Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06671
• Subject: NM_130834.3
• Aligned Length: 2934
• Identities: 2878
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGTGGCGACTACGTCGGGCCGCTGTGGCCTGTGAGGTCTGCCAGTCTTTAGTGAAACACAGCTCTGGAATAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCGACTACGTCGGGCCGCTGTGGCCTGTGAGGTCTGCCAGTCTTTAGTGAAACACAGCTCTGGAATAAA  74

Query   75  AGGAAGTTTACCACTACAAAAACTACATCTGGTTTCACGAAGCATTTATCATTCACATCATCCTACCTTAAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGAAGTTTACCACTACAAAAACTACATCTGGTTTCACGAAGCATTTATCATTCACATCATCCTACCTTAAAGC  148

Query  149  TTCAACGACCCCAATTAAGGACATCCTTTCAGCAGTTCTCTTCTCTGACAAACCTTCCTTTACGTAAACTGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCAACGACCCCAATTAAGGACATCCTTTCAGCAGTTCTCTTCTCTGACAAACCTTCCTTTACGTAAACTGAAA  222

Query  223  TTCTCTCCAATTAAATATGGCTACCAGCCTCGCAGGAATTTTTGGCCAGCAAGATTAGCTACGAGACTCTTAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCTCTCCAATTAAATATGGCTACCAGCCTCGCAGGAATTTTTGGCCAGCAAGATTAGCTACGAGACTCTTAAA  296

Query  297  ACTTCGCTATCTCATACTAGGATCGGCTGTTGGGGGTGGCTACACAGCCAAAAAGACTTTTGATCAGTGGAAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTTCGCTATCTCATACTAGGATCGGCTGTTGGGGGTGGCTACACAGCCAAAAAGACTTTTGATCAGTGGAAAG  370

Query  371  ATATGATACCGGACCTTAGTGAATATAAATGGATTGTGCCTGACATTGTGTGGGAAATTGATGAGTATATCGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATGATACCGGACCTTAGTGAATATAAATGGATTGTGCCTGACATTGTGTGGGAAATTGATGAGTATATCGAT  444

Query  445  TTTGAGAAAATTAGAAAAGCCCTTCCTAATTCAGAAGACCTTGTAAAGTTAGCACCAGACTTTGACAAGATTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGAGAAAATTAGAAAAGCCCTTCCTAGTTCAGAAGACCTTGTAAAGTTAGCACCAGACTTTGACAAGATTGT  518

Query  519  TGAAAGCCTTAGCTTATTGAAGGACTTTTTTACCTC--------------------------------------  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  519  TGAAAGCCTTAGCTTATTGAAGGACTTTTTTACCTCAGGTCACAAATTGGTTAGTGAAGTCATAGGAGCTTCTG  592

Query  555  ----------------AGGTTCTCCGGAAGAAACGGCGTTTAGAGCAACAGATCGTGGATCTGAAAGTGACAAG  612
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTACTTCTCTTGTTAGGTTCTCCGGAAGAAACGGCGTTTAGAGCAACAGATCGTGGATCTGAAAGTGACAAG  666

Query  613  CATTTTAGAAAGGTGTCAGACAAAGAGAAAATTGACCAACTTCAGGAAGAACTTCTGCACACTCAGTTGAAGTA  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATTTTAGAAAGGTGTCAGACAAAGAGAAAATTGACCAACTTCAGGAAGAACTTCTGCACACTCAGTTGAAGTA  740

Query  687  TCAGAGAATCTTGGAACGATTAGAAAAGGAGAACAAAGAATTGAGAAAATTAGTATTGCAGAAAGATGACAAAG  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAGAGAATCTTGGAACGATTAGAAAAGGAGAACAAAGAATTGAGAAAATTAGTATTGCAGAAAGATGACAAAG  814

Query  761  GCATTCATCATAGAAAGCTTAAGAAATCTTTGATTGACATGTATTCTGAAGTTCTTGATGTTCTCTCTGATTAT  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCATTCATCATAGAAAGCTTAAGAAATCTTTGATTGACATGTATTCTGAAGTTCTTGATGTTCTCTCTGATTAT  888

Query  835  GATGCCAGTTATAATACGCAAGATCATCTGCCACGGGTTGTTGTGGTTGGAGATCAGAGTGCTGGAAAGACTAG  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGCCAGTTATAATACGCAAGATCATCTGCCACGGGTTGTTGTGGTTGGAGATCAGAGTGCTGGAAAGACTAG  962

Query  909  TGTGTTGGAAATGATTGCCCAAGCTCGAATATTCCCAAGAGGATCTGGGGAGATGATGACACGTTCTCCAGTTA  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGTTGGAAATGATTGCCCAAGCTCGAATATTCCCAAGAGGATCTGGGGAGATGATGACACGTTCTCCAGTTA  1036

Query  983  AGGTGACTCTGAGTGAAGGTCCTCACCATGTGGCCCTATTTAAAGATAGTTCTCGGGAGTTTGATCTTACCAAA  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGTGACTCTGAGTGAAGGTCCTCACCATGTGGCCCTATTTAAAGATAGTTCTCGGGAGTTTGATCTTACCAAA  1110

Query 1057  GAAGAAGATCTTGCAGCATTAAGACATGAAATAGAACTTCGAATGAGGAAAAATGTGAAAGAAGGCTGTACCGT  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGAAGATCTTGCAGCATTAAGACATGAAATAGAACTTCGAATGAGGAAAAATGTGAAAGAAGGCTGTACCGT  1184

Query 1131  TAGCCCTGAGACCATATCCTTAAATGTAAAAGGCCCTGGACTACAGAGGATGGTGCTTGTTGACTTACCAGGTG  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGCCCTGAGACCATATCCTTAAATGTAAAAGGCCCTGGACTACAGAGGATGGTGCTTGTTGACTTACCAGGTG  1258

Query 1205  TGATTAATACTGTGACATCAGGCATGGCTCCTGACACAAAGGAAACTATTTTCAGTATCAGCAAAGCTTACATG  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGATTAATACTGTGACATCAGGCATGGCTCCTGACACAAAGGAAACTATTTTCAGTATCAGCAAAGCTTACATG  1332

Query 1279  CAGAATCCTAATGCCATCATACTGTGTATTCAAGATGGATCTGTGGATGCTGAACGCAGTATTGTTACAGACTT  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGAATCCTAATGCCATCATACTGTGTATTCAAGATGGATCTGTGGATGCTGAACGCAGTATTGTTACAGACTT  1406

Query 1353  GGTCAGTCAAATGGACCCTCATGGAAGGAGAACCATATTCGTTTTGACCAAAGTAGACCTGGCAGAGAAAAATG  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTCAGTCAAATGGACCCTCATGGAAGGAGAACCATATTCGTTTTGACCAAAGTAGACCTGGCAGAGAAAAATG  1480

Query 1427  TAGCCAGTCCAAGCAGGATTCAGCAGATAATTGAAGGAAAGCTCTTCCCAATGAAAGCTTTAGGTTATTTTGCT  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAGCCAGTCCAAGCAGGATTCAGCAGATAATTGAAGGAAAGCTCTTCCCAATGAAAGCTTTAGGTTATTTTGCT  1554

Query 1501  GTTGTAACAGGAAAAGGGAACAGCTCTGAAAGCATTGAAGCTATAAGAGAATATGAAGAAGAGTTTTTTCAGAA  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTGTAACAGGAAAAGGGAACAGCTCTGAAAGCATTGAAGCTATAAGAGAATATGAAGAAGAGTTTTTTCAGAA  1628

Query 1575  TTCAAAGCTCCTAAAGACAAGCATGCTAAAGGCACACCAAGTGACTACAAGAAATTTAAGCCTTGCAGTATCAG  1648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTCAAAGCTCCTAAAGACAAGCATGCTAAAGGCACACCAAGTGACTACAAGAAATTTAAGCCTTGCAGTATCAG  1702

Query 1649  ACTGCTTTTGGAAAATGGTACGAGAGTCTGTTGAACAACAGGCTGATAGTTTCAAAGCAACACGTTTTAACCTT  1722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACTGCTTTTGGAAAATGGTACGAGAGTCTGTTGAACAACAGGCTGATAGTTTCAAAGCAACACGTTTTAACCTT  1776

Query 1723  GAAACTGAATGGAAGAATAACTATCCTCGCCTGCGGGAACTTGACCGGAATGAACTATTTGAAAAAGCTAAAAA  1796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAAACTGAATGGAAGAATAACTATCCTCGCCTGCGGGAACTTGACCGGAATGAACTATTTGAAAAAGCTAAAAA  1850

Query 1797  TGAAATCCTTGATGAAGTTATCAGTCTGAGCCAGGTTACACCAAAACATTGGGAGGAAATCCTTCAACAATCTT  1870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAAATCCTTGATGAAGTTATCAGTCTGAGCCAGGTTACACCAAAACATTGGGAGGAAATCCTTCAACAATCTT  1924

Query 1871  TGTGGGAAAGAGTATCAACTCATGTGATTGAAAACATCTACCTTCCAGCTGCGCAGACCATGAATTCAGGAACT  1944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGTGGGAAAGAGTATCAACTCATGTGATTGAAAACATCTACCTTCCAGCTGCGCAGACCATGAATTCAGGAACT  1998

Query 1945  TTTAACACCACAGTGGATATCAAGCTTAAACAGTGGACTGATAAACAACTTCCTAATAAAGCAGTAGAGGTTGC  2018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTTAACACCACAGTGGATATCAAGCTTAAACAGTGGACTGATAAACAACTTCCTAATAAAGCAGTAGAGGTTGC  2072

Query 2019  TTGGGAGACCCTACAAGAAGAATTTTCCCGCTTTATGACAGAACCGAAAGGGAAAGAGCATGATGACATATTTG  2092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTGGGAGACCCTACAAGAAGAATTTTCCCGCTTTATGACAGAACCGAAAGGGAAAGAGCATGATGACATATTTG  2146

Query 2093  ATAAACTTAAAGAGGCCGTTAAGGAAGAAAGTATTAAACGACACAAGTGGAATGACTTTGCGGAGGACAGCTTG  2166
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATAAACTTAAAGAGGCTGTTAAGGAAGAAAGTATTAAACGACACAAGTGGAATGACTTTGCGGAGGACAGCTTG  2220

Query 2167  AGGGTTATTCAACACAATGCTTTGGAAGACCGATCCATATCTGATAAACAGCAATGGGATGCAGCTATTTATTT  2240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGGGTTATTCAACACAATGCTTTGGAAGACCGATCCATATCTGATAAACAGCAATGGGATGCAGCTATTTATTT  2294

Query 2241  TATGGAAGAGGCTCTGCAGGCTCGTCTCAAGGATACTGAAAATGCAATTGAAAACATGGTGGGTCCAGACTGGA  2314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TATGGAAGAGGCTCTGCAGGCTCGTCTCAAGGATACTGAAAATGCAATTGAAAACATGGTGGGTCCAGACTGGA  2368

Query 2315  AAAAGAGGTGGTTATACTGGAAGAATCGGACCCAAGAACAGTGTGTTCACAATGAAACCAAGAATGAATTGGAG  2388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AAAAGAGGTGGTTATACTGGAAGAATCGGACCCAAGAACAGTGTGTTCACAATGAAACCAAGAATGAATTGGAG  2442

Query 2389  AAGATGTTGAAATGTAATGAGGAGCACCCAGCTTATCTTGCAAGTGATGAAATAACCACAGTCCGGAAGAACCT  2462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AAGATGTTGAAATGTAATGAGGAGCACCCAGCTTATCTTGCAAGTGATGAAATAACCACAGTCCGGAAGAACCT  2516

Query 2463  TGAATCCCGAGGAGTAGAAGTAGATCCAAGCTTGATTAAGGATACTTGGCATCAAGTTTATAGAAGACATTTTT  2536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGAATCCCGAGGAGTAGAAGTAGATCCAAGCTTGATTAAGGATACTTGGCATCAAGTTTATAGAAGACATTTTT  2590

Query 2537  TAAAAACAGCTCTAAACCATTGTAACCTTTGTCGAAGAGGTTTTTATTACTACCAAAGGCATTTTGTAGATTCT  2610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TAAAAACAGCTCTAAACCATTGTAACCTTTGTCGAAGAGGTTTTTATTACTACCAAAGGCATTTTGTAGATTCT  2664

Query 2611  GAGTTGGAATGCAATGATGTGGTCTTGTTTTGGCGTATACAGCGCATGCTTGCTATCACCGCAAATACTTTAAG  2684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GAGTTGGAATGCAATGATGTGGTCTTGTTTTGGCGTATACAGCGCATGCTTGCTATCACCGCAAATACTTTAAG  2738

Query 2685  GCAACAACTTACAAATACTGAAGTTAGGCGATTAGAGAAAAATGTTAAAGAGGTATTGGAAGATTTTGCTGAAG  2758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GCAACAACTTACAAATACTGAAGTTAGGCGATTAGAGAAAAATGTTAAAGAGGTATTGGAAGATTTTGCTGAAG  2812

Query 2759  ATGGTGAGAAGAAGATTAAATTGCTTACTGGTAAACGCGTTCAACTGGCGGAAGACCTCAAGAAAGTTAGAGAA  2832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ATGGTGAGAAGAAGATTAAATTGCTTACTGGTAAACGCGTTCAACTGGCGGAAGACCTCAAGAAAGTTAGAGAA  2886

Query 2833  ATTCAAGAAAAACTTGATGCTTTCATTGAAGCTCTTCATCAGGAGAAA  2880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ATTCAAGAAAAACTTGATGCTTTCATTGAAGCTCTTCATCAGGAGAAA  2934