Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06849
- Subject:
- XM_005269060.5
- Aligned Length:
- 1289
- Identities:
- 1179
- Gaps:
- 100
Alignment
Query 1 ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGAAGCCATATGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGCTATCCGTGACTTCCAGGCCCGGGATTTCGACTTTTGGCTACAATAGAAACAACAAGAAGCCATATGT 74
Query 75 GTCACTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA 148
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCATTGGCTCAGCAGATGGCACCACCTAGCCCAAGCAACAGTACACCTAACAGCAGTAGTGGAAGCAATGGAA 148
Query 149 ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGACCAGCTGAGCAAAACCAACCTATACATCCGAGGATTGCAACCAGGCACTACTGACCAAGATCTTGTCAAG 222
Query 223 CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGTGTCAGCCATATGGCAAGATTGTTTCCACTAAGGCCATACTGGACAAGACCACAAACAAATGTAAAGGCTA 296
Query 297 TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGCTTTGTAGATTTTGACAGCCCTTCAGCAGCACAGAAAGCTGTAACAGCACTGAAGGCCAGCGGTGTACAGG 370
Query 371 CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACAGATGGCAAAGCAACAGGAACAGGACCCCACAAATTTATACATCTCAAACCTCCCACTGTCAATGGATGAG 444
Query 445 CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGGAACTGGAGGGGATGCTGAAGCCCTTTGGCCAGGTTATCTCCACCCGTATCCTTCGAGATACCAGTGGGAC 518
Query 519 CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCAAGGATGGAGTCCACAGAGAAGTGTGAAGCCATCATCACCCACTTTAATGGAA 592
Query 593 AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AATATATTAAGACACCCCCTGGAGTACCAGCCCCATCCGATCCCTTGCTTTGCAAATTTGCTGATGGCGGGCCA 666
Query 667 AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGAAACGACAGAACCAAGGAAAATTTGTGCAAAATGGACGGGCTTGGCCAAGGAATGCAGACATGGGCGTCAT 740
Query 741 GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCCTTGACCTATGACCCCACCACAGCTCTTCAGAATGGGTTTTACCCAGCCCCCTATAACATCACCCCCAACA 814
Query 815 GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGATGCTTGCTCAGTCTGCACTCTCCCCATACCTTTCCTCTCCTGTGTCTTCGTATCAGAGAGTGACTCAGACA 888
Query 889 TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTCCTCTACAAGTACCTAACCCATCCTGGATGCACCACCATTCATACCTCATGCAGCCTTCAGGTTCAGTTCT 962
Query 963 GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACACCAGGGATGGACCATCCCATTTCTCTCCAGCCTGCCTCCATGATGGGACCCCTTACCCAGCAACTGGGCC 1036
Query 1037 ATCTCTCCCTCAGCAGCACAGGCACGTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC 1110
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATCTCTCCCTCAGCAGCACA-----GTATATGCCGACGGCTGCAGCTATGCAAGGAGCTTACATCTCCCAGTAC 1105
Query 1111 ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGAGAGCAGCGGCC---------------AACAGAACCAAG- 1168
|||||||||||||||||||||||||||||||||||...| || ||.|||| |.|
Sbjct 1106 ACCCCTGTGCCTTCTTCCAGTGTTTCAGTCGAGGATTCC-----CCTCCCCATCTTTACTGAATAGAA--ATGA 1172
Query 1169 -----TGGCAG-TGGACGCA--CCCTCAGAGCATGGGGTCTATTCTTTCCA----GTTCAACAAG--------- 1221
||| || | ||.|| |.|.|||| ||||| ||| |||.||
Sbjct 1173 ATTCTTGG-AGAT--ACTCATGCTCCCAGA----------------TTCCAGAGGGTT-AACCAGGAATGGAGA 1226
Query 1222 ------------------------------- 1221
Sbjct 1227 CCATCCGTCGGCCCTGCTAAGGACTAACACT 1257