Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06992
• Subject: NM_001025395.2
• Aligned Length: 1702
• Identities: 1320
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGACGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCTCGGAAAACGTGCA  74

Query   75  CGGCGCTGGC-GGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGC  147
            |||    ||| ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct   75  CGG----GGCAGGGGGCGCCTTCCCGGCCTCACAGACACCGAGCAAGCCCGCCTCCGCCGACGGCCACCGCGGG  144

Query  148  CCCAGCGCGGCCTTCG---CCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT  218
            ||||||||.|||||||   |.||||||   ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  CCCAGCGCCGCCTTCGTGCCGCCCGCG---GCCGAGCCCAAGCTCTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT  215

Query  219  CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTA  292
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  216  CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGGCCTCTGGCAGGTGGGGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCAC  289

Query  293  GGACGGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACACAGAGGGAGACTGGTGG  366
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  290  GGACAGAGACTGACCTGTCCTTCAAGAAAGGGGAGCGGCTGCAGATTGTCAATAACACAGAGGGAGACTGGTGG  363

Query  367  CTGGCCCACTCGCTCAGCACAGGACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCA  440
            |||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  CTGGCACACTCGCTGAGCACGGGACAGACCGGTTACATCCCCAGCAACTATGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCA  437

Query  441  GGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCAAGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAATGCAGAGAACCCGA  514
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||
Sbjct  438  GGCTGAGGAGTGGTACTTTGGCAAGATCACTAGACGGGAATCAGAGCGGCTGCTGCTCAACGCCGAGAACCCGA  511

Query  515  GAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAAAGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGTCTGACTTCGACAAC  588
            |||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  512  GAGGGACCTTCCTCGTGAGGGAGAGTGAGACCACAAAAGGTGCCTACTGCCTCTCTGTATCCGACTTCGACAAT  585

Query  589  GCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTACATCACCTCCCGCAC  662
            |||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  586  GCCAAGGGCCTAAATGTGAAACACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGTTTCTACATCACCTCCCGCAC  659

Query  663  CCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGCTGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTGCCACCGCCTCACCA  736
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  660  CCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGCTCGTGGCTTACTACTCCAAACATGCTGATGGCCTGTGTCACCGCCTCACTA  733

Query  737  CCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCGCAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCCCTCGGGAGTCGCTG  810
            ||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  734  CCGTATGTCCCACATCCAAGCCTCAGACCCAGGGATTGGCCAAGGATGCGTGGGAGATCCCCCGGGAGTCCCTG  807

Query  811  CGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGTACCACCAGGGT  884
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  808  CGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGTTGCTTCGGAGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGCACCACGAGGGT  881

Query  885  GGCCATCAAAACCCTGAAGCCTGGCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAGGTCATGAAGAAGC  958
            .|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  882  TGCCATCAAAACTCTGAAGCCAGGCACCATGTCCCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAAGTCATGAAGAAAC  955

Query  959  TGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATG  1032
            |||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  956  TGAGGCACGAGAAACTGGTGCAGCTGTATGCTGTGGTGTCGGAAGAACCCATTTACATTGTGACAGAGTACATG  1029

Query 1033  AGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCTCAGCTGGTGGACAT  1106
            |.||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1030  AACAAGGGGAGTCTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAAACGGGCAAATATTTGCGGCTACCCCAGCTGGTGGACAT  1103

Query 1107  GGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCATGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGACCTTCGTGCAGCCA  1180
            |.|||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1104  GTCTGCTCAGATCGCTTCAGGCATGGCCTATGTGGAGCGGATGAACTATGTGCACCGGGACCTTCGAGCCGCCA  1177

Query 1181  ACATCCTGGTGGGAGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCTTAG------ACGAA  1248
            |.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||      |||||
Sbjct 1178  ATATCCTAGTAGGGGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGTTGGCCCGGCTCATAGAAGACAACGAA  1251

Query 1249  CCACACATGGAGTTAAGGACATGCAAGGTGTC-GATTCCACAAACTAGTGCA-AGTTCCAGAACCTGCCCTATA  1320
             .|||||          |.|..||||||||.| .||||| |.|.|.||||.| .|..||.|||.||||.||.||
Sbjct 1252  -TACACA----------GCCCGGCAAGGTGCCAAATTCC-CCATCAAGTGGACCGCCCCTGAAGCTGCTCTGTA  1313

Query 1321  -------TTTGAAATCAGCATCTAGTAGGAACAGGGGTCTTTCTAGATCTTGTAAATGATTAAAGAAAAATAAA  1387
                   |      |||.||||.|||.|||...|.||||.||...|||..||   .|||               
Sbjct 1314  CGGCAGGT------TCACCATCAAGTCGGATGTGTGGTCCTTTGGGATTCTG---CTGA---------------  1363

Query 1388  GGTTCC-AGCGCATCAGAAAGGACGCAAAAGGTAGGAACCCATAACAAGAAGA--GCCAACCTAT------ATG  1452
                || |||.||.||..||||                          |||||  ||   |||||      |||
Sbjct 1364  ----CCGAGCTCACCACTAAGG--------------------------GAAGAGTGC---CCTATCCTGGGATG  1404

Query 1453  G----CCGAAA--------AAAA-------------TACCGGAGTGC-------------GCGCCC--------  1480
            |    |||..|        |..|             ||||||| |||             |.||||        
Sbjct 1405  GTGAACCGTGAGGTTCTGGACCAGGTGGAGCGGGGCTACCGGA-TGCCTTGTCCCCCCGAGTGCCCCGAGTCCC  1477

Query 1481  -----GCCCTCATGTG--AGATAAGTTGGAAGGAACCAGAGGAACGACCCATTGGAAGATTACCAGTCTTCGGT  1547
                 |.|||.|||||  ||....|..|||||||.||.|||||.||.||||               .|||||  
Sbjct 1478  TGCATGACCTTATGTGCCAGTGCTGGCGGAAGGAGCCCGAGGAGCGGCCCA---------------CCTTCG--  1534

Query 1548  TAGTAGAAATGCA----TTC----AAAACCCCT---CATCC--------------CAAGCGATGGG-GAACCTC  1595
             |||  |..||||    |||    ||.||..||   |.|||              |.|||...||| ||||||.
Sbjct 1535  -AGT--ACCTGCAGGCCTTCCTGGAAGACTACTTTACGTCCACTGAGCCACAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTA  1605