Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06992
• Subject: XM_017028025.1
• Aligned Length: 1691
• Identities: 1459
• Gaps: 161

Alignment

Query    1  ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTAGCAACAAGAGCAAGCCCAAGGATGCCAGCCAGCGGCGCCGCAGCCTGGAGCCCGCCGAGAACGTGCA  74

Query   75  CGGCGCTGGCGGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCGCTGGCGGGGGCGCTTTCCCCGCCTCGCAGACCCCCAGCAAGCCAGCCTCGGCCGACGGCCACCGCGGCC  148

Query  149  CCAGCGCGGCCTTCGCCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGTCACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGCGCGGCCTTCGCCCCCGCGGCCGCCGAGCCCAAGCTGTTCGGAGGCTTCAACTCCTCGGACACCGTCACC  222

Query  223  TCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTAGGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCCCGCAGAGGGCGGGCCCGCTGGCCGGTGGAGTGACCACCTTTGTGGCCCTCTATGACTATGAGTCTAGGAC  296

Query  297  GGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACAC------------------AG  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||
Sbjct  297  GGAGACAGACCTGTCCTTCAAGAAAGGCGAGCGGCTCCAGATTGTCAACAACACGAGGAAGGTGGATGTCAGAG  370

Query  353  AGGGAGACTGGTGGCTGGCCCACTCGCTCAGCACAGGACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGGAGACTGGTGGCTGGCCCACTCGCTCAGCACAGGACAGACAGGCTACATCCCCAGCAACTACGTGGCGCCC  444

Query  427  TCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCAAGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCGACTCCATCCAGGCTGAGGAGTGGTATTTTGGCAAGATCACCAGACGGGAGTCAGAGCGGTTACTGCTCAA  518

Query  501  TGCAGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAAAGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGT  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCAGAGAACCCGAGAGGGACCTTCCTCGTGCGAGAAAGTGAGACCACGAAAGGTGCCTACTGCCTCTCAGTGT  592

Query  575  CTGACTTCGACAACGCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTAC  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGACTTCGACAACGCCAAGGGCCTCAACGTGAAGCACTACAAGATCCGCAAGCTGGACAGCGGCGGCTTCTAC  666

Query  649  ATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGCTGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTG  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCACCTCCCGCACCCAGTTCAACAGCCTGCAGCAGCTGGTGGCCTACTACTCCAAACACGCCGATGGCCTGTG  740

Query  723  CCACCGCCTCACCACCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCGCAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACCGCCTCACCACCGTGTGCCCCACGTCCAAGCCGCAGACTCAGGGCCTGGCCAAGGATGCCTGGGAGATCC  814

Query  797  CTCGGGAGTCGCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAAC  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCGGGAGTCGCTGCGGCTGGAGGTCAAGCTGGGCCAGGGCTGCTTTGGCGAGGTGTGGATGGGGACCTGGAAC  888

Query  871  GGTACCACCAGGGTGGCCATCAAAACCCTGAAGCCTGGCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCA  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTACCACCAGGGTGGCCATCAAAACCCTGAAGCCTGGCACGATGTCTCCAGAGGCCTTCCTGCAGGAGGCCCA  962

Query  945  GGTCATGAAGAAGCTGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCG  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTCATGAAGAAGCTGAGGCATGAGAAGCTGGTGCAGTTGTATGCTGTGGTTTCAGAGGAGCCCATTTACATCG  1036

Query 1019  TCACGGAGTACATGAGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCT  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCACGGAGTACATGAGCAAGGGGAGTTTGCTGGACTTTCTCAAGGGGGAGACAGGCAAGTACCTGCGGCTGCCT  1110

Query 1093  CAGCTGGTGGACATGGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCATGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCTGGTGGACATGGCTGCTCAGATCGCCTCAGGCATGGCGTACGTGGAGCGGATGAACTACGTCCACCGGGA  1184

Query 1167  CCTTCGTGCAGCCAACATCCTGGTGGGAGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCT  1240
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 1185  CCTTCGTGCAGCCAACATCCTGGTGGGAGAGAACCTGGTGTGCAAAGTGGCGGACTTTGGGCTGGCTCGGCTCA  1258

Query 1241  TAGACGAACCACACATGGAGTTAAGGACA------TGCAAGGTGTC-GATTCCACAAACTAGTGCA-AGTTCCA  1306
            |.||      |.|||..||||     |||      .||||||||.| .||||| |.|.|.||||.| .|.||||
Sbjct 1259  TTGA------AGACAATGAGT-----ACACGGCGCGGCAAGGTGCCAAATTCC-CCATCAAGTGGACGGCTCCA  1320

Query 1307  GAACCTGCCCTATAT------TTGAAATCAGCATCTAGTAGGAACAGGGGTCTTTCTAGATCTTG-TAAATGAT  1373
            |||.|||||||.|||      |     |||.||||.|||.|||...|.||||.|||..||||.|| |.|.||  
Sbjct 1321  GAAGCTGCCCTCTATGGCCGCT-----TCACCATCAAGTCGGACGTGTGGTCCTTCGGGATCCTGCTGACTG--  1387

Query 1374  TAAAGAAAAATAAAGGTTCCAGCGCATCAGAAA-GGACG------CAA-------AAGGTAGGAACC-------  1426
                                |||.||.||.||| |||||      |.|       |.|||  |||||       
Sbjct 1388  --------------------AGCTCACCACAAAGGGACGGGTGCCCTACCCTGGGATGGT--GAACCGCGAGGT  1439

Query 1427  ------CATAACAAGAAGAGC----CAACC-TAT---ATGGCCGAAAAAAATACCGGAGTG---------CGCG  1477
                  |    ||.|..||||    |.||| .||   .||.|||         ||||||||         |..|
Sbjct 1440  GCTGGAC----CAGGTGGAGCGGGGCTACCGGATGCCCTGCCCG---------CCGGAGTGTCCCGAGTCCCTG  1500

Query 1478  CCCGCCCTCATGTG--AGATAAGTTGGAAGGAACCAGAGGAACGACCCA--TTGGAAGATTACC----AGTCTT  1543
            |.||.|||||||||  ||....|..|||||||.||.|||||.||.||||  ||   .||.||||    .|.|||
Sbjct 1501  CACGACCTCATGTGCCAGTGCTGGCGGAAGGAGCCTGAGGAGCGGCCCACCTT---CGAGTACCTGCAGGCCTT  1571

Query 1544  C--GGTTAGTAGAAATGCATTCAAAACCCCTCATCCCAAG--------CGATGGG-GAACCTC  1595
            |  ||     ||.|.|.| ||||...||.|..|.|||.||        ||  ||| |||||||
Sbjct 1572  CCTGG-----AGGACTAC-TTCACGTCCACCGAGCCCCAGTACCAGCCCG--GGGAGAACCTC  1626