Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06637
• Subject: XM_006501106.2
• Aligned Length: 2869
• Identities: 2211
• Gaps: 275

Alignment

Query    1  ATGGCAGAAGATGATCCATATTTGGGAAGGCCTGAACAAATGTTTCATTTGGATCCTTCTTTGACTCATACAAT  74
            ||||||||.||||||||.||   .||||   |||..|||||||||||||||.|..||.||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGCAGACGATGATCCCTA---CGGAA---CTGGGCAAATGTTTCATTTGAACACTGCTTTGACTCACTCAAT  68

Query   75  ATTTAATCCAGAAGTAT-TTCAACCACAGATGGCACTGCCAACAGCAGATGGCCCATACCTTCAAATATTAGAG  147
            |||||||.|||||.||| ||| ||||.|.||..|||||.|||   |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  ATTTAATGCAGAATTATATTC-ACCAGAAATACCACTGTCAA---CAGATGGCCCATACCTTCAAATATTAGAG  138

Query  148  CAACCTAAACAGAGAGGATTTCGTTTCCGTTATGTATGTGAAGGCCCATCCCATGGTGGACTACCTGGTGCCTC  221
            |||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.|||||
Sbjct  139  CAACCAAAACAGAGGGGATTTCGATTCCGCTATGTGTGTGAAGGCCCATCACACGGAGGGCTTCCGGGAGCCTC  212

Query  222  TAGTGAAAAGAACAAGAAGTCTTACCCTCAGGTCAAAATCTGCAACTATGTGGGACCAGCAAAGGTTATTGTTC  295
            ||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  213  TAGTGAGAAGAACAAGAAATCCTACCCACAGGTCAAAATTTGCAACTATGTGGGGCCTGCAAAGGTTATCGTTC  286

Query  296  AGTTGGTCACAAATGGAAAAAATATCCACCTGCATGCCCACAGCCTGGTGGGAAAACACTGTGAGGATGGGATC  369
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|.
Sbjct  287  AGTTGGTCACAAATGGAAAAAACATCCACCTGCACGCCCACAGCCTGGTGGGCAAGCACTGTGAGGACGGGGTA  360

Query  370  TGCACTGTAACTGCTGGACCCAAGGACATGGTGGTCGGCTTCGCAAACCTGGGTATACTTCATGTGACAAAGAA  443
            |||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  361  TGCACCGTAACAGCAGGACCCAAGGACATGGTGGTTGGCTTTGCAAACCTGGGAATACTTCATGTGACTAAGAA  434

Query  444  AAAAGTATTTGAAACACTGGAAGCACGAATGACAGAGGCGTGTATAAGGGGCTATAATCCTGGACTCTTGGTGC  517
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct  435  AAAGGTATTTGAAACACTGGAAGCACGGATGACAGAGGCGTGTATTAGGGGCTATAATCCTGGACTTCTGGTGC  508

Query  518  ACCCTGACCTTGCCTATTTGCAAGCAGAAGGTGGAGGGGACCGGCAGCTGGGAGATCGGGAAAAAGAGCTAATC  591
            |..||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.||||||||.||...|||..|.||.||.|||.|.|||
Sbjct  509  ATTCTGACCTTGCCTATCTACAAGCAGAAGGCGGAGGAGACCGGCAACTCACAGACAGAGAGAAGGAGATCATC  582

Query  592  CGCCAAGCAGCTCTGCAGCAGACCAAGGAGATGGACCTCAGCGTGGTGCGGCTCATGTTTACAGCTTTTCTTCC  665
            |||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  583  CGCCAGGCAGCCGTGCAGCAGACCAAGGAGATGGACCTGAGCGTGGTGCGCCTCATGTTCACAGCCTTCCTCCC  656

Query  666  GGATAGCACTGGCAGCTTCACAAGGCGCCTGGAACCCGTGGTATCAGACGCCATCTATGACAGTAAAGCCCCCA  739
            .||.|||||||||||||||||..||.|.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  657  TGACAGCACTGGCAGCTTCACTCGGAGACTGGAGCCTGTGGTGTCAGACGCCATCTATGATAGCAAAGCCCCGA  730

Query  740  ATGCATCCAACTTGAAAATTGTAAGAATGGACAGGACAGCTGGATGTGTGACTGGAGGGGAGGAAATTTATCTT  813
            |||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  731  ATGCATCCAACCTGAAAATCGTGAGAATGGACAGAACAGCAGGATGTGTGACGGGAGGGGAGGAGATTTACCTT  804

Query  814  CTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATCCAGATTCGATTTTATGAAGAGGAAGAAAATGGTGGAGTCTGGGA  887
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  805  CTCTGTGACAAGGTTCAGAAAGATGACATCCAGATTCGGTTTTATGAAGAGGAAGAAAATGGCGGAGTTTGGGA  878

Query  888  AGGATTTGGAGATTTTTCCCCCACAGATGTTCATAGACAATTTGCCATTGTCTTCAAAACTCCAAAGTATAAAG  961
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  879  AGGATTTGGGGACTTTTCCCCCACAGATGTTCATAGACAGTTTGCCATTGTCTTCAAAACGCCAAAGTATAAGG  952

Query  962  ATATTAATATTACAAAACCAGCCTCTGTGTTTGTCCAGCTTCGGAGGAAATCTGACTTGGAAACTAGTGAACCA  1035
            ||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.
Sbjct  953  ATGTCAACATTACAAAGCCAGCTTCCGTGTTTGTTCAGCTTCGGAGGAAATCAGACCTGGAAACTAGTGAACCG  1026

Query 1036  AAACCTTTCCTCTACTATCCTGAAATCAAAGATAAAGAAGAAGTGCAGAGGAAACGTCAGAAGCTCATGCCCAA  1109
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1027  AAACCCTTTCTCTACTACCCTGAAATCAAAGACAAAGAGGAAGTGCAAAGGAAACGCCAGAAGCTTATGCCGAA  1100

Query 1110  TTTTTCGGATAGTTTCGGCGGTGGTAGTGGTGCCGGAGCTGGAGGCGGAGGCATGTTTGGTAGTGGCGGTGGAG  1183
            .||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1101  CTTCTCGGACAGCTTCGGTGGCGGCAGTGGAGCGGGAGCCGGTGGTGGAGGCATGTTCGGTAGTGGCGGTGGCG  1174

Query 1184  GAGGGGGCACTGGAAGTACAGGTCCAGGGTATAGCTTCCCACACTATGGATTTCCTACTTATGGTGGGATTACT  1257
            |||||.|.||.|||||..|.||.|||||||||.|||.|.|..||||.|||||||||.|.||.|||||||||||.
Sbjct 1175  GAGGGAGTACCGGAAGCCCTGGCCCAGGGTATGGCTACTCGAACTACGGATTTCCTCCCTACGGTGGGATTACA  1248

Query 1258  TTCCATCCTGGAACTACTAAATCTAATGCTGGGATGAAGCATGGAACCATGGACACTGAATCTAAAAAGGACCC  1331
            ||||||||.|||...||.|||||.||.||.|||.|.|..|||||.|||||..||||..|||.||||||.|.|||
Sbjct 1249  TTCCATCCCGGAGTCACGAAATCCAACGCAGGGGTCACCCATGGCACCATAAACACCAAATTTAAAAATGGCCC  1322

Query 1332  TGAAGGTTGTGACAAAAGTGATGACAAAAACACTGTAAACCTCTTTGGGAAAGTTATTGAAACCACAGAGCAAG  1405
            |.|||.|||||.|||.|||||||||.|..|.|.|.|.|..|||..||.|||.|..|.||            |||
Sbjct 1323  TAAAGATTGTGCCAAGAGTGATGACGAGGAGAGTCTGACTCTCCCTGAGAAGGAAACTG------------AAG  1384

Query 1406  ATCAGGAGCCCAGCGAGGCCACCGTTGG-------GAATGGTGAGGTCACTCTAAC------GTATGCAACA-G  1465
            .|.|.|.|||||||..|.|||    |||       .||    ||.|..|| |.|.|      |.||.||.|| |
Sbjct 1385  GTGAAGGGCCCAGCCTGCCCA----TGGCCTGCACCAA----GACGGAAC-CCATCGCCTTGGCATCCACCATG  1449

Query 1466  GAACAAAAGAAGAG-AG----TGCTGGAGTTCAGGATAACCTCTTTCTAGAGAAGGCTATGCAGCTTGCAAAGA  1534
            |||.|.|||  ||| ||    ||  |||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|.|.
Sbjct 1450  GAAGACAAG--GAGCAGGACATG--GGATTTCAGGATAACCTCTTTCTTGAGAAGGCTCTGCAGCTCGCCAGGC  1519

Query 1535  GGCATGCCAATGCCCTTTTCGACTACGCGGTGACAGGAGACGTGAAGATGCTGCTGGCCGTCCAGCGCCATCTC  1608
            |.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1520  GACACGCCAACGCCCTTTTCGACTACGCAGTGACGGGGGATGTGAAGATGTTGCTGGCCGTGCAACGCCATCTC  1593

Query 1609  ACTGCTGTGCAGGATGAGAATGGGGACAGTGTCTTACACTTAGCAATCATCCACCTTCATTCTCAACTTGTGAG  1682
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..||||.||||||||
Sbjct 1594  ACCGCCGTGCAGGATGAGAATGGGGACAGTGTCTTACACTTAGCCATCATCCACCTCCACGCTCAGCTTGTGAG  1667

Query 1683  GGATCTACTAGAAGTCACATCTGGTTTGATTTCTGATGACATTATCAACATGAGAAATGATCTGTACCAGACGC  1756
            ||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1668  GGATCTGCTGGAAGTCACATCTGGTTTGATCTCTGATGACATCATCAACATGAGAAATGACCTGTATCAGACAC  1741

Query 1757  CCTTGCACTTGGCAGTGATCACTAAGCAGGAAGATGTGGTGGAGGATTTGCTGAGGGCTGGGGCCGACCTGAGC  1830
            |..||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1742  CTCTGCACTTGGCCGTGATCACCAAGCAGGAAGATGTAGTAGAGGATTTGCTGAGGGTTGGGGCTGACCTGAGC  1815

Query 1831  CTTCTGGACCGCTTGGGTAACTCTGTTTTGCACCTAGCTGCCAAAGAAGGACATGATAAAGTTCTCAGTATCTT  1904
            |||||||||||||.|||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|.|.|.|||||.|||.|
Sbjct 1816  CTTCTGGACCGCTGGGGCAACTCTGTCCTGCACCTAGCTGCCAAAGAAGGACACGACAGAATCCTCAGCATCCT  1889

Query 1905  ACTCAAGCACAAAAAGGCAGCACTACTTCTTGACCACCCCAACGGGGACGGTCTGAATGCCATTCATCTAGCCA  1978
            .||||||..||.|||.|||||.|..|||.|.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||..||||..
Sbjct 1890  GCTCAAGAGCAGAAAAGCAGCGCCCCTTATCGACCACCCCAATGGGGAAGGTCTAAATGCCATCCACATAGCTG  1963

Query 1979  TGATGAGCAATAGCCTGCCATGTTTGCTGCTGCTGGTGGCCGCTGGGGCTGACGTCAATGCTCAGGAGCAGAAG  2052
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1964  TGATGAGCAATAGCCTGCCATGTCTGCTGCTGCTGGTGGCTGCCGGGGCAGAAGTCAATGCTCAGGAGCAGAAG  2037

Query 2053  TCCGGGCGCACAGCACTGCACCTGGCTGTGGAGCACGACAACATCTCATTGGCAGGCTGCCTGCTCCTGGAAGG  2126
            ||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 2038  TCTGGGCGCACAGCGCTGCACCTGGCCGTGGAGTACGACAACATCTCCTTGGCTGGCTGCCTGCTTCTGGAGGG  2111

Query 2127  TGATGCCCATGTGGACAGTACTACCTACGATGGAACCACACCCCTGCATATAGCAGCTGGGAGAGGGTCCACCA  2200
            |||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 2112  TGATGCCCACGTGGACAGTACCACCTATGATGGGACTACACCTCTGCATATAGCGGCCGGAAGAGGGTCCACCA  2185

Query 2201  GGCTGGCAGCTCTTCTCAAAGCAGCAGGAGCAGATCCCCTGGTGGAGAACTTTGAGCCTCTCTATGACCTGGAT  2274
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2186  GACTGGCAGCTCTTCTCAAAGCAGCAGGAGCAGACCCCCTGGTGGAGAACTTTGAGCCTCTCTATGACCTGGAC  2259

Query 2275  GACTCTTGGGAAAATGCAGGAGAGGATGAAGGAGTTGTGCCTGGAACCACGCCTCTAGATATGGCCACCAGCTG  2348
            |||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||..|||.|||
Sbjct 2260  GACTCTTGGGAGAAGGCTGGAGAAGATGAGGGAGTGGTGCCAGGTACCACACCCCTGGACATGGCTGCCAACTG  2333

Query 2349  GCAGGTATTTGACATATTAAATGGGAAACCATATGAGCCAGAGTTTACATCTGATGTTTTTCT--------TGG  2414
            ||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|.|||.||||||||||.|.|.||        .||
Sbjct 2334  GCAGGTATTTGACATACTAAATGGGAAACCGTATGAGCCTGTGTTCACATCTGATGATATACTACCACAAGGGG  2407

Query 2415  ACTTGCCGAAAG-AGCCTTAACAGGCTGGAAGGTGAACTCTCCACTCCAACTGTAACAGTG-AAACTGCAACGT  2486
            ||.||    ||| |||  |.|||     ||||    ||.|....||.|||||      .|| |||||||     
Sbjct 2408  ACATG----AAGCAGC--TGACA-----GAAG----ACACGAGGCTACAACT------CTGCAAACTGC-----  2455

Query 2487  CTTCTTTGGTAGTTGGATGATGTTCTTGGATTTAACGCGAAAGAATCACACGAAAGGAACAAAATGAGAC-GGG  2559
                  ||          ||..|||.||                ||| ||       .||||||    || |||
Sbjct 2456  ------TG----------GAAATTCCTG----------------ATC-CA-------GACAAAA----ACTGGG  2485

Query 2560  AAGTCCAACATCATTCTCTTTTACGAAAAGCATAGAAACATG-TGCCTCT----ATAGTGTAAAATAC------  2622
                |||        ||||         .|||.||||    | ||..|||    |||.||.|.|||.|      
Sbjct 2486  ----CCA--------CTCT---------GGCACAGAA----GTTGGGTCTGGGGATACTGAACAATGCCTTCCG  2534

Query 2623  -------CCTTCACCCAAACGAAAATCTTCCAGGAAAATTGTTTATTTCTCACCGGGCTATTCATGGACCACAC  2689
                   |||.|.|            ||||.|  |||           |||          ||||||||  .||
Sbjct 2535  GCTGAGTCCTGCTC------------CTTCTA--AAA-----------CTC----------TCATGGAC--AAC  2571

Query 2690  AATAAACAGGATGAA-----------AGACACGCAACGGTAAAATAATTGGCCTGGAGA---------------  2737
            .||.|    ||||||           .|||| ||..|.||.|   .|.|||..||||||               
Sbjct 2572  TATGA----GATGAACTCCGGGATAGTGACA-GCGTCTGTGA---CAGTGGTGTGGAGACATCCTTCCGCAAAC  2637

Query 2738  -------TCCAGAGTGGGTTCCTGGGGTACCGATGTTACATTGCCAACAGT------  2781
                   |.||||||...||.||||.|          |||  |||.||.|.      
Sbjct 2638  TCAGCTTTACAGAGTCTCTTACTGGAG----------ACA--GCCCACTGCTATCTC  2682