Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06693
• Subject: NM_001081377.2
• Aligned Length: 1237
• Identities: 1215
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSASLVYRLVSKAGDAP  74
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Sbjct    1  MDLRDFYLLAALIACLRLDSAIAQELIYTIREELPENVPIGNIPKDLNISHINAATGTSASLVYRLVSKAGDAP  74

Query   75  LVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPNDFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVIN  148
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Sbjct   75  LVKVSSSTGEIFTTSNRIDREKLCAGASYAEENECFFELEVVILPNDFFRLIKIKIIVKDTNDNAPMFPSPVIN  148

Query  149  ISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYELLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKI  222
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Sbjct  149  ISIPENTLINSRFPIPSATDPDTGFNGVQHYELLNGQSVFGLDIVETPEGEKWPQLIVQQNLDREQKDTYVMKI  222

Query  223  KVEDGGTPQKSSTAILQVTVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  KVEDGGTPQKSSTAILQVTVSDVNDNRPVFKEGQVEVHIPENAPVGTSVIQLHATDADIGSNAEIRYIFGAQVA  296

Query  297  PATKRLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDLRYIISPINGT  370
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Sbjct  297  PATKRLFALNNTTGLITVQRSLDREETAIHKVTVLASDGSSTPARATVTINVTDVNDNPPNIDLRYIISPINGT  370

Query  371  VYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYLLETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDS  444
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Sbjct  371  VYLSEKDPVNTKIALITVSDKDTDVNGKVICFIEREVPFHLKAVYDNQYLLETSSLLDYEGTKEFSFKIVASDS  444

Query  445  GKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSENNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNASFFDLD  518
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Sbjct  445  GKPSLNQTALVRVKLEDENDNPPIFNQPVIELSVSENNRRGLYLTTISATDEDSGKNADIVYQLGPNASFFDLD  518

Query  519  RKTGVLTASRVFDREEQERFIFTVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVG  592
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Sbjct  519  RKTGVLTASRVFNREEQERFIFTVTARDNGTPPLQSQAAVIVTVLDENDNSPKFTHNHFQFFVSENLPKYSTVG  592

Query  593  VITVTDADAGENKAVTLSILNDNDNFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTAKVTINVM  666
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Sbjct  593  VITVTDEDAGENKAVTLSILNDNENFVLDPYSGVIKSNVSFDREQQSSYTFDVKATDGGQPPRSSTAKVTINVM  666

Query  667  DVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDVDTGMNAELKYTIVSGNNKGLFRIDPVTGNITLEEK  740
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Sbjct  667  DVNDNSPVVISPPSNTSFKLVPLSAIPGSVVAEVFAVDIDTGMNAELKYTIVSGNNKGLFRIDPVTGNITLEEK  740

Query  741  PAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKSLHTLVLVFLYVNDTAGNASYIYDLIRRTMETPLDRNIGDSSQPYQNEDYLT  814
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Sbjct  741  PAPTDVGLHRLVVNISDLGYPKALHTLVLVFLYVNDTAGNTSYIYDLIRRTMETPLDRNIGDSGQPYQNEDYLT  814

Query  815  IMIAIIAGAMVVIVVIFVTVLVRCRHASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQNKKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIE  888
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  IMIAIVAGAMVVIVVIFVTVLVRCRHASRFKAAQRSKQGAEWMSPNQENKQNKKKKRKKRKSPKSSLLNFVTIE  888

Query  889  ESKPDDAVHEPINGTISLPAELEEQSIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDTPVSVKKHH  962
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Sbjct  889  ESKPDDAVHEPINGTISLPAELEEQGIGRFDWGPAPPTTFKPNSPDLAKHYKSASPQPAFHLKPDTPVSVKKHH  962

Query  963  VIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQGGFKTKGPLHTRQCNSHSKSDNIPVTPQKCPSSTGFH  1036
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Sbjct  963  VIQELPLDNTFVGGCDTLSKRSSTSSDHFSASECSSQGGFKTKGPLHTRQCNSYSKNDNIPVTHQKCPGSTSFH  1036

Query 1037  IQENEESHYESQRRVTFHLPDGSQESCSDSGLGDHEPVGSGTLISHPLPLVQPQDEFYDQASPDKRTEADGNSD  1110
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Sbjct 1037  IRENEESHSESQRRVTFHLPDGSQESCSDSGLGDHEPVGSGTLISHPLPLVQPQDEFYDQASPDKRTEADGNSD  1110

Query 1111  PNSDGPLGPRGLAEATEMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWVKKDKLVNGHTLTRAWK  1184
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Sbjct 1111  PNSDGPLGPRGLAEATEMCTQECLVLGHSDNCWMPPGLGPYQHPKSPLSTFAPQKEWIKKDKLVNGHTLTRAWK  1184

Query 1185  EDSNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGSHMTDIPLANLKSYKQAGGATESPKEHQL  1237
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Sbjct 1185  EDTNRNQFNDRKQYGSNEGHFNNGGHMADIPLANLKSYKQAGGTIESPKEHQL  1237