Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06671
- Subject:
- NM_130836.3
- Aligned Length:
- 2991
- Identities:
- 2878
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 ATGTGGCGACTACGTCGGGCCGCTGTGGCCTGTGAGGTCTGCCAGTCTTTAGTGAAACACAGCTCTGGAATAAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGGCGACTACGTCGGGCCGCTGTGGCCTGTGAGGTCTGCCAGTCTTTAGTGAAACACAGCTCTGGAATAAA 74
Query 75 AGGAAGTTTACCACTACAAAAACTACATCTGGTTTCACGAAGCATTTATCATTCACATCATCCTACCTTAAAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGAAGTTTACCACTACAAAAACTACATCTGGTTTCACGAAGCATTTATCATTCACATCATCCTACCTTAAAGC 148
Query 149 TTCAACGACCCCAATTAAGGACATCCTTTCAGCAGTTCTCTTCTCTGACAAACCTTCCTTTACGTAAACTGAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTCAACGACCCCAATTAAGGACATCCTTTCAGCAGTTCTCTTCTCTGACAAACCTTCCTTTACGTAAACTGAAA 222
Query 223 TTCTCTCCAATTAAATATGGCTACCAGCCTCGCAGGAATTTTTGGCCAGCAAGATTAGCTACGAGACTCTTAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCTCTCCAATTAAATATGGCTACCAGCCTCGCAGGAATTTTTGGCCAGCAAGATTAGCTACGAGACTCTTAAA 296
Query 297 ACTTCGCTATCTCATACTAGGATCGGCTGTTGGGGGTGGCTACACAGCCAAAAAGACTTTTGATCAGTGGAAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACTTCGCTATCTCATACTAGGATCGGCTGTTGGGGGTGGCTACACAGCCAAAAAGACTTTTGATCAGTGGAAAG 370
Query 371 ATATGATACCGGACCTTAGTGAATATAAATGGATTGTGCCTGACATTGTGTGGGAAATTGATGAGTATATCGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATATGATACCGGACCTTAGTGAATATAAATGGATTGTGCCTGACATTGTGTGGGAAATTGATGAGTATATCGAT 444
Query 445 TTTGAGAAAATTAGAAAAGCCCTTCCTAATTCAGAAGACCTTGTAAAGTTAGCACCAGACTTTGACAAGATTGT 518
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGAGAAAATTAGAAAAGCCCTTCCTAGTTCAGAAGACCTTGTAAAGTTAGCACCAGACTTTGACAAGATTGT 518
Query 519 TGAAAGCCTTAGCTTATTGAAGGACTTTTTTACCTCAGGTTCTCCGGAAGAAACGGCGTTTAGAGCAACAGATC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAAGCCTTAGCTTATTGAAGGACTTTTTTACCTCAGGTTCTCCGGAAGAAACGGCGTTTAGAGCAACAGATC 592
Query 593 GTGGATCTGAAAGTGACAAGCATTTTAGA--------------------------------------------- 621
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGGATCTGAAAGTGACAAGCATTTTAGAAAGGGTCTGCTTGGTGAGCTCATTCTCTTACAACAACAAATTCAA 666
Query 622 ------------------------------------------------------------------AAGGTGTC 629
||||||||
Sbjct 667 GAGCATGAAGAGGAAGCGCGCAGAGCCGCTGGCCAATATAGCACGAGCTATGCCCAACAGAAGCGCAAGGTGTC 740
Query 630 AGACAAAGAGAAAATTGACCAACTTCAGGAAGAACTTCTGCACACTCAGTTGAAGTATCAGAGAATCTTGGAAC 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGACAAAGAGAAAATTGACCAACTTCAGGAAGAACTTCTGCACACTCAGTTGAAGTATCAGAGAATCTTGGAAC 814
Query 704 GATTAGAAAAGGAGAACAAAGAATTGAGAAAATTAGTATTGCAGAAAGATGACAAAGGCATTCATCATAGAAAG 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATTAGAAAAGGAGAACAAAGAATTGAGAAAATTAGTATTGCAGAAAGATGACAAAGGCATTCATCATAGAAAG 888
Query 778 CTTAAGAAATCTTTGATTGACATGTATTCTGAAGTTCTTGATGTTCTCTCTGATTATGATGCCAGTTATAATAC 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTAAGAAATCTTTGATTGACATGTATTCTGAAGTTCTTGATGTTCTCTCTGATTATGATGCCAGTTATAATAC 962
Query 852 GCAAGATCATCTGCCACGGGTTGTTGTGGTTGGAGATCAGAGTGCTGGAAAGACTAGTGTGTTGGAAATGATTG 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCAAGATCATCTGCCACGGGTTGTTGTGGTTGGAGATCAGAGTGCTGGAAAGACTAGTGTGTTGGAAATGATTG 1036
Query 926 CCCAAGCTCGAATATTCCCAAGAGGATCTGGGGAGATGATGACACGTTCTCCAGTTAAGGTGACTCTGAGTGAA 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCAAGCTCGAATATTCCCAAGAGGATCTGGGGAGATGATGACACGTTCTCCAGTTAAGGTGACTCTGAGTGAA 1110
Query 1000 GGTCCTCACCATGTGGCCCTATTTAAAGATAGTTCTCGGGAGTTTGATCTTACCAAAGAAGAAGATCTTGCAGC 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGTCCTCACCATGTGGCCCTATTTAAAGATAGTTCTCGGGAGTTTGATCTTACCAAAGAAGAAGATCTTGCAGC 1184
Query 1074 ATTAAGACATGAAATAGAACTTCGAATGAGGAAAAATGTGAAAGAAGGCTGTACCGTTAGCCCTGAGACCATAT 1147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATTAAGACATGAAATAGAACTTCGAATGAGGAAAAATGTGAAAGAAGGCTGTACCGTTAGCCCTGAGACCATAT 1258
Query 1148 CCTTAAATGTAAAAGGCCCTGGACTACAGAGGATGGTGCTTGTTGACTTACCAGGTGTGATTAATACTGTGACA 1221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCTTAAATGTAAAAGGCCCTGGACTACAGAGGATGGTGCTTGTTGACTTACCAGGTGTGATTAATACTGTGACA 1332
Query 1222 TCAGGCATGGCTCCTGACACAAAGGAAACTATTTTCAGTATCAGCAAAGCTTACATGCAGAATCCTAATGCCAT 1295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCAGGCATGGCTCCTGACACAAAGGAAACTATTTTCAGTATCAGCAAAGCTTACATGCAGAATCCTAATGCCAT 1406
Query 1296 CATACTGTGTATTCAAGATGGATCTGTGGATGCTGAACGCAGTATTGTTACAGACTTGGTCAGTCAAATGGACC 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CATACTGTGTATTCAAGATGGATCTGTGGATGCTGAACGCAGTATTGTTACAGACTTGGTCAGTCAAATGGACC 1480
Query 1370 CTCATGGAAGGAGAACCATATTCGTTTTGACCAAAGTAGACCTGGCAGAGAAAAATGTAGCCAGTCCAAGCAGG 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTCATGGAAGGAGAACCATATTCGTTTTGACCAAAGTAGACCTGGCAGAGAAAAATGTAGCCAGTCCAAGCAGG 1554
Query 1444 ATTCAGCAGATAATTGAAGGAAAGCTCTTCCCAATGAAAGCTTTAGGTTATTTTGCTGTTGTAACAGGAAAAGG 1517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATTCAGCAGATAATTGAAGGAAAGCTCTTCCCAATGAAAGCTTTAGGTTATTTTGCTGTTGTAACAGGAAAAGG 1628
Query 1518 GAACAGCTCTGAAAGCATTGAAGCTATAAGAGAATATGAAGAAGAGTTTTTTCAGAATTCAAAGCTCCTAAAGA 1591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAACAGCTCTGAAAGCATTGAAGCTATAAGAGAATATGAAGAAGAGTTTTTTCAGAATTCAAAGCTCCTAAAGA 1702
Query 1592 CAAGCATGCTAAAGGCACACCAAGTGACTACAAGAAATTTAAGCCTTGCAGTATCAGACTGCTTTTGGAAAATG 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAAGCATGCTAAAGGCACACCAAGTGACTACAAGAAATTTAAGCCTTGCAGTATCAGACTGCTTTTGGAAAATG 1776
Query 1666 GTACGAGAGTCTGTTGAACAACAGGCTGATAGTTTCAAAGCAACACGTTTTAACCTTGAAACTGAATGGAAGAA 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTACGAGAGTCTGTTGAACAACAGGCTGATAGTTTCAAAGCAACACGTTTTAACCTTGAAACTGAATGGAAGAA 1850
Query 1740 TAACTATCCTCGCCTGCGGGAACTTGACCGGAATGAACTATTTGAAAAAGCTAAAAATGAAATCCTTGATGAAG 1813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TAACTATCCTCGCCTGCGGGAACTTGACCGGAATGAACTATTTGAAAAAGCTAAAAATGAAATCCTTGATGAAG 1924
Query 1814 TTATCAGTCTGAGCCAGGTTACACCAAAACATTGGGAGGAAATCCTTCAACAATCTTTGTGGGAAAGAGTATCA 1887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTATCAGTCTGAGCCAGGTTACACCAAAACATTGGGAGGAAATCCTTCAACAATCTTTGTGGGAAAGAGTATCA 1998
Query 1888 ACTCATGTGATTGAAAACATCTACCTTCCAGCTGCGCAGACCATGAATTCAGGAACTTTTAACACCACAGTGGA 1961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACTCATGTGATTGAAAACATCTACCTTCCAGCTGCGCAGACCATGAATTCAGGAACTTTTAACACCACAGTGGA 2072
Query 1962 TATCAAGCTTAAACAGTGGACTGATAAACAACTTCCTAATAAAGCAGTAGAGGTTGCTTGGGAGACCCTACAAG 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TATCAAGCTTAAACAGTGGACTGATAAACAACTTCCTAATAAAGCAGTAGAGGTTGCTTGGGAGACCCTACAAG 2146
Query 2036 AAGAATTTTCCCGCTTTATGACAGAACCGAAAGGGAAAGAGCATGATGACATATTTGATAAACTTAAAGAGGCC 2109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2147 AAGAATTTTCCCGCTTTATGACAGAACCGAAAGGGAAAGAGCATGATGACATATTTGATAAACTTAAAGAGGCT 2220
Query 2110 GTTAAGGAAGAAAGTATTAAACGACACAAGTGGAATGACTTTGCGGAGGACAGCTTGAGGGTTATTCAACACAA 2183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTTAAGGAAGAAAGTATTAAACGACACAAGTGGAATGACTTTGCGGAGGACAGCTTGAGGGTTATTCAACACAA 2294
Query 2184 TGCTTTGGAAGACCGATCCATATCTGATAAACAGCAATGGGATGCAGCTATTTATTTTATGGAAGAGGCTCTGC 2257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGCTTTGGAAGACCGATCCATATCTGATAAACAGCAATGGGATGCAGCTATTTATTTTATGGAAGAGGCTCTGC 2368
Query 2258 AGGCTCGTCTCAAGGATACTGAAAATGCAATTGAAAACATGGTGGGTCCAGACTGGAAAAAGAGGTGGTTATAC 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGGCTCGTCTCAAGGATACTGAAAATGCAATTGAAAACATGGTGGGTCCAGACTGGAAAAAGAGGTGGTTATAC 2442
Query 2332 TGGAAGAATCGGACCCAAGAACAGTGTGTTCACAATGAAACCAAGAATGAATTGGAGAAGATGTTGAAATGTAA 2405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TGGAAGAATCGGACCCAAGAACAGTGTGTTCACAATGAAACCAAGAATGAATTGGAGAAGATGTTGAAATGTAA 2516
Query 2406 TGAGGAGCACCCAGCTTATCTTGCAAGTGATGAAATAACCACAGTCCGGAAGAACCTTGAATCCCGAGGAGTAG 2479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGAGGAGCACCCAGCTTATCTTGCAAGTGATGAAATAACCACAGTCCGGAAGAACCTTGAATCCCGAGGAGTAG 2590
Query 2480 AAGTAGATCCAAGCTTGATTAAGGATACTTGGCATCAAGTTTATAGAAGACATTTTTTAAAAACAGCTCTAAAC 2553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AAGTAGATCCAAGCTTGATTAAGGATACTTGGCATCAAGTTTATAGAAGACATTTTTTAAAAACAGCTCTAAAC 2664
Query 2554 CATTGTAACCTTTGTCGAAGAGGTTTTTATTACTACCAAAGGCATTTTGTAGATTCTGAGTTGGAATGCAATGA 2627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CATTGTAACCTTTGTCGAAGAGGTTTTTATTACTACCAAAGGCATTTTGTAGATTCTGAGTTGGAATGCAATGA 2738
Query 2628 TGTGGTCTTGTTTTGGCGTATACAGCGCATGCTTGCTATCACCGCAAATACTTTAAGGCAACAACTTACAAATA 2701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TGTGGTCTTGTTTTGGCGTATACAGCGCATGCTTGCTATCACCGCAAATACTTTAAGGCAACAACTTACAAATA 2812
Query 2702 CTGAAGTTAGGCGATTAGAGAAAAATGTTAAAGAGGTATTGGAAGATTTTGCTGAAGATGGTGAGAAGAAGATT 2775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CTGAAGTTAGGCGATTAGAGAAAAATGTTAAAGAGGTATTGGAAGATTTTGCTGAAGATGGTGAGAAGAAGATT 2886
Query 2776 AAATTGCTTACTGGTAAACGCGTTCAACTGGCGGAAGACCTCAAGAAAGTTAGAGAAATTCAAGAAAAACTTGA 2849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AAATTGCTTACTGGTAAACGCGTTCAACTGGCGGAAGACCTCAAGAAAGTTAGAGAAATTCAAGAAAAACTTGA 2960
Query 2850 TGCTTTCATTGAAGCTCTTCATCAGGAGAAA 2880
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TGCTTTCATTGAAGCTCTTCATCAGGAGAAA 2991