Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06992
• Subject: XM_011529013.2
• Aligned Length: 1673
• Identities: 1459
• Gaps: 143

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA  74

Query   75  CGGCGCTGGCGGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCGCTGGCGGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGCC  148

Query  149  CCAGCGCGGCCTTCGCCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGTCACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGCGCGGCCTTCGCCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGTCACC  222

Query  223  TCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTAGGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTAGGAC  296

Query  297  GGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACACAGAGGGAGACTGGTGGCTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACACAGAGGGAGACTGGTGGCTGG  370

Query  371  CCCACTCGCTCAGCACAGGACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCACTCGCTCAGCACAGGACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCCTCCGACTCCATCCAGGCT  444

Query  445  GAGGAGTGGTATTTTGGCAAGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAATGCAGAGAACCCGAGAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGAGTGGTATTTTGGCAAGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAATGCAGAGAACCCGAGAGG  518

Query  519  GACCTTCCTCGTGCGAGAAAGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGTCTGACTTCGACAACGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACCTTCCTCGTGCGAGAAAGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGTCTGACTTCGACAACGCCA  592

Query  593  AGGGCCTCAACGTGAAGCACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTACATCACCTCCCGCACCCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGGCCTCAACGTGAAGCACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTACATCACCTCCCGCACCCAG  666

Query  667  TTCAACAGCCTGCAGCAGCTGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTGCCACCGCCTCACCACCGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCAACAGCCTGCAGCAGCTGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTGCCACCGCCTCACCACCGT  740

Query  741  GTGCCCCACGTCCAAGCCGCAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCCCTCGGGAGTCGCTGCGGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGCCCCACGTCCAAGCCGCAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCCCTCGGGAGTCGCTGCGGC  814

Query  815  TGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGTACCACCAGGGTGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAACGGTACCACCAGGGTGGCC  888

Query  889  ATCAAAACCCTGAAGCCTGGCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAGGTCATGAAGAAGCTGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCAAAACCCTGAAGCCTGGCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCAGGTCATGAAGAAGCTGAG  962

Query  963  GCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGAGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGAGCA  1036

Query 1037  AGGGGAGTTTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCTCAGCTGGTGGACATGGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGGGAGTTTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCTCAGCTGGTGGACATGGCT  1110

Query 1111  GCTCAGATCGCCTCAGGCATGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGACCTTCGTGCAGCCAACAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTCAGATCGCCTCAGGCATGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGACCTTCGTGCAGCCAACAT  1184

Query 1185  CCTGGTGGGAGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCTTAGACGAACCACACATGG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||      |.|||..|
Sbjct 1185  CCTGGTGGGAGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCGGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCATTGA------AGACAATG  1252

Query 1259  AGTTAAGGACA------TGCAAGGTGTC-GATTCCACAAACTAGTGCA-AGTTCCAGAACCTGCCCTATAT---  1321
            |||     |||      .||||||||.| .||||| |.|.|.||||.| .|.|||||||.|||||||.|||   
Sbjct 1253  AGT-----ACACGGCGCGGCAAGGTGCCAAATTCC-CCATCAAGTGGACGGCTCCAGAAGCTGCCCTCTATGGC  1320

Query 1322  ---TTGAAATCAGCATCTAGTAGGAACAGGGGTCTTTCTAGATCTTG-TAAATGATTAAAGAAAAATAAAGGTT  1391
               |     |||.||||.|||.|||...|.||||.|||..||||.|| |.|.||                    
Sbjct 1321  CGCT-----TCACCATCAAGTCGGACGTGTGGTCCTTCGGGATCCTGCTGACTG--------------------  1369

Query 1392  CCAGCGCATCAGAAA-GGACG------CAA-------AAGGTAGGAACC-------------CATAACAAGAAG  1438
              |||.||.||.||| |||||      |.|       |.|||  |||||             |    ||.|..|
Sbjct 1370  --AGCTCACCACAAAGGGACGGGTGCCCTACCCTGGGATGGT--GAACCGCGAGGTGCTGGAC----CAGGTGG  1435

Query 1439  AGC----CAACC-TAT---ATGGCCGAAAAAAATACCGGAGTG---------CGCGCCCGCCCTCATGTG--AG  1493
            |||    |.||| .||   .||.|||         ||||||||         |..||.||.|||||||||  ||
Sbjct 1436  AGCGGGGCTACCGGATGCCCTGCCCG---------CCGGAGTGTCCCGAGTCCCTGCACGACCTCATGTGCCAG  1500

Query 1494  ATAAGTTGGAAGGAACCAGAGGAACGACCCA--TTGGAAGATTACC----AGTCTTC--GGTTAGTAGAAATGC  1559
            ....|..|||||||.||.|||||.||.||||  ||   .||.||||    .|.||||  ||     ||.|.|.|
Sbjct 1501  TGCTGGCGGAAGGAGCCTGAGGAGCGGCCCACCTT---CGAGTACCTGCAGGCCTTCCTGG-----AGGACTAC  1566

Query 1560  ATTCAAAACCCCTCATCCCAAG--------CGATGGG-GAACCTC  1595
             ||||...||.|..|.|||.||        ||  ||| |||||||
Sbjct 1567  -TTCACGTCCACCGAGCCCCAGTACCAGCCCG--GGGAGAACCTC  1608