Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06668
• Subject: NM_177215.3
• Aligned Length: 2704
• Identities: 2374
• Gaps: 29

Alignment

Query    1  ATGGAGCCGCCGCTCCCGGTCGGAGCCCAGCCGCTTGCCACTGTCGAGGGTATGGAGATGAAGGGTCCTCTCCG  74
            ||||||||||.|||||||.|.|||||.|||||.||.||.|..||.|.||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGAGCCGCGGCTCCCGATTGGAGCTCAGCCCCTGGCAATGGTGGCGGGTTTGGAGATGAAGGGTCCCCTCCG  74

Query   75  GGAGCCCTGCGCCCTGACCCTAGCCCAGAGGAACGGGCAATATGAGTTAATAATCCAGTTGCATGAGAAGGAAC  148
            |||.|||||||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct   75  GGAACCCTGCGTCCTGACCCTAGCCCGGAGGAATGGGCAGTATGAGTTAATAATCCAGTTGCATGGAAAGGAAC  148

Query  149  AGCATGTTCAAGATATCATTCCTATAAATAGCCACTTCAGATGTGTTCAAGAAGCAGAAGAAACTCTTTTGATT  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACATGTTCAAGATATCATTCCTATAAATAGCCACTTCAGATGTGTTCAAGAAGCAGAAGAAACTCTTTTGATT  222

Query  223  GACATAGCTTCTAACAGTGGCTGCAAAATTCGGGTTCAGGGGGACTGGATCAGAGAGCGCCGCTTTGAAATCCC  296
            ||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  223  GATATTGCTTCAAACAGTGGCTGCAAAATTCGGGTACAGGGAGACTGGACCAGAGAGCGCCACTTTGAAATTCC  296

Query  297  TGATGAGGAACACTGTTTGAAGTTCCTCTCAGCTGTCCTTGCTGCTCAGAAAGCTCAGTCACAGCTTCTTGTTC  370
            ||||||.||||.||||||||||||||||||||..|||||.|..||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATGAAGAACGCTGTTTGAAGTTCCTCTCAGAGGTCCTCGAAGCTCAGGAAGCTCAGTCACAGCTTCTTGTTC  370

Query  371  CAGAGCAAAAGGACTCATCTAGCTGGTACCAGAAATTAGACACTAAGGACAAACCTTCTGTTTTTTCAGGGCTT  444
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||   |||.||.|||||||||.
Sbjct  371  CAGAACAAAAAGACTCATCTAGCTGGTACCAGAAATTAGACACTATGGATAAAC---CTGCTTATTCAGGGCTG  441

Query  445  CTTGGATTTGAAGACAATTTTTCTTCTATGAATTTGGACAAGAAAATAAATTCACAAAATCAGCCTA-CTGGGA  517
            |||||||||||.||.||||||||.|||.||.||||.||.||||||||.|||.||||||||| .||.| |.||||
Sbjct  442  CTTGGATTTGAGGATAATTTTTCATCTCTGGATTTAGATAAGAAAATGAATACACAAAATC-CCCGATCAGGGA  514

Query  518  TTCATCGGGAACCCCCACCTCCACCCTTTTCAGTGAATAAAATGCTTCCACGTGAAAAAGAAGCTTCTAACAAG  591
            .||||||||||||.||.||||||||.|.||||..||.||.|||||||.|.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  515  GTCATCGGGAACCACCCCCTCCACCTTCTTCATCGACTAGAATGCTTTCGCGTGAAAAGGAAGCTTCAAACAAA  588

Query  592  GAGCAGCCCAAAGTGACCAACACCATGCGGAAGCTCTTTGTACCAAATACCCAATCTGGGCAGCGGGAGGGTCT  665
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||.||||||||
Sbjct  589  GAACAGCCCAAAGTGACCAATACCATGCGGAAGCTATTTGTCCCGAACACCCAAACCGGGCAGCGAGAGGGTCT  662

Query  666  CATCAAACATATCCTGGCAAAGCGAGAGAAAGAATATGTCAACATTCAGACTTTCAGATTTTTTGTTGGAACTT  739
            |||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct  663  CATTAAACATATCCTCACAAAGCGAGAGAAAGAATATGTCAACATCCAGTCTTTCAGGTTTTTTGTTGGAACTT  736

Query  740  GGAATGTGAATGGCCAGTCTCCAGATAGCGGGTTAGAACCTTGGCTGAACTGTGATCCCAATCCTCCTGATATC  813
            ||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  737  GGAATGTGAACGGCCAGTCTCCAGACAGCAGCTTAGAACCTTGGCTCGACTGTGATCCAAATCCTCCTGATATT  810

Query  814  TACTGCATTGGATTCCAAGAACTGGACTTGAGCACAGAAGCCTTCTTCTACTTTGAATCTGTGAAGGAACAAGA  887
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  811  TACTGCATTGGATTCCAAGAGCTGGACTTGAGCACCGAAGCCTTTTTCTACTTCGAGTCTGTGAAAGAGCAAGA  884

Query  888  ATGGTCCATGGCTGTAGAGAGAGGTTTGCATTCCAAAGCCAAGTATAAGAAAGTTCAACTGGTGCGCCTTGTTG  961
            .||||||.|||||||.||.||.||..|||.|||.||.||||||||||..||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  885  GTGGTCCTTGGCTGTGGAAAGGGGGCTGCCTTCGAAGGCCAAGTATAGAAAAGTTCAACTGGTCCGCCTTGTGG  958

Query  962  GGATGATGCTTCTTATATTTGCCAGAAAGGATCAGTGTCGATACATTCGTGATATTGCTACAGAAACAGTTGGA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||.|||.||||||||||||||..||||
Sbjct  959  GGATGATGCTTCTTATATTTGCCAGAAAAGATCAGTGTCAATACATCCGAGATGTTGCTACAGAAACAACTGGA  1032

Query 1036  ACTGGAATCATGGGGAAAATGGGAAACAAAGGTGGGGTAGCTGTGAGATTTGTATTTCACAACACCACCTTTTG  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1033  ACTGGAATCATGGGGAAAATGGGAAACAAAGGTGGGGTAGCTGTAAGATTTGTATTCCACAACACCACTTTCTG  1106

Query 1110  CATTGTCAATTCCCATCTGGCTGCACACGTGGAGGACTTTGAGAGAAGGAATCAAGATTATAAGGACATTTGTG  1183
            ||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||..||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1107  CATTGTCAATTCGCACCTGGCCGCCCACGTGGAAGAGTTCGAACGAAGGAATCAGGATTATAAAGACATCTGTG  1180

Query 1184  CGAGAATGAGTTTTGTGGTCCCAAATCAGACCCTCCCGCAGTTGAACATCATGAAACATGAGGTTGTCATTTGG  1257
            |.|||||||.||||...|||||.||||||||..|||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1181  CAAGAATGACTTTTTCAGTCCCCAATCAGACTGTCCCGCAAGTGAACATCATGAAGCATGATGTTGTCATTTGG  1254

Query 1258  TTGGGAGATTTGAATTATAGACTTGGCATGCCTGATGCCAATGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAGAAAGACCT  1331
            .|||||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1255  CTGGGAGACTTGAACTACAGACTTTGCATGCCTGATGCCAGTGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAAAATGAGCT  1328

Query 1332  TCAGAGACTCTTGAAATTCGACCAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAG  1405
            |||.|..||.||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||
Sbjct 1329  TCATAAGCTGTTGAAATTTGACCAGTTAAACATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGCGGATTTCAATGAAG  1402

Query 1406  GGGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGTGGGAAATGCCGG  1479
            |||||||.||.|||.|.|||||.||.||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1403  GGGAAATTAATTTCGTTCCCACGTACAAATATGATTCGAAAACTGACAGATGGGATTCCAGTGGGAAATGCCGA  1476

Query 1480  GTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGA  1553
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1477  GTTCCCGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAATAAATGTTAATCAACTTCATTACCGGAGTCACATGGA  1550

Query 1554  ACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTGAAGGTTGTGGATGAACGAAGGT  1627
            |||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1551  ACTCAAAACTAGTGACCACAAACCTGTTAGCGCCCTGTTCCATATTGGGGTGAAGGTTGTGGATGAGCGGAGGT  1624

Query 1628  ACCGGAAAGTCTTTGAAGATAGTGTACGCATCATGGACAGAATGGAAAATGACTTCCTTCCTTCCTTAGAACTC  1701
            |.|||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1625  ATCGGAAGGTCTTTGAAGATATCGTCCGCATTATGGACAGAATGGAAAACGACTTCCTTCCTTCATTAGAACTT  1698

Query 1702  AGCAGGAGGGAGTTTGTGTTTGAAAATGTGAAGTTTCGGCAACTACAAAAGGAGAAGTTCCAGATCAGCAACAA  1775
            ||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  AGCAGGAGAGAGTTTTTTTTTGAGAATGTGAAGTTTCGGCAGCTGCAAAAGGAGAAGTTCCAGATCAGCAACAA  1772

Query 1776  TGGACAGGTTCCCTGCCATTTTTCTTTCATCCCTAAACTTAATGACAGCCAGTACTGCAAGCCATGGCTTCGGG  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1773  TGGACAGGTTCCCTGCCATTTTTCTTTCATCCCTAAGCTTAATGACAGCCAATACTGCAAGCCATGGCTTCGAG  1846

Query 1850  CTGAACCTTTTGAGGGCTACTTGGAGCCAAATGAGACAGTGGACATTTCTCTTGATGTGTATGTCAGCAAAGAC  1923
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1847  CTGAACCTTTTGAGGGCTACTTGGAGCCAAACGAGACCTTAGACATCTCCCTTGATGTATACGTCAGCAAAGAC  1920

Query 1924  TCTGTAACCATCCTGAACTCGGGAGAAGATAAGATTGAAGATATTCTCGTCCTTCACCTGGATCGAGGCAAAGA  1997
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||
Sbjct 1921  TCTGTAACCATCCTGAACTCCGGTGAAGATAAGATTGAAGATATTCTTGTCCTCCATTTGGATCGAGGCAAAGA  1994

Query 1998  TTACTTCTTGACTATCAGTGGAAATTACCTCCCAAGTTGTTTTGGCACATCCTTAGAGGCTCTGTGCCGTATGA  2071
            ||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.|||||||.||||
Sbjct 1995  TTACTTCTTGACCATCGGTGGGAATTACCTCCCAAGTTGCTTTGGAACCTCATTGGAGGCTTTGTGCCGAATGA  2068

Query 2072  AAAGACCAATCCGAGAAGTTCCTGTTACCAAACTCATAGACTT------------------------GGAGAAA  2121
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|                        |||||||
Sbjct 2069  AAAGACCAATTCGAGAAGTTCCTGTCACCAAACTCATAGACCTGGAAGAAGACAGCTACCTAGAAAAGGAGAAA  2142

Query 2122  TCCCTTCTGCAAATGGTTCCTTTGGATGAAGGTGCCAGTGAGAGGCCCCTTCAGGTTCCCAAGGAGATCTGGCT  2195
            |||||||||||.|||||.||.||||||||||||.||||||||.|.||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2143  TCCCTTCTGCAGATGGTACCCTTGGATGAAGGTACCAGTGAGCGACCCCTTCAAGTCCCCAAAGAGATCTGGCT  2216

Query 2196  TCTAGTAGATCACCTATTCAAATACGCCTGTCACCAGGAGGACCTGTTCCAGACCCCTGGAATGCAGGAAGAGC  2269
            |||||||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||.
Sbjct 2217  TCTAGTAGATCACTTGTTCAAATATGCATGTCACCAGGAGGACTTGTTCCAAACCCCTGGAATGCAGGAGGAGT  2290

Query 2270  TCCAGCAGATCATTGATTGTCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATCCCTGGCAGCAACCACTCTGTGGCTGAA  2343
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||||||||||||
Sbjct 2291  TACAGCAGATCATTGATTGCCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATTCCTGGCAATAACCATTCTGTGGCTGAA  2364

Query 2344  GCACTGCTCATTTTCTTGGAAGCCCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTACGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTC  2417
            |||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365  GCACTGCTCATTTTCCTGGAAGCTCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTATGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTC  2438

Query 2418  TGCTTATGATCCCCGGATCTGCCGACAGGTGATCTCCCAGCTTCCGAGATGCCATAGAAATGTTTTCCGTTACT  2491
            ||||.|||||||.|||||||||..||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2439  TGCTCATGATCCTCGGATCTGCAAACAGGTCATTTCCCAGCTTCCAAGGTGCCATAGAAATGTTTTCCGCTACT  2512

Query 2492  TGATGGCATTCCTTCGAGAACTCTTAAAATTCTCTGAATACAATAGCGTCAATGCCAACATGATCGCTACTCTC  2565
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|...||||..||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2513  TGATGGCATTCCTTCGTGAACTCTTAAAATTCTCTGACTACAACAATATCAACACCAACATGATTGCTACCCTG  2586

Query 2566  TTCACTAGTCTTCTCCTGAGGCCTCCACCCAACCTTATGGCAAGACAGACTCCAAGTGACCGCCAGCGTGCTAT  2639
            ||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct 2587  TTCAGTAGCCTTCTCCTAAGACCTCCACCAAACCTCATGACAAGACAGACTCCAAATGACCGCCAGCATGCCAT  2660

Query 2640  TCAGTTCCTTCTGGGCTTTCTGCTTGGGAGCGAAGAAGAC  2679
            .||||||||..|||.|||.||||||||||.|||.||||||
Sbjct 2661  CCAGTTCCTCTTGGTCTTCCTGCTTGGGAACGAGGAAGAC  2700