Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06702
• Subject: NM_001363570.1
• Aligned Length: 1190
• Identities: 1111
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  MRRDERDAKAMRSLQPPDGAGSPPESLRNGYVKSCVSPLRQDPPRGFFFHLCHFCNVELRPPPASPQQPRRCSP  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MRRDERDAKAMRSLQPPDGAGSPPESLRNGYVKSCVSPLRQDPPRGFFFHLCRFCNVELRPPPASPQQPRRCSP  74

Query   75  FCRARLSLGALAAFVLALLLGAEPESWAAGAAWLRTLLSVCSHSLSPLFSIACAFFFLTCFLTRTKRGPGPGRS  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  FCRARLSLGALAAFVLALLLGAEPESWAAGAAWLRTLLSVCSHSLSPLFSIACAFFFLTCFLTRTKRGPGPGRS  148

Query  149  CGSWWLLALPACCYLGDFLVWQWWSWPWGDGDAGSAAPHTPPEAAAGRLLLVLSCVGLLLTLAHPLRLRHCVLV  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGSWWLLALPACCYLGDFLVWQWWSWPWGDGDAGSAAPHTPPEAAAGRLLLVLSCVGLLLTLAHPLRLRHCVLV  222

Query  223  LLLASFVWWVSFTSLGSLPSALRPLLSGLVGGAGCLLALGLDHFFQIREAPLHPRLSSAAEEKVPVIRPRRRSS  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  LLLASFVWWVSFTSLGSLPSALRPLLSGLVGGAGCLLALGLDHFFQIREAPLHPRLSSAAEEKVPVIRPRRRSS  296

Query  297  CVSLGETAASYYGSCKIFRRPSLPCISREQMILWDWDLKQWYKPHYQ---------------------------  343
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  297  CVSLGETAASYYGSCKIFRRPSLPCISREQMILWDWDLKQWYKPHYQAGVQWHDLGSPQPPAPWFKRFSCLSLR  370

Query  344  ---------------------------------------------------NSGGGNGVDLSVLNEARNMVSDL  366
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  SSWDYRHVPPHLANFVFLVEMGFLHVGQAGLELPTSGDLPTSASQSAGITGNSGGGNGVDLSVLNEARNMVSDL  444

Query  367  LTDPSLPPQVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLNKGLNRNSLPTPQLRR  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  LTDPSLPPQVISSLRSISSLMGAFSGSCRPKINPLTPFPGFYPCSEIEDPAEKGDRKLNKGLNRNSLPTPQLRR  518

Query  441  SSGTSGLLPVEQSSRWDRNNGKRPHQEFGISSQGCYLNGPFNSNLLTIPKQRSSSVSLTHHVGLRRAGVLSSLS  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  SSGTSGLLPVEQSSRWDRNNGKRPHQEFGISSQGCYLNGPFNSNLLTIPKQRSSSVSLTHHVGLRRAGVLSSLS  592

Query  515  PVNSSNHGPVSTGSLTNRSPIEFPDTADFLNKPSVILQRSLGNAPNTPDFYQQLRNSDSNLCNSCGHQMLKYVS  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  PVNSSNHGPVSTGSLTNRSPIEFPDTADFLNKPSVILQRSLGNAPNTPDFYQQLRNSDSNLCNSCGHQMLKYVS  666

Query  589  TSESDGTDCCSGKSGEEENIFSKESFKLMETQQEEETEKKDSRKLFQEGDKWLTEEAQSEQQTNIEQEVSLDLI  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TSESDGTDCCSGKSGEEENIFSKESFKLMETQQEEETEKKDSRKLFQEGDKWLTEEAQSEQQTNIEQEVSLDLI  740

Query  663  LVEEYDSLIEKMSNWNFPIFELVEKMGEKSGRILSQVMYTLFQDTGLLEIFKIPTQQFMNYFRALENGYRDIPY  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  LVEEYDSLIEKMSNWNFPIFELVEKMGEKSGRILSQVMYTLFQDTGLLEIFKIPTQQFMNYFRALENGYRDIPY  814

Query  737  HNRIHATDVLHAVWYLTTRPVPGLQQIHNGCGTGNETDSDGRINHGRIAYISSKSCSNPDESYGCLSSNIPALE  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  HNRIHATDVLHAVWYLTTRPVPGLQQIHNGCGTGNETDSDGRINHGRIAYISSKSCSNPDESYGCLSSNIPALE  888

Query  811  LMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFLLHLDHVEFKRFRF  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LMALYVAAAMHDYDHPGRTNAFLVATNAPQAVLYNDRSVLENHHAASAWNLYLSRPEYNFLLHLDHVEFKRFRF  962

Query  885  LVIEAILATDLKKHFDFLAEFNAKANDVNSNGIEWSNENDRLLVCQVCIKLADINGPAKVRDLHLKWTEGIVNE  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  LVIEAILATDLKKHFDFLAEFNAKANDVNSNGIEWSNENDRLLVCQVCIKLADINGPAKVRDLHLKWTEGIVNE  1036

Query  959  FYEQGDEEANLGLPISPFMDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGQWLEAEEDNDTESGDDEDGEE  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  FYEQGDEEANLGLPISPFMDRSSPQLAKLQESFITHIVGPLCNSYDAAGLLPGQWLEAEEDNDTESGDDEDGEE  1110

Query 1033  LDTEDEEMENNLNPKPPRRKSRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIVEEEEKCKADGNKLQVENSSLPQADEIQVIE  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  LDTEDEEMENNLNPKPPRRKSRRRIFCQLMHHLTENHKIWKEIVEEEEKCKADGNKLQVENSSLPQADEIQVIE  1184

Query 1107  EADEEE  1112
            ||||||
Sbjct 1185  EADEEE  1190