCTGAGCGGCGCAGTGTGGACAATGGCTGGATCTCCCTGTACAA  2368

Query 2369  CCTGTAAATGCAAGAATGGAAGAGTCTGTTGTTCTGTGGATTTTGAGTGTCTTCAAAATAAT  2430
            |||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.|.|||||||.|.|||||.
Sbjct 2369  CCTGTCAATGCAAGAATGGGAGAGTCTGCTGCTCTGTGGATCTGGTGTGTCTTGAGAATAAC  2430