Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06792
• Subject: XM_017027001.2
• Aligned Length: 1292
• Identities: 914
• Gaps: 307

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            ||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.||||||||||||.|||||||..||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370
            ||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444
            |||||||||||.|.||||.||||.|||.||.||.|.|||||||||||||||||||          ||.||||| 
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTT----------ACACCCAA-  433

Query  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518
                                                                                      
Sbjct  434  --------------------------------------------------------------------------  433

Query  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592
                                                                          ||||||||||  
Sbjct  434  --------------------------------------------------------------AGCTGTCCAA--  443

Query  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
                                                                                      
Sbjct  444  --------------------------------------------------------------------------  443

Query  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA  740
                                                                    .|||||||||||.|||||
Sbjct  444  --------------------------------------------------------GCCCTACATCACAATCAA  461

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  462  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA  535

Query  815  TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  888
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  536  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  609

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACAGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG  962
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  610  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  683

Query  963  TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.|||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  1110
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|.||.||||||||||.||||.|.||||.||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1111  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGG--------TCCCTG  1250
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||        ||||.|
Sbjct  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGGTAAGTGGATCCCAG  979

Query 1251  CCATGGAGACC-TGACA-----GAGTCTCAGTCA  1278
             |||     || ||.||     ||.|        
Sbjct  980  -CAT-----CCTTGGCAATAGGGATT--------  999