Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06792
- Subject:
- NM_001276495.1
- Aligned Length:
- 1283
- Identities:
- 904
- Gaps:
- 310
Alignment
Query 1 ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG 148
||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG 148
Query 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||||.|||||||..||
Sbjct 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA 296
||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA 296
Query 297 AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA 370
||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 297 AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
Query 371 TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG 444
|||||||||||.|.||||.||||.|||.||.||.|.||||||||||||||||||| ||.|||||
Sbjct 371 TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTT----------ACACCCAA- 433
Query 445 CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC 518
Sbjct 434 -------------------------------------------------------------------------- 433
Query 519 TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 592
||||||||||
Sbjct 434 --------------------------------------------------------------AGCTGTCCAA-- 443
Query 593 CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
Sbjct 444 -------------------------------------------------------------------------- 443
Query 667 GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA 740
.|||||||||||.|||||
Sbjct 444 --------------------------------------------------------GCCCTACATCACAATCAA 461
Query 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
|||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 462 CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA 535
Query 815 TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT 888
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 536 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 609
Query 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG 962
|||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 610 CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 683
Query 963 TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1036
|.|||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 757
Query 1037 CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG 1110
||||||||||||||.||||||||||||||.|.||.||||||||||.||||.|.||||.||||||||||||||||
Sbjct 758 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG 831
Query 1111 AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1184
||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 832 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC 905
Query 1185 TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCA-TGGA 1257
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||| | ||||
Sbjct 906 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTG---------ACTGGA 970
Query 1258 GA----CCTGACAGAGTCTCAGTCA 1278
.| ||
Sbjct 971 TATTACCC----------------- 978