Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06792
• Subject: XM_005259075.4
• Aligned Length: 1487
• Identities: 991
• Gaps: 490

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518

Query  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  815  TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  888
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG  962
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  963  TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1111  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGG--------------  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct  906  TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGGTAAGTGGATCCCAG  979

Query 1245  --TCCCTGCCA-------------TGGAG---ACCTGAC---------AGAGTCTCAGTCA-------------  1278
              |||.||.||             |||||   |.|||.|         ||||  ||||..|             
Sbjct  980  CATCCTTGGCAGTAGGGTTTTATGTGGAGTCTATCTGGCTTTCAGAGAAGAG--TCAGGAAAACATTTTTATTC  1051

Query 1279  --------------------------------------------------------------------------  1278
                                                                                      
Sbjct 1052  CCAGCCTGTGTCCCATGGGCACAAGCAAATCCCAAATTCTCCTCCTGAACCCTCCCAATTTGTCTCTACAGACT  1125

Query 1279  --------------------------------------------------------------------------  1278
                                                                                      
Sbjct 1126  CTCTTCTCCTTGTTTTTCTGTTTTCTTATGGCTGACCTTGTGTCTGGCCTGAAAAAGGTAGGGAGGGGGCTTTA  1199

Query 1279  -------  1278
                   
Sbjct 1200  TCAGCCC  1206