Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06637
Subject:
NM_008689.2
Aligned Length:
990
Identities:
707
Gaps:
187

Alignment

Query   1  MAEDDPYLGRPEQMFHLDPSLTHTIFNPEVFQPQMALPTADGPYLQILEQPKQRGFRFRYVCEGPSHGGLPGAS  74
           ||.||||  ...|||||...|||.|||.|...|...|.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MADDDPY--GTGQMFHLNTALTHSIFNAELYSPEIPLST-DGPYLQILEQPKQRGFRFRYVCEGPSHGGLPGAS  71

Query  75  SEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGICTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKK  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  72  SEKNKKSYPQVKICNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGVCTVTAGPKDMVVGFANLGILHVTKK  145

Query 149  KVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQAEGGGDRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLP  222
           |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 146  KVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHSDLAYLQAEGGGDRQLTDREKEIIRQAAVQQTKEMDLSVVRLMFTAFLP  219

Query 223  DSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWE  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220  DSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSKAPNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWE  293

Query 297  GFGDFSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEVQRKRQKLMPN  370
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294  GFGDFSPTDVHRQFAIVFKTPKYKDVNITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEVQRKRQKLMPN  367

Query 371  FSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGSTGPGYSFPHYGFPTYGGITFHPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDP  444
           ||||||||||||||||||||||||||.|||.||||....||||.|||||||||.||||||..|||..|..|..|
Sbjct 368  FSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGSTGSPGPGYGYSNYGFPPYGGITFHPGVTKSNAGVTHGTINTKFKNGP  441

Query 445  EGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNG-----------EVTLTYATGTKEESAGVQDNLFLEKAM  507
           ..|.||||.....|             |...|.|.|           ...|......||...|.|||||||||.
Sbjct 442  KDCAKSDDEESLTL-------------PEKETEGEGPSLPMACTKTEPIALASTMEDKEQDMGFQDNLFLEKAL  502

Query 508  QLAKRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQDENGDSVLHLAIIHLHSQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRND  581
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503  QLARRHANALFDYAVTGDVKMLLAVQRHLTAVQDENGDSVLHLAIIHLHAQLVRDLLEVTSGLISDDIINMRND  576

Query 582  LYQTPLHLAVITKQEDVVEDLLRAGADLSLLDRLGNSVLHLAAKEGHDKVLSILLKHKKAALLLDHPNGDGLNA  655
           |||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||..||||||..|||.|.|||||.||||
Sbjct 577  LYQTPLHLAVITKQEDVVEDLLRVGADLSLLDRWGNSVLHLAAKEGHDRILSILLKSRKAAPLIDHPNGEGLNA  650

Query 656  IHLAMMSNSLPCLLLLVAAGADVNAQEQKSGRTALHLAVEHDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTYDGTTPLHIAAG  729
           ||.|.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651  IHIAVMSNSLPCLLLLVAAGAEVNAQEQKSGRTALHLAVEYDNISLAGCLLLEGDAHVDSTTYDGTTPLHIAAG  724

Query 730  RGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWENAGEDEGVVPGTTPLDMATSWQVFDILNGKPYEPEFTSDVF  803
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||.||||..
Sbjct 725  RGSTRLAALLKAAGADPLVENFEPLYDLDDSWEKAGEDEGVVPGTTPLDMAANWQVFDILNGKPYEPVFTSDDI  798

Query 804  LGLAE-RALTGWKVNSPLQL------------------------------------------------------  822
           |.... ..||   ....|||                                                      
Sbjct 799  LPQGDMKQLT---EDTRLQLCKLLEIPDPDKNWATLAQKLGLGILNNAFRLSPAPSKTLMDNYEVSGGTIKELM  869

Query 823  --------------------------------------------------------------------------  822
                                                                                     
Sbjct 870  EALQQMGYTEAIEVIQAAFRTPATTASSPVTTAQVHCLPLSSSSTRQHIDELRDSDSVCDSGVETSFRKLSFTE  943

Query 823  ----------------------------  822
                                       
Sbjct 944  SLTGDSPLLSLNKMPHGYGQEGPIEGKI  971