Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06992
- Subject:
- XM_006499065.3
- Aligned Length:
- 1753
- Identities:
- 1320
- Gaps:
- 255
Alignment
Query 1 ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA 74
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGGCAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGACGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCTCGGAAAACGTGCA 74
Query 75 CGGCGCTGGC-GGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGC 147
||| ||| ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 75 CGG----GGCAGGGGGCGCCTTCCCGGCCTCACAGACACCGAGCAAGCCCGCCTCCGCCGACGGCCACCGCGGG 144
Query 148 CCCAGCGCGGCCTTCG---CCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT 218
||||||||.||||||| |.|||||| ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 CCCAGCGCCGCCTTCGTGCCGCCCGCG---GCCGAGCCCAAGCTCTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT 215
Query 219 CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTA 292
|||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 216 CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGGCCTCTGGCAGGTGGGGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCAC 289
Query 293 GGACGGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACAC---------------- 350
||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 290 GGACAGAGACTGACCTGTCCTTCAAGAAAGGGGAGCGGCTGCAGATTGTCAATAACACGAGGAAGGTGGATGTC 363
Query 351 -----------------------------------AGAGGGAGACTGGTGGCTGGCCCACTCGCTCAGCACAGG 389
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 364 AGCCAGACCTGGTTCACATTCAGATGGCTGCAAAGAGAGGGAGACTGGTGGCTGGCACACTCGCTGAGCACGGG 437
Query 390 ACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCA 463
||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 438 ACAGACCGGTTACATCCCCAGCAACTATGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTACTTTGGCA 511
Query 464 AGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAATGCAGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAA 537
|||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.
Sbjct 512 AGATCACTAGACGGGAATCAGAGCGGCTGCTGCTCAACGCCGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGAGGGAG 585
Query 538 AGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGTCTGACTTCGACAACGCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCA 611
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 586 AGTGAGACCACAAAAGGTGCCTACTGCCTCTCTGTATCCGACTTCGACAATGCCAAGGGCCTAAATGTGAAACA 659
Query 612 CTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGC 685
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGTTTCTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGC 733
Query 686 TGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTGCCACCGCCTCACCACCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCG 759
|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 734 TCGTGGCTTACTACTCCAAACATGCTGATGGCCTGTGTCACCGCCTCACTACCGTATGTCCCACATCCAAGCCT 807
Query 760 CAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCCCTCGGGAGTCGCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCA 833
|||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 CAGACCCAGGGATTGGCCAAGGATGCGTGGGAGATCCCCCGGGAGTCCCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCA 881
Query 834 GGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGTACCACCAGGGTGGCCATCAAAACCCTGAAGCCTG 907
|||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 882 GGGTTGCTTCGGAGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGCACCACGAGGGTTGCCATCAAAACTCTGAAGCCAG 955
Query 908 GCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAGGTCATGAAGAAGCTGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAG 981
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 956 GCACCATGTCCCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAAGTCATGAAGAAACTGAGGCACGAGAAACTGGTGCAG 1029
Query 982 TTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGAGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTT 1055
.|||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1030 CTGTATGCTGTGGTGTCGGAAGAACCCATTTACATTGTGACAGAGTACATGAACAAGGGGAGTCTGCTGGACTT 1103
Query 1056 TCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCTCAGCTGGTGGACATGGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCA 1129
||||||||||||.||.|||||.||..|||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 1104 TCTCAAGGGGGAAACGGGCAAATATTTGCGGCTACCCCAGCTGGTGGACATGTCTGCTCAGATCGCTTCAGGCA 1177
Query 1130 TGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGACCTTCGTGCAGCCAACATCCTGGTGGGAGAGAACCTG 1203
||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1178 TGGCCTATGTGGAGCGGATGAACTATGTGCACCGGGACCTTCGAGCCGCCAATATCCTAGTAGGGGAGAACCTG 1251
Query 1204 GTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCTTAG------ACGAACCACACATGGAGTTAAGGACATG 1271
||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||| ||||| .||||| |.|..|
Sbjct 1252 GTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGTTGGCCCGGCTCATAGAAGACAACGAA-TACACA----------GCCCGG 1314
Query 1272 CAAGGTGTC-GATTCCACAAACTAGTGCA-AGTTCCAGAACCTGCCCTATA-------TTTGAAATCAGCATCT 1336
|||||||.| .||||| |.|.|.||||.| .|..||.|||.||||.||.|| | |||.||||.
Sbjct 1315 CAAGGTGCCAAATTCC-CCATCAAGTGGACCGCCCCTGAAGCTGCTCTGTACGGCAGGT------TCACCATCA 1381
Query 1337 AGTAGGAACAGGGGTCTTTCTAGATCTTGTAAATGATTAAAGAAAAATAAAGGTTCC-AGCGCATCAGAAAGGA 1409
|||.|||...|.||||.||...|||..|| .||| || |||.||.||..||||
Sbjct 1382 AGTCGGATGTGTGGTCCTTTGGGATTCTG---CTGA-------------------CCGAGCTCACCACTAAGG- 1432
Query 1410 CGCAAAAGGTAGGAACCCATAACAAGAAGA--GCCAACCTAT------ATGG----CCGAAA--------AAAA 1463
||||| || ||||| |||| |||..| |..|
Sbjct 1433 -------------------------GAAGAGTGC---CCTATCCTGGGATGGTGAACCGTGAGGTTCTGGACCA 1478
Query 1464 -------------TACCGGAGTGC-------------GCGCCC-------------GCCCTCATGTG--AGATA 1496
||||||| ||| |.|||| |.|||.||||| ||...
Sbjct 1479 GGTGGAGCGGGGCTACCGGA-TGCCTTGTCCCCCCGAGTGCCCCGAGTCCCTGCATGACCTTATGTGCCAGTGC 1551
Query 1497 AGTTGGAAGGAACCAGAGGAACGACCCATTGGAAGATTACCAGTCTTCGGTTAGTAGAAATGCA----TTC--- 1563
.|..|||||||.||.|||||.||.|||| .||||| ||| |..|||| |||
Sbjct 1552 TGGCGGAAGGAGCCCGAGGAGCGGCCCA---------------CCTTCG---AGT--ACCTGCAGGCCTTCCTG 1605
Query 1564 -AAAACCCCT---CATCC--------------CAAGCGATGGG-GAACCTC 1595
||.||..|| |.||| |.|||...||| ||||||.
Sbjct 1606 GAAGACTACTTTACGTCCACTGAGCCACAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTA 1656