Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07017
• Subject: NM_173733.3
• Aligned Length: 1644
• Identities: 1404
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGCTGCTGCTGC---ACAGAGCTGTGGTCCTCAGGCTCCAACAGGCCTGCAGACTCAAGTCAATCCCCTCAAG  71
            ||||||||||.||   |||||.|.|||||..|.|||||.|.|||||||..||||.|||||||||.|||||..||
Sbjct    1  ATGCTGCTGCAGCTATACAGATCCGTGGTTGTGAGGCTTCCACAGGCCATCAGAGTCAAGTCAACCCCCTTGAG  74

Query   72  GATCTGCATTCAGGCCTGCTCCACAAATGATTCATTTCAGCCCCAGCGCCCCAGCCTCACCTTCTCTGGTGATA  145
            |.||||||||||.||.||||||||||||||||||.||.|||||||||..||||||||.|||||.||||.|||||
Sbjct   75  GCTCTGCATTCAAGCATGCTCCACAAATGATTCACTTGAGCCCCAGCATCCCAGCCTTACCTTTTCTGATGATA  148

Query  146  ACTCCAGCACCCAGGGATGGAGAGTCATGGGGACCCTATTAGGTCTCGGTGCAGTGTTGGCCTATCAGGACCAT  219
            ||||.||.||.|.|.||||||.|||||||||||||||.|||||.||.||||..|||.|||.|||.||.||.|||
Sbjct  149  ACTCAAGGACTCGGAGATGGAAAGTCATGGGGACCCTGTTAGGCCTGGGTGTGGTGCTGGTCTACCATGAGCAT  222

Query  220  CGGTGTAGGGCTGCTCAGGAGTCAACACACATATACACTAAGGAGGAAGTGAGTTCCCACACCAGCCCTGAGAC  293
            ||||||||||||.|||||||||||.|||..||.|||.||||.|||||.|||.||||.||||.||.||||.|.||
Sbjct  223  CGGTGTAGGGCTTCTCAGGAGTCACCACGGATGTACTCTAAAGAGGATGTGCGTTCTCACAACAACCCTAAAAC  296

Query  294  TGGGATCTGGGTGACTCTGGGCTCTGAGGTCTTTGATGTCACAGAATTTGTGGACCTACATCCAGGGGGGCCTT  367
            |||..|||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct  297  TGGAGTCTGGGTAACTCTAGGCTCTGAGGTCTTCGATGTCACAAAATTTGTGGACCTGCATCCAGGAGGACCAT  370

Query  368  CAAAGCTGATGCTAGCAGCTGGGGGTCCCCTAGAGCCCTTCTGGGCCCTCTATGCTGTTCACAACCAGTCCCAT  441
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct  371  CAAAACTGATGCTAGCAGCTGGAGGTCCCCTAGAACCCTTCTGGGCCCTCTATGCTGTGCACAACCAGCCCCAT  444

Query  442  GTGCGTGAGTTACTGGCTCAGTACAAGATTGGGGAGCTGAATCCTGAAGACAAGGTAG-----CCCCCACCGTG  510
            ||.||||||||||||||..||||.|||||||||||.|||||.||.|||||     |||     |||||.|||||
Sbjct  445  GTACGTGAGTTACTGGCCGAGTATAAGATTGGGGAACTGAACCCCGAAGA-----TAGCATGTCCCCCTCCGTG  513

Query  511  GAGACCTCTGACCCTTATGCTGATGATCCTGTACGTCACCCAGCCCTGAAGGTCAACAGCCAGCGGCCCTTTAA  584
            ||..||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||.|.|.||.||||||||.||||||||
Sbjct  514  GAAGCCTCTGACCCTTATGCTGATGATCCTATTCGTCATCCAGCCCTGAGGATTAATAGCCAGCGCCCCTTTAA  587

Query  585  TGCAGAGCCTCCCCCTGAGCTGCTGACAGAAAACTACATCACACCCAACCCTATCTTCTTCACCCGGAACCATC  658
            ||||||||||||.|||||.|||||.||.|||..||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  588  TGCAGAGCCTCCTCCTGAACTGCTAACTGAAGGCTACATCACACCAAATCCTATTTTCTTCACCCGTAACCATC  661

Query  659  TGCCTGTACCTAACCTGGATCCAGACACCTATCGCTTACACGTAGTAGGAGCACCTGGGGGTCAGTCACTGTCT  732
            |||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  662  TGCCTGTACCTAACCTGGACCCACACACCTATCGCTTACATGTAGTAGGGGCACCTGGAGGTCAGTCACTGTCT  735

Query  733  CTTTCCCTGGATGACTTGCACAACTTTCCCAGGTACGAGATCACAGTCACTCTGCAGTGTGCCGGCAACCGACG  806
            ||.|||.|||||||.|||||.||.|||||||...|.|||.||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  736  CTGTCCTTGGATGATTTGCATAAGTTTCCCAAACATGAGGTCACTGTCACTCTGCAGTGTGCTGGTAACCGGCG  809

Query  807  CTCTGAGATGACTCAGGTCAAAGAAGTAAAAGGTCTGGAGTGGAGAACAGGAGCCATCAGCACTGCACGCTGGG  880
            |||.||.||||.|.|||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  810  CTCCGAAATGAGTAAGGTCAAGGAAGTGAAAGGTCTGGAATGGAGAACAGGGGCCATCAGCACAGCACGCTGGG  883

Query  881  CTGGGGCACGGCTCTGTGATGTGTTAGCCCAGGCTGGCCACCAACTCTGTGAAACTGAGGCCCACGTCTGCTTT  954
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||..||||||||||.|||||.|||
Sbjct  884  CTGGGGCCCGGCTCTGTGATGTGTTAGCCCAGGCTGGTCACCGACTCTGTGACTCTGAGGCCCATGTCTGTTTT  957

Query  955  GAGGGACTGGACTCAGACCCTACTGGGACTGCCTATGGAGCATCCATCCCTCTGGCTCGGGCCATGGACCCTGA  1028
            ||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  958  GAAGGACTGGATTCAGACCCCACTGGAACTGCCTATGGAGCATCGATCCCTCTGGCTCGGGCCATGGATCCTGA  1031

Query 1029  AGCTGAGGTCCTGCTGGCATATGAGATGAATGGGCAGCCTCTGCCACGTGACCACGGCTTCCCTGTGCGTGTGG  1102
            |||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1032  AGCCGAGGTCCTCCTGGCTTATGAAATGAATGGTCAGCCTCTACCTCGTGACCATGGCTTCCCTGTACGGGTGG  1105

Query 1103  TGGTTCCTGGAGTGGTGGGTGCCCGCCATGTCAAATGGCTGGGCAGAGTGAGTGTGCAGCCAGAGGAAAGTTAC  1176
            ||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|..|||||||.|||||.
Sbjct 1106  TGGTTCCTGGTGTAGTAGGTGCCCGTCATGTCAAATGGCTCGGCAGAGTGAGTGTGGAATCAGAGGAGAGTTAT  1179

Query 1177  AGCCACTGGCAACGGCGGGATTACAAAGGCTTCTCTCCATCTGTGGACTGGGAGACTGTAGATTTTGACTCT-G  1249
            ||.||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||| || |
Sbjct 1180  AGTCACTGGCAGAGGCGGGATTACAAAGGCTTTTCTCCATCTGTGGACTGGGACACGGTAAACTTTGAC-CTAG  1252

Query 1250  CTCCATCCATTCAGGAACTTCCTGTCCAGTCCGCCATCACAGAGCCCCGGGATGGAGAGACTGTAGAATCAGGG  1323
            |||||||.|||||||||||.|||.|||||||.||.||||||.|.||.|..|||||.|..|.||||||.|||||.
Sbjct 1253  CTCCATCAATTCAGGAACTACCTATCCAGTCAGCTATCACACAACCTCAAGATGGGGCCATTGTAGAGTCAGGC  1326

Query 1324  GAGGTGACCATCAAGGGCTATGCATGGAGTGGTGGTGGCAGGGCTGTGATCCGGGTGGATGTGTCTCTGGATGG  1397
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 1327  GAGGTGACTATCAAGGGCTATGCATGGAGTGGTGGTGGCAGGGCTGTGATTCGAGTGGATGTGTCTGTGGATGG  1400

Query 1398  GGGCCTAACCTGGCAGGTGGCTAAGCTGGATGGAGAGGAACAGCGCCCCAGGAAGGCCTGGGCATGGCGTCTGT  1471
            |||.|||||||||||||..|||.||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1401  GGGACTAACCTGGCAGGAAGCTGAGCTAGAGGGAGAGGAACAGTGTCCCAGGAAGGCCTGGGCTTGGCGAATAT  1474

Query 1472  GGCAGTTGAAAGCCCCTGTGCCAGCTGGACAAAAGGAACTGAACATTGTTTGTAAGGCTGTGGATGATGGTTAC  1545
            |||||||||||||.|..|||||.||||..|||||||||.|||||||..||||.||.|||||.|||||..|||||
Sbjct 1475  GGCAGTTGAAAGCTCAGGTGCCGGCTGAGCAAAAGGAATTGAACATCATTTGCAAAGCTGTAGATGACAGTTAC  1548

Query 1546  AATGTGCAGCCAGACACCGTGGCCCCAATCTGGAACCTGCGAGGTGTTCTCAGCAATGCCTGGCATCGTGTCCA  1619
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1549  AATGTGCAGCCAGACACTGTAGCCCCAATCTGGAACCTTCGGGGCGTACTCAGCAATGCCTGGCACCGTGTCCA  1622

Query 1620  TGTCTATGTCTCCCCA  1635
            |||..|.||...||||
Sbjct 1623  TGTTCAGGTGGTCCCA  1638