Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06889
- Subject:
- XM_006499022.2
- Aligned Length:
- 1941
- Identities:
- 1672
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC 74
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||..|..|||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCGCTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCACTGCCAGCGTCCAGGCTCTGACCCC 74
Query 75 CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT 148
|||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.|
Sbjct 75 CACCCACTACCTCACCAAGCAGGATGTGGAAAGGCTGAAGGCCTCACTGGACCGCCCCTTCACAGATTTGGAGT 148
Query 149 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||..||||||||.|||||||.|
Sbjct 149 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGGGTACAGGTGCCAGATGTCAAGAAAGCGTGTACCTTC 222
Query 223 ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG 296
||||..||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 223 ATCAAGTCCAACCTTGATCCCAGCAACGTGGATTCTCTCTTCTATGCAGCCCAGTCCAGCCAGGTCCTCTCAGG 296
Query 297 ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC 370
.||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||..|..||.|||
Sbjct 297 CTGTGAGATATCTGTTTCAAATGAGACCAAAGAGCTCCTGCTGGCAGCAGTGAGTGAAGACTCCCCCATTGCCC 370
Query 371 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT 444
||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||.||||||||
Sbjct 371 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCACTCAGCGGGTTTGGGCTTCCCTTGGCATCCAATGAAGCCCTCGGTGCCCTT 444
Query 445 ACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCA 518
||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 445 ACCGCTCGCCTCGGCAAGGAAGAGACTGTGCTAGCAACGGTCCAGGCTCTGCAGACAGCGTCCCACCTCTCCCA 518
Query 519 GCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGT 592
|||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 GCAGGCTGACCTGAGGAACATTGTAGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGGCTGGATGAACTAGGGGGTGTGT 592
Query 593 ATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTG 666
||||.||||||||.|||||||||||....||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 593 ATCTGCAGTTTGAGGAAGGACTGGAGCTCACGGCGCTGTTTGTTGCTGCCACCTACAAGCTCATGGACCACGTG 666
Query 667 GGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA 740
|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGACCGAACCGTCCATGAAGGAGGATCAGGTTATCCAGCTCATGAACACAATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGA 740
Query 741 GTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTG 814
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||...|.||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 741 GTCCCTCTCAGAAGCCTTCAGTGTGGCCTCTGCTGCTGCTGCATTGTCCCAGAATCGCTACCACGTACCAGTGG 814
Query 815 TGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTG 888
||||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||.||||.|||||||.||
Sbjct 815 TGGTTGTGCCCGAGGGCTCTACTTCTGACACTCAAGAACAGGCTATCCTGAGGTTGCAGGTCAGCAATGTTTTG 888
Query 889 TCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCA 962
||||||||||||.||||.||..|.||.||.||.||.||||||||.||.|..|||.||||.||.||.|||||.||
Sbjct 889 TCTCAGCCTCTGGCTCAAGCTGCAGTGAAGCTGGAGCATGCTAAGTCGGCGGCTACCAGGGCTACCGTCCTGCA 962
Query 963 GAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATT 1036
||||||..||||..|.|.|||.|||.||||||||||.|||||.||||.|||.||.|||.||||||||||.||.|
Sbjct 963 GAAGACGCCCTTTTCGCTTGTGGGGAATGTTTTTGAGCTAAACTTCAAGAATGTTAAACTTTCCAGTGGCTACT 1036
Query 1037 ATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCC 1110
||||||||..||||..||||||||||||||.|||.||.||||||||.||.||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGACTTCTCTGTCCGAGTTGAAGGTGACAGCCGTTACATTGCAAACACTGTAGAGCTTCGAGTCAAGATCTCC 1110
Query 1111 ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACTGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCG 1184
Query 1185 GGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGC 1258
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||
Sbjct 1185 GGTGACCTACCCAGCCAAAGCCAAGGGTACATTCATCGCAGACAGCCATCAGAACTTTGCCCTGTTTTTCCAGC 1258
Query 1259 TGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGC 1332
||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGTAGATGTGAACACCGGTGCGGAGCTCACCCCTCACCAGACGTTTGTTCGACTTCATAACCAGAAGACTGGC 1332
Query 1333 CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAA 1406
||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1333 CAGGAAGTGGTGTTTGTTGCTGAGCCAGATAACAAGAATGTATATAAGTTTGAACTGGACACCTCTGAAAGGAA 1406
Query 1407 GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAA 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407 GATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACACTCTACTTAATCATCGGGGATGCCACATTGAAGAACCCAA 1480
Query 1481 TCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAAC 1554
||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||.|
Sbjct 1481 TCCTCTGGAACGTGGCTGACGTGGTTATCAAGTTCCCTGAGGAGGAAGCCCCCTCGACTGTGCTGTCCCAGAGC 1554
Query 1555 CTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAA 1628
||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 CTGTTTACCCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGAGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACAGTGGTGTCCAA 1628
Query 1629 TACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCT 1702
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1629 TACATTCACGGCCCTCATCCTCTCGCCCTTGCTCCTGCTCTTTGCACTGTGGATCCGGATTGGAGCCAATGTCT 1702
Query 1703 CCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTC 1776
||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||
Sbjct 1703 CCAACTTCACATTTGCTCCTAGCACAGTTATCTTCCACCTGGGACATGCTGCGATGCTGGGCCTCATGTATATC 1776
Query 1777 TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||..||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCCTCAAGTACCTGGCTGTCCTGGGCACTGTGACGTTTCTGGCTGG 1850
Query 1851 CAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGA------------------------------------------ 1882
|||.||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1851 CAACCGAATGCTGGCCCAGCATGCAGTTAAGAGGATCGCTGCAGAGCAGAGCAGTAGATTGGCAAAATATAGGA 1924
Query 1883 ------GAACAGCACAT 1893
|||||||||||
Sbjct 1925 CACTACGAACAGCACAT 1941