Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06755
• Subject: NM_172146.2
• Aligned Length: 1553
• Identities: 1335
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGGAGGAGTTGGGGATCCGAGAGGAATGTGGCGTGTTCGGGTGCATCGCCTCAGGAGAGTGGCCCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTGGAGGAGTTGGGGATCCGCGAGGAATGTGGTGTGTTTGGGTGCATCGCTTCTGGAGACTGGCCCAC  74

Query   75  GCAGCTGGATGTACCGCATGTGATCACTCTGGGACTCGTGGGGCTGCAGCACCGGGGTCAGGAGAGTGCTGGTA  148
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GCAGCTAGATGTGCCGCATGTGATCACTCTGGGACTCGTGGGGCTACAGCACCGAGGTCAGGAGAGCGCTGGTA  148

Query  149  TTGTGACTAGTGATGGGAGTTCCGTGCCAACATTCAAATCACACAAGGGAATGGGTCTTGTAAATCACGTCTTT  222
            |||||||.||||||||||||.|.|||||.|.|||||.....||.||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  149  TTGTGACCAGTGATGGGAGTGCAGTGCCTAAATTCAGGGTGCATAAGGGAATGGGTCTTGTAAACCATGTTTTT  222

Query  223  ACTGAAGACAATTTGAAAAAATTATATGTTTCAAATCTTGGAATTGGACACACCAGGTATGCCACCACAGGAAA  296
            ||.||||||||||||||.|||||.||||..|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  ACCGAAGACAATTTGAAGAAATTGTATGACTCAAACCTTGGAATCGGACATACGAGGTACGCCACCACGGGAAA  296

Query  297  ATGTGAACTAGAAAATTGTCAGCCCTTCGTTGTTGAAACACTTCATGGGAAGATAGCTGTGGCACATAATGGCG  370
            .|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  297  GTGTGAGCTGGAAAACTGCCAGCCATTCGTAGTTGAGACGCTTCACGGAAAAATAGCTGTGGCCCATAACGGGG  370

Query  371  AATTGGTAAATGCTGCTCGATTAAGGAAAAAGCTTCTGCGTCATGGTATTGGTCTGTCTACAAGT--TCTGATA  442
            ||.||||.||.||.|||||.||..||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||  ||.||  |||||||
Sbjct  371  AACTGGTGAACGCCGCTCGGTTGCGGAAGAAGCTTCTGCGGCAGGGTATTGGGCTTTC--CACGTCCTCTGATA  442

Query  443  GTGAAATGATTACCCAGTTACTGGCGTATACCCCTCCTCAGGAACAAGATGACACCCCAGACTGGGTAGCCAGG  516
            ||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||.|||||||..|.||||||||||||||.||.
Sbjct  443  GTGAAATGATTACCCAGTTACTCGCATACACCCCTCCTCAAGAAAAAGATGATGCTCCAGACTGGGTAGCAAGA  516

Query  517  ATTAAAAACTTGATGAAGGAAGCACCCACAGCATACTCCCTGCTTATAATGCACAGAGATGTTATTTATGCAGT  590
            |||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||.||..|.|||||.||.||
Sbjct  517  ATTAAGAACTTAATGAAAGAAGCGCCCGCAGCATACTCCCTGGTTATAATGCACAGGGACTTCATTTACGCGGT  590

Query  591  ACGAGATCCTTATGGAAATCGTCCCTTATGCATTGGTCGTCTTATTCCAGTGTCTGATATAAATGACAAAGAGA  664
            .||||||||.||||||||||||||..|.|||||.||.||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  591  GCGAGATCCATATGGAAATCGTCCTCTCTGCATCGGGCGTCTTATGCCAGTCTCTGATGTAAATGACAAAGAGA  664

Query  665  AAAAAACATCAGAAACAGAAGGATGGGTGGTGTCTTCAGAATCTTGTAGCTTCTTATCTATTGGTGCAAGATAT  738
            |||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct  665  AAAAATCCTCAGAAACTGAAGGATGGGTGGTGTCCTCAGAGTCTTGCAGCTTTTTATCCATCGGTGCCAGATAT  738

Query  739  TACCGTGAAGTCTTGCCTGGAGAAATTGTGGAAATATCCAGACACAATGTCCAAACTCTTGATATTATATCAAG  812
            |.||.|||||||...||.|||||||||||.||||||||||||||...|.||..||||||||||||.||..||||
Sbjct  739  TGCCATGAAGTCAAACCCGGAGAAATTGTAGAAATATCCAGACATGGTATCAGAACTCTTGATATAATTCCAAG  812

Query  813  GTCTGAAGGAAACCCAGTGGCTTTTTGTATCTTTGAATATGTTTATTTTGCAAGACCAGACAGTATGTTCGAAG  886
            ||||.|.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  813  GTCTAACGGAGACCCAGTGGCTTTTTGTATTTTTGAATATGTTTATTTTGCAAGACCAGATAGTATGTTTGAAG  886

Query  887  ACCAAATGGTTTATACAGTAAGATACCGTTGTGGCCAGCAGCTAGCGATTGAAGCACCTGTGGATGCAGATTTG  960
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  887  ACCAAATGGTTTATACAGTAAGGTACCGGTGTGGTCAGCAGCTGGCAATTGAAGCACCCGTGGAGGCGGACTTG  960

Query  961  GTTAGCACTGTTCCAGAATCTGCTACGCCTGCTGCTCTTGCTTACGCAGGAAAGTGTGGACTTCCATATGTGGA  1034
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|..||.|||..|||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  961  GTTAGCACAGTTCCAGAGTCTGCTACGCCTGCAGCGCTGGGATATGCAACAAAGTGTGGGCTGCCTTATGTGGA  1034

Query 1035  GGTGCTGTGTAAAAACCGGTATGTAGGGAGAACCTTCATTCAGCCAAACATGAGGTTAAGACAACTTGGTGTTG  1108
            .|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1035  AGTGCTGTGTAAGAACCGGTATGTAGGAAGAACCTTCATTCAACCAAACATGAGGTTAAGACAACTCGGTGTTG  1108

Query 1109  CAAAAAAATTTGGAGTATTGTCAGACAACTTTAAAGGCAAAAGAATTGTTCTTGTAGATGATTCAATTGTCAGA  1182
            ||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1109  CAAAGAAGTTTGGCGTGTTGTCTGACAACTTTAAAGGCAAAAGAATCGTTCTCATAGATGATTCGATTGTGAGG  1182

Query 1183  GGCAATACCATCTCACCTATAATAAAACTGCTCAAAGAATCTGGTGCAAAAGAGGTACACATTCGAGTAGCTTC  1256
            ||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1183  GGCAATACTATCTCACCCATCATAAAACTCCTCAAAGAATCCGGTGCAAAAGAGGTGCACATTCGAGTCGCTTC  1256

Query 1257  ACCACCAATTAAATATCCATGCTTCATGGGAATAAACATTCCTACAAAAGAAGAGCTCATTGCCAATAAACCAG  1330
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1257  ACCACCAATAAAATATCCGTGCTTCATGGGAATAAACATTCCTACAAAAGAAGAGCTCATAGCCAATAAGCCAG  1330

Query 1331  AATTTGATCACCTTGCAGAATATCTAGGAGCAAACAGTGTTGTGTATCTGTCAGTAGAAGGACTGGTTTCATCT  1404
            ||||||||...||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1331  AATTTGATTGTCTTGCAGAGTACCTCGGAGCAAACAGCGTTGTGTATCTGTCAGTGGAAGGACTGGTTTCATCT  1404

Query 1405  GTACAAGAAGGGATAAAGTTTAAAAAACAGAAAGAGAAAAAGCACGATATTATGATCCAAGAAAATGGAAATGG  1478
            ||.|||.|||..|||||.|||||.||.|||||||.||||||.||.||||||...||.|||||||||||||||||
Sbjct 1405  GTGCAACAAGAAATAAAATTTAAGAAGCAGAAAGTGAAAAAACATGATATTGCAATTCAAGAAAATGGAAATGG  1478

Query 1479  TCTGGAATGTTTTGAAAAGAGTGGTCATTGTACAGCTTGTCTCACTGGAAAATATCCTGTAGAATTAGAATGG  1551
            |.||||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.||||||||..|.||.|||||.||..|.||||||
Sbjct 1479  TTTGGAATATTTTGAAAAGACGGGACACTGTACAGCTTGCCTCACTGGGCAGTACCCTGTGGAGCTGGAATGG  1551