Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06992
• Subject: XM_011239402.2
• Aligned Length: 1753
• Identities: 1320
• Gaps: 255

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGACGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCTCGGAAAACGTGCA  74

Query   75  CGGCGCTGGC-GGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGC  147
            |||    ||| ||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct   75  CGG----GGCAGGGGGCGCCTTCCCGGCCTCACAGACACCGAGCAAGCCCGCCTCCGCCGACGGCCACCGCGGG  144

Query  148  CCCAGCGCGGCCTTCG---CCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT  218
            ||||||||.|||||||   |.||||||   ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  CCCAGCGCCGCCTTCGTGCCGCCCGCG---GCCGAGCCCAAGCTCTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGT  215

Query  219  CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTA  292
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  216  CACCTCCCCGCAGAGGGCGGGGCCTCTGGCAGGTGGGGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCAC  289

Query  293  GGACGGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACAC----------------  350
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||                
Sbjct  290  GGACAGAGACTGACCTGTCCTTCAAGAAAGGGGAGCGGCTGCAGATTGTCAATAACACGAGGAAGGTGGATGTC  363

Query  351  -----------------------------------AGAGGGAGACTGGTGGCTGGCCCACTCGCTCAGCACAGG  389
                                               |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  364  AGCCAGACCTGGTTCACATTCAGATGGCTGCAAAGAGAGGGAGACTGGTGGCTGGCACACTCGCTGAGCACGGG  437

Query  390  ACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCA  463
            ||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  438  ACAGACCGGTTACATCCCCAGCAACTATGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTACTTTGGCA  511

Query  464  AGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAATGCAGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAA  537
            |||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||.
Sbjct  512  AGATCACTAGACGGGAATCAGAGCGGCTGCTGCTCAACGCCGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGAGGGAG  585

Query  538  AGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGTCTGACTTCGACAACGCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCA  611
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  586  AGTGAGACCACAAAAGGTGCCTACTGCCTCTCTGTATCCGACTTCGACAATGCCAAGGGCCTAAATGTGAAACA  659

Query  612  CTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGC  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  CTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGTTTCTACATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGC  733

Query  686  TGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTGCCACCGCCTCACCACCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCG  759
            |.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  734  TCGTGGCTTACTACTCCAAACATGCTGATGGCCTGTGTCACCGCCTCACTACCGTATGTCCCACATCCAAGCCT  807

Query  760  CAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCCCTCGGGAGTCGCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCA  833
            |||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  CAGACCCAGGGATTGGCCAAGGATGCGTGGGAGATCCCCCGGGAGTCCCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCA  881

Query  834  GGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGTACCACCAGGGTGGCCATCAAAACCCTGAAGCCTG  907
            |||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct  882  GGGTTGCTTCGGAGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGCACCACGAGGGTTGCCATCAAAACTCTGAAGCCAG  955

Query  908  GCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAGGTCATGAAGAAGCTGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAG  981
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  956  GCACCATGTCCCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAAGTCATGAAGAAACTGAGGCACGAGAAACTGGTGCAG  1029

Query  982  TTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGAGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTT  1055
            .|||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1030  CTGTATGCTGTGGTGTCGGAAGAACCCATTTACATTGTGACAGAGTACATGAACAAGGGGAGTCTGCTGGACTT  1103

Query 1056  TCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCTCAGCTGGTGGACATGGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCA  1129
            ||||||||||||.||.|||||.||..|||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 1104  TCTCAAGGGGGAAACGGGCAAATATTTGCGGCTACCCCAGCTGGTGGACATGTCTGCTCAGATCGCTTCAGGCA  1177

Query 1130  TGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGACCTTCGTGCAGCCAACATCCTGGTGGGAGAGAACCTG  1203
            ||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1178  TGGCCTATGTGGAGCGGATGAACTATGTGCACCGGGACCTTCGAGCCGCCAATATCCTAGTAGGGGAGAACCTG  1251

Query 1204  GTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCTTAG------ACGAACCACACATGGAGTTAAGGACATG  1271
            ||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||      ||||| .|||||          |.|..|
Sbjct 1252  GTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGTTGGCCCGGCTCATAGAAGACAACGAA-TACACA----------GCCCGG  1314

Query 1272  CAAGGTGTC-GATTCCACAAACTAGTGCA-AGTTCCAGAACCTGCCCTATA-------TTTGAAATCAGCATCT  1336
            |||||||.| .||||| |.|.|.||||.| .|..||.|||.||||.||.||       |      |||.||||.
Sbjct 1315  CAAGGTGCCAAATTCC-CCATCAAGTGGACCGCCCCTGAAGCTGCTCTGTACGGCAGGT------TCACCATCA  1381

Query 1337  AGTAGGAACAGGGGTCTTTCTAGATCTTGTAAATGATTAAAGAAAAATAAAGGTTCC-AGCGCATCAGAAAGGA  1409
            |||.|||...|.||||.||...|||..||   .|||                   || |||.||.||..|||| 
Sbjct 1382  AGTCGGATGTGTGGTCCTTTGGGATTCTG---CTGA-------------------CCGAGCTCACCACTAAGG-  1432

Query 1410  CGCAAAAGGTAGGAACCCATAACAAGAAGA--GCCAACCTAT------ATGG----CCGAAA--------AAAA  1463
                                     |||||  ||   |||||      ||||    |||..|        |..|
Sbjct 1433  -------------------------GAAGAGTGC---CCTATCCTGGGATGGTGAACCGTGAGGTTCTGGACCA  1478

Query 1464  -------------TACCGGAGTGC-------------GCGCCC-------------GCCCTCATGTG--AGATA  1496
                         ||||||| |||             |.||||             |.|||.|||||  ||...
Sbjct 1479  GGTGGAGCGGGGCTACCGGA-TGCCTTGTCCCCCCGAGTGCCCCGAGTCCCTGCATGACCTTATGTGCCAGTGC  1551

Query 1497  AGTTGGAAGGAACCAGAGGAACGACCCATTGGAAGATTACCAGTCTTCGGTTAGTAGAAATGCA----TTC---  1563
            .|..|||||||.||.|||||.||.||||               .|||||   |||  |..||||    |||   
Sbjct 1552  TGGCGGAAGGAGCCCGAGGAGCGGCCCA---------------CCTTCG---AGT--ACCTGCAGGCCTTCCTG  1605

Query 1564  -AAAACCCCT---CATCC--------------CAAGCGATGGG-GAACCTC  1595
             ||.||..||   |.|||              |.|||...||| ||||||.
Sbjct 1606  GAAGACTACTTTACGTCCACTGAGCCACAGTACCAGCCCGGGGAGAACCTA  1656