Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06792
- Subject:
- NM_001130168.2
- Aligned Length:
- 1279
- Identities:
- 836
- Gaps:
- 389
Alignment
Query 1 ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
|||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAG---------- 64
Query 75 AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG 148
Sbjct 65 -------------------------------------------------------------------------- 64
Query 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC 222
Sbjct 65 -------------------------------------------------------------------------- 64
Query 223 CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA 296
Sbjct 65 -------------------------------------------------------------------------- 64
Query 297 AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA 370
Sbjct 65 -------------------------------------------------------------------------- 64
Query 371 TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG 444
||||||||||||||
Sbjct 65 ------------------------------------------------------------TGGAGACTCCCAAG 78
Query 445 CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC 518
||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 79 CCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC 152
Query 519 TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 592
||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||..|||
Sbjct 153 TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAAA 226
Query 593 CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 227 CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 300
Query 667 GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA 740
|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 301 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA 374
Query 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
|||||||||.||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 CAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 448
Query 815 TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT 888
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 449 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 522
Query 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 523 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAG 596
Query 963 TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1036
|.|||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 670
Query 1037 CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTC-ACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGG 1109
||||||||..||||.|||||||||| ||| .||||.|||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 671 CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGG 743
Query 1110 GAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT 1183
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT 817
Query 1184 CTGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCATGGA 1257
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||| .|||
Sbjct 818 CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTG---ACTG------- 881
Query 1258 GACCTGACAGAGTCTCAGTCA 1278
|||.|.||..
Sbjct 882 GACATTACCC----------- 891