Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06854
• Subject: NM_008938.1
• Aligned Length: 1038
• Identities: 908
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGCTACTGAAAGTCAAGTTTGACCAGAAGAAGCGGGTCAAGTTGGCCCAAGGGCTCTGGCTCATGAACTG  74
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCTGCTCAAAGTCAAGTTTGACCAGAAGAAGCGGGTCAAGTTGGCCCAGGGGCTCTGGCTTATGAACTG  74

Query   75  GTTCTCCGTGTTGGCTGGCATCATCATCTTCAGCCTAGGACTGTTCCTGAAGATTGGACTCCGAAAGAGGAGCG  148
            |.|.|||||||||||.||||||.||.||||||||.|.||.||||||.|||||||||.|||.||.||||||||||
Sbjct   75  GCTGTCCGTGTTGGCCGGCATCGTCCTCTTCAGCTTGGGGCTGTTCTTGAAGATTGAACTTCGCAAGAGGAGCG  148

Query  149  ATGTGATGAATAATTCTGAGAGCCATTTTGTGCCCAACTCATTGATAGGGATGGGGGTGCTATCCTGTGTCTTC  222
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||.|||||||.||.||||||||||||
Sbjct  149  AAGTGATGAATAATTCTGAGAGCCACTTTGTGCCCAACTCCCTGATAGGGGTGGGGGTCCTGTCCTGTGTCTTC  222

Query  223  AACTCGCTGGCTGGGAAGATCTGCTACGACGCCCTGGACCCAGCCAAGTATGCCAGATGGAAGCCCTGGCTGAA  296
            |||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTCTCTGGCTGGGAAGATCTGCTATGATGCCCTGGACCCGGCCAAGTACGCCAAGTGGAAGCCCTGGCTGAA  296

Query  297  GCCGTACCTGGCTATCTGTGTCCTCTTCAACATCATCCTCTTCCTTGTGGCTCTCTGCTGCTTTCTGCTTCGGG  370
            |||||||||||||.||||..||.||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  297  GCCGTACCTGGCTGTCTGCATCTTCTTTAACGTCATCCTCTTCCTGGTGGCTCTCTGCTGCTTTCTGTTGCGGG  370

Query  371  GCTCGCTGGAGAACACCCTGGGCCAAGGGCTCAAGAACGGCATGAAGTACTACCGGGACACAGACACCCCTGGC  444
            ||||.|||||||.||||||||...|.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct  371  GCTCCCTGGAGAGCACCCTGGCTTACGGACTCAAGAATGGGATGAAGTATTATCGGGATACGGACACCCCCGGC  444

Query  445  AGGTGTTTCATGAAGAAGACCATCGACATGCTGCAGATCGAGTTCAAATGCTGCGGCAACAACGGTTTTCGGGA  518
            .||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  445  CGGTGCTTCATGAAAAAGACCATCGACATGCTCCAGATTGAGTTCAAGTGCTGTGGGAACAACGGCTTCCGGGA  518

Query  519  CTGGTTTGAGATTCAGTGGATCAGCAATCGCTACCTGGACTTTTCCTCCAAAGAAGTCAAAGATCGAATCAAGA  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  519  CTGGTTCGAGATTCAGTGGATCAGCAATCGCTACCTGGACTTCTCCTCCAAGGAGGTCAAAGATCGCATCAAGA  592

Query  593  GCAACGTGGATGGGCGGTACCTGGTGGACGGCGTCCCTTTCAGCTGCTGCAATCCTAGCTCGCCACGGCCCTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct  593  GCAACGTGGATGGGCGGTACCTGGTGGACGGCGTCCCTTTCAGCTGCTGCAACCCCAGCTCCCCGCGGCCCTGT  666

Query  667  ATCCAGTATCAGATCACCAACAACTCAGCACACTACAGTTACGACCACCAGACGGAGGAGCTCAACCTGTGGGT  740
            ||||||||.|||.|||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct  667  ATCCAGTACCAGCTCACCAACAACTCGGCGCACTACAGCTATGACCATCAGACTGAGGAGCTCAACCTCTGGCT  740

Query  741  GCGTGGCTGCAGGGCTGCCCTGCTGAGCTACTACAGCAGCCTCATGAACTCCATGGGTGTCGTCACGCTCCTCA  814
            |||.|||||||||||.||.|||||||..||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||.
Sbjct  741  GCGGGGCTGCAGGGCCGCTCTGCTGAATTACTACAGCAGCCTCATGAATTCCATGGGCGTCGTCACACTTCTCG  814

Query  815  TTTGGCTCTTCGAGGTGACCATTACAATTGGGCTGCGCTACCTACAGACGTCGCTGGATGGTGTGTCCAACCCC  888
            |.||||||||.|||||||.|||.||....||.||.||||||||.||.||..|||||||..|||||||.|||||.
Sbjct  815  TCTGGCTCTTTGAGGTGAGCATCACTGCCGGACTCCGCTACCTCCACACAGCGCTGGAGAGTGTGTCTAACCCG  888

Query  889  GAGGAATCTGAGAGCGAGAGCGAGGGCTGGCTGCTGGAGAAGAGCGTGCCGGAGACCTGGAAGGCCTTTCTGGA  962
            |||||..|.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGGACCCCGAGTGTGAGAGTGAGGGCTGGCTGCTGGAGAAGAGCGTGCCCGAGACCTGGAAGGCCTTTCTGGA  962

Query  963  GAGTGTGAAGAAGCTGGGCAAGGGCAACCAGGTGGAAGCCGAGGGCGCAGGCGCAGGCCAGGCCCCAGAGGCTG  1036
            |||..|.|||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.||.||||.||||||||.|||.||||||||||
Sbjct  963  GAGCTTTAAGAAGCTGGGCAAGAGCAATCAGGTGGAGGCTGAAGGTGCAGACGCAGGCCCGGCTCCAGAGGCTG  1036

Query 1037  GC  1038
            ||
Sbjct 1037  GC  1038